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文档简介
1、Topos4.0软件 分析MOFs拓扑实例,主要内容,Topos4.0软件下载 官方网站:http:/www.topos.ssu.samara.ru/ 软件使用前检查及主要功能简介 Topos4.0分析MOFs拓扑实例,Topos4.0软件下载,可以直接在http:/www.topos.ssu.samara.ru 网站上免费注册下载。除主程序之外,网站还提供说明帮助文件以及使用教程。 为方便大家使用,网站把主程序和ttd,tto等文件集成在一起,制作成kit文件。我们只需要下载kit文件,解压即可使用。,Topos4.0软件官方网站:http:/www.topos.ssu.samara.ru/
2、,Kit文件下载,软件使用检查,主要功能简介,IsoCryst,Dirichlet,AutoCN,HSite,DiAn (Distances and Angles),IsoTest,ADS,主要功能简介,分析MOFs拓扑实例,以ZIF-8 为例,演示topos4.0软件分析MOF拓扑类型的具体流程 多核金属和簇单元处理 断键型分子筛-LTA 拓扑分析,具体流程,.cif 文件导入,生成.cmp文件; 运行“IsoCryst”,点击图标, 查看分析结构; 运行“autoCN”,点击图标, 分析配位数; 运行“ADS”,点击图标, 分析结果。,Zif-8为例分析MOFs拓扑的具体流程,双击此代码,
3、 查看ZIF-8的一些信息。,运行“IsoCryst”,运行auto CN,运行“ADS”,多核金属和簇单元处理-配位键弱化成氢键,Zhong min Su, CrystEngComm. 2012, DOI: 10.1039/c0 xx00000 x,Import .cif,IsoCryst,AutoCN,IsoCryst,ADS,Simplify adjacent matrix,ADS,断键型分子筛-LTA 拓扑分析,Hai-Xia Zhang, Jian Zhang*, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133 (31), 1188411887,Import,IsoCryst
4、,AutoCN,Simplify adjacent matrix,IsoCryst,ADS,Isocryst,ADS,Export,diamond,AutoCN,ADS,小结,Topos4.0功能强大。除分析拓扑外, 作图(isocryst); 分析tilings, 产生3dt软件的输入文件; 导出各种不同格式文件,cif文件可用于diamond作图, systre.cgd文件可用于systre 软件的输入文件;等等。 对简单的化合物,智能化程度较高,如ZIF-8,全部按照默认操作进行即可。 不具备纠错功能。 分析拓扑的目的在于简化,便于结构描述和他人的认知,单纯的new topology 没有任何意义。对同一结构,不同的人进行分析可能会得到不同的结果,没有对错之分,关键是选取节
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