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文档简介
1、microRNA的引物设计以ssc-miR-222-3p为例设计引物,其成熟体序列为: AGCTACATCTGGCTACTGGGTCT反向引物:每个反向引物的都带有一段固定的序列,可以形成一个茎环, 固定的序列为:5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG-3,在这个序列后加上八个碱基,这八个碱基是ssc-miR-222-3p从后面数八个碱基的反向互补序列,就是CTGGGTCT 的反向互补:AGACCCAG ,最后得到的反向引物的序列为5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG AGACCCAG -3,正向引物:每个正向引
2、物也带有一段固定的序列,固定的序列为:ACACTCCAGCTGGG在这个序列后加上于成熟体除后面六个外剩下的碱基序列,成熟体除掉后面六个碱基后序列为:AGCTACATCTGGCTACT5,-ACACTCCAGCTGGG AGCTACATCTGGCTACT -3,URP:统一反向引物,也是一段固定的序列,TGGTGTCGTGGAGTCGU6引物F-CTCGCTTCGGCAGCACA ,R-AACGCTTCACGAATTTGCGT使用方法:1逆转的引物:所有要做的miRNA反向引物的混合,每个10微升2PCR的引物:50微升的体系,30微升的水,10微升的正向引物,10微升的URP2hsa-miR
3、-124(hsmq-0032 引物)推荐退火温度:60hsa-miR-124 扩增曲线示意图 hsa-miR-124 融解曲线示意图3hsa-miR-125b(hsmq-0034 引物)推荐退火温度:60hsa-miR-125b 扩增曲线示意图 hsa-miR-125b 融解曲线示意图4hsa-miR-137(hsmq-0035 引物)推荐退火温度:60hsa-miR-137 扩增曲线示意图 hsa-miR-137 融解曲线示意图5hsnRNA U6 引物测试推荐退火温度:60hsnRNA U6 扩增曲线示意图 hsnRNA U6 融解曲线示意图6. 电泳结果取5l PCR 产物进行电泳,胶浓度(3),所有检测都为两个阳性,一个NTC其中泳道1 为hsa-miR-16、泳道2 为hsa-miR-124、泳道
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