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文档简介

1、外文医学数据库, PubMed,.,PubMed 一、PubMed数据库简介 二、PubMed数据范围三、PubMed主页 四、PubMed检索方法 五、检索结果的处理,.,PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统,是目前世界上查找医学文献利用率最高的网上免费数据库,一、 PubMed数据库简介,.,二、PubMed的数据范围,出版商提供的书目信息,PreMedline,OLDMEDLINE(1950-1965),MEDLINE,.,MEDLINE数据库简介,收录范围:来源于美国和世界上70多个国家和地区、50种语

2、言的7395种(截止到现在)权威生物医学及相关学科期刊,内容涉及生物医学各个领域;85%以上原文为英语,80%记录有文摘,5%免费全文。目前记录已达约2200万条,约40万篇/年 。 回溯时间:1966年至今。 记录中有indexed for MEDLIEN标记,.,学科范围: 基础生命科学临床生命科学 生物科学 解剖学 组织学化学与药物 心理学社会医学 农业 医技设备学 医技工业学 医学信息学 使用词表:MeSH(医学主题词表),.,PreMEDLINE,是一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库,这些新记录还未被或正在标引,暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新,经过标引(增加

3、主题词、文献类型、数据库存取号等字段)以后转入Medline,一旦记录被转入到Medline数据库,就被从PreMEDLINE数据库中删除。记录中有PubMed-in process的标记。,.,Pre-Medline 最新信息,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,PubMed,一周以后,.,出版商提供的书目信息(Publisher-Supplied Citation ) 出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物,记录标有Record as supplied by publishers标记。(如:Science或Nature中的地

4、质学文献等)。,.,标记不同,出自分库亦不同,Nucleotide:DNA序列数据库 Protein:蛋白质序列数据库 Genome:基因组序列数据库 Structure:分子结构模型数据库 OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库 PMC: PubMed中心,免费全文期刊检索,与NCBI其它数据库的链接,.,3.特点 获取生物医学权威期刊最多 世界上70多个国家的7395种权威期刊 多种检索方法,多条检索途径 时效性极强(每周更新) 回溯年代久远(1950年至今) 利用MeSH作为转换词表,标引质量高 部分文献可以免费获取全文 检全率、检准率高,PubMed简介,三、PubMed主页,免费进入P

5、ubMed途径: /PubMed /sites/entrez,.,主页结构,.,.,四、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,.,(一)基本检索,PUBMED提供了词汇自动转换功能: MeSH转换表 期刊转换表 短语表 作者姓名索引 逻辑运算符检索,.,.,检索运算符,(1)逻辑运算符: OR、AND、NOT 运算顺序:ORANDNOT,可用()改变检索词的处理顺序。 (2)截词符:*。eg: cell*:c

6、ell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词的文献。 (3)利用字段标识符进行限定检索: 检索式格式:检索词A字段标识B,检索在字段中含有检索词A的文献。 如: hepatitisTI,smith AU,cellTA。 (4)“ ”,将短语做为不可分割的整体进行检索。 如:“OXYGEN FREE RADICALS ” 注意:AND 必须大写、 和“ ”必须为英文或中文半角。,.,Pubmed简单检索实例例一 查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献,英文 “liver cancer ” 和 “hepatitis”,.,检索结果显示,.,题录格式内容(几个字

7、段?),.,作者限定字段检索,例二查找作者 Hemila h著作的文献,在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后, 例:著者“Henry Hemila”应转换成 “ Hemila h”,后加著者字段限定来检索, 注意:姓在前,名在后 姓全称,名缩写,.,四、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,.,.,.,检索框,检索史,限定检索,30个字段,.,Limits (限定) Publication Types:有7种类型 Languages:提供常用的7种语种 Ages:共有13个年龄段 Gender:男性、女性 Human or Animal Subse

8、ts(子集):11个主要子集 Dates:可检索1965年至今的文献,.,限定检索,索引检索,.,PubMed高级检索实例 例: 查找关于“锌对于2岁婴儿(即出生至23个月)成长的作用”(要求时间20002008)的英文文献 步骤一,确定关键词Zinc Infant Growth,把它们输入检索框。,.,步骤二,限定时间。点击 。在其中的Publication Date的输入框内输入FROM2000 TO2008 . 步骤三,限定语种。在Languages下拉菜单内选择English。,.,四、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,.,主题检索,.,M

9、eSH Database: 例1:从主题途径查找FK506副作用 例2:从主题途径查找肾移植的文献 例3:从主题途径查找阿司匹林治疗高血压的文献,.,检索流程 第一步:主题分析 英文转换 FK506 adverse effects kidney transplantation 点击MeSH Database Mesh界面 输入检索词 Go,.,.,.,第二步: 选定该主题词 主题词轮排表 点击该主题词 主题词细节屏,.,主题词轮排,提示相关词,主题词轮排表,.,第三步: 主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构) 选择合适的副主题词 选择加权或不扩展 se

10、nd to,.,主题词细节屏,主题词词义注释,主题词细节屏,副主题词选择,主题词词义注释,加权检索,不扩展检索,.,曾用词,药理作用,树状结构,曾用词,入口词,树状结构,药理作用,.,选择发送方式 Search Box with AND Search Box with OR Search Box with NOT,.,第四步: search box 点击 search PubMed 检索结果,.,search box,.,题录格式界面,.,.,.,例:检索利用阿司匹林治疗高血压的文献。 分析:本课题包含两个主题词,即阿司匹林(aspirin)和高血压(hypertension),阿司匹林(as

11、pirin) 组配副主题词治疗应用(theraputic use),高血压应组配副主题词药物疗法(drug therapy),两条检索式之间用and联接。,.,Pubmed主题词检索的功能: (1)理解词义和收入词表的时间 (2)限定副主题词 ,提高查准率。 (3)加权检索,提高查准率。 (4)了解树形结构,扩展检索,提高查全率 (5)了解同义词,提高查全率。,.,四、PubMed的检索途径和方法 基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索,.,.,Journal Database (期刊数据库) 可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号(ISSN)检索特定期刊的编目信息;,.,检索: Pu

12、bMed中收录关于高血压(hypertension)的期刊有哪些?,.,引文匹配器,.,引文匹配器(Single Citation Matcher) nursing,2008,38(12):61,.,PubMed 一、PubMed数据库简介 二、PubMed数据范围三、PubMed主页 四、PubMed检索方法 五、检索结果的处理,.,四、检索结果处理,1、检索结果的显示与标记 2、检索结果的保存及定购,.,检索结果显示 默认为题录格式 每页显示20条记录,结果显示格式,每页显示记录数,结果排序方式,.,纯文本方式显示,.,纯文本显示记录,.,文摘显示格式,.,MEDLINE格式,.,可链接到SpringerLink数据库 获取全文 ,但是是收费的,可链接到PubMed中心获取免费全文,全文链接

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