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文档简介

1、,OLEX软件 使用小结,一般文件 cif, res, cry 的打开方法,mercury, OLEX, xp，wingx（ Platon)等软件,用途一 OLEX软件 进行拓扑分析,打开res文件的软件 mercury, OLEX, xp，wingx,要使整个结构进一步拓展的话， 游离的客体分子可以删去， 删减原子一定要在BS状态下。,根据a,b,c 的轴长选择合适的数字,再点Fragments按钮下拉框,选generate钮,出现如上图 勾上link changeA from 最后边一个数可以选大点(如3or 4) 也可以选上remove hydrogens-OK,再点network-co

2、nstruct net出现如上图,再点structure-hide bond出现如上图,对软件得到的初步分析进行进一步化简。,进行拓扑分析时，要注意把给出的拓扑图不必要的键删除，使简化合理。 点击Evulate Topology。,建立一个新的文本文档或者Word文档，点击右键粘贴。 得到如上图所示的文件。,对于有穿插结构拓扑图都出来了, 几重穿插呢?,再点show structure navigator(像一本摊开的书的形状的那个按钮)再看框里头atoms:之后的数字,如果数字相近且都很大的,就都选上,数字小的不要选,选上几个就说明有几重穿插),从结构里先选一个键再点fragments-pr

3、operties-出现上图;再monochromatic处选一种自己喜欢的颜色,除了原来的红色还有粉红色的了-再从没有选过的键中再选一个键,如上方法,给其选另一种颜色,从上图中可以看出有三种颜色,就知道是三重穿插了。,对原子标注的修改方法,所得文件的保存类型 （类型一软件打开模式： cry，res 等 ） （类型二图形文件： jpg，bmp等）,文件保存类型（cry，res，ins）,文件输出类型（jpg，Bmp等）,用途二 OLEX软件 画螺旋轴及通道 示意图,沿不同的轴向选择合适的片段,沿不同的轴向选择合适的片段,画图重点-添加中心记录中心原子坐标-转180,方法相同,双击添加的中心原子，进行命名。不要与文件中原子重名。,保存文件-res,把res文件用记事本打开，添加原子名称，个数，及坐标。,原子坐标添加方法如下，完毕后保存。,用OLEX打开保存的res文件,修改分子间距，使添加的两个原子连接起来,结果如下图所示，通过改变原子和键的大小，得到合适的比例,结果保存为cry和jpg格式,如何添加通道？,方法与添加螺旋轴类似,记录添加原子坐标保存为res格式,把res文件用记事本打开，添加原子名称，个数，及坐标。,为

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