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zakery 2016年5月26日,如何在phytozome中找物种同源基因并用dnaman比对序列,首先到phytozome网站上选择你要找的物种，比如水稻oryza sativa v7_jgi (rice),点击blast search,在target type中选择proteome，把氨基酸序列复制到blast框中，点go,这是结果，得分越高说明同源性越高,点击第一个前面字母g，得到如图可以看到cds sequence和peptide equence,把基因名和cds序列如图复制到记事本，把txt格式改为seq格式（直接更改扩展名）,接下来就是用dnaman分析了,选择输入序列,选择序列文件所在位置,注意输入的序列是dna或者是蛋白质序列,打勾相应的选项,然后一直点击下一步,选项不需要修改,默认就行,选项不需要修改,默认就行,选项不需要修改,默认就行,注意,由于是用了免费的版本,它会在这里加上了一段标记,手工去除它.,序列前面一般会加上created.featureslcatinqualifiers这一段标记,这是去除后的序列情况,点击这个按钮,出现下拉菜单,保持emf格式的文件即可,然后用图片查看器打开可以放大缩小而不改变像素,前面软件演示所用的序列比对后做出来的图,注意:由于前面软件自动加了约为几十个bp长度的标记,因此在所

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