生物蛋白质分子芯片的制造.ppt

1、生物蛋白质分子芯片的制造,作 者：检索神通 小组成员：陈 旭 20081753 马 俊 20081749 李 盈 20081933 杨 烁 20081924 指导教师：高凡,1 分析课题,由于我们小组成员是首次接触这方面的课题，因此在进行课题分析时首先利用百度、Google这两个搜索引擎搜索生物蛋白质分子芯片制造的一些的基本知识。在百度中我们检索到一篇名为生物芯片及其应用 的文章对我们理解课题非常有帮助。如下图：,本课题以生物蛋白质分子芯片的制造方法为研究对象，学科分类主要属于“生物工程学（生物技术）”领域，是生物传感技术的一个研究方向。根据中国图书馆图书分类法的类目设置，涉及“蛋白质工程”和

2、“生物工程应用”其分类号分别为Q816、Q819；课题提示时间范围是查找最近10年的文献。主要属于文献类检索，文献类型主要涉及图书、期刊、学位论文、专利、报纸等文献类型。先查中文，后查外文。,2 选择检索工具,（1）中文检索工具 维普中文科技期刊数据库 CNKI中国期刊全文数据库 CNKI中国博士学位论文全文数据库 CNKI中国重要会议论文全文数据库 万方数据资源系统 超星电子图书 中国国家知识产权局的专利数据库 搜索引擎：Baidu、Google等, SDOS ARL ProQuest博硕士论文全文数据库 EBSCOhost 美国专利商标局和欧洲专利局 Google学术搜索,选择检索工具,（

3、2）外文检索工具：,选择原则一般是先用中文，后用外文数据库。先用期刊数据库，后用图书、学位论文、专利数据库，最后用其他特种文献数据库或者搜索引擎。就本题而言，首选的检索工具是维普中文科技期刊数据库，是收录全国1989年以来各类科技期刊最全、更新速度最快的中文期刊全文数据库，正合本题使用，而期刊文献具有连续性与新颖的特点，是最重要的信息源之一。,选择检索工具,3 确定检索途径,本课题可选用主题（关键词）途径为主，结合分类途径。,4 拟定检索词,根据研究内容拟定首选检索词为： （1）蛋白质芯片或微阵列芯片（protein chip或protein microarray） （2）制造（make或Ma

4、nufacture） 扩展检索词为： （1）生物芯片（biochip或biological chip） （2）制备或设计（preparation或development）,5 实施检索,（1）维普中文科技期刊数据库 命中0篇,扩展检索，命中10篇,实施检索,（2）CNKI中国期刊全文数据库 命中19篇,实施检索,（3）CNKI中国博士学位论文全文数据库 命中28篇,（4）CNKI中国重要会议论文全文数据库命中1条,实施检索,实施检索,（5）万方数据资源系统 命中66篇,（6）超星电子图书命中0条,实施检索,扩展检索命中5条,实施检索,实施检索,（7）中国国家知识产权局的专利数据库 命中5条,实

5、施检索,（8）百度,实施检索,（9）Google 学术搜索（中文）,实施检索,（10）Elsevier SDOL(ScienceDirect Online),实施检索,（11）ARL,实施检索,（12）ProQuest博硕士论文全文数据库,实施检索,（13）EBSCOhost,美国专利商标局,欧洲专利局,由于校园网网速太慢，无法打开欧洲专利局主页，因而未进行检索。,（14）Google学术搜索（英文）,实施检索,实施检索,（15）Scirus,6 获取原文,（1）维普中文科技期刊数据库,获取全文,（2）CNKI中国期刊全文数据库 ,获取全文,（3）CNKI中国博士学位论文全文数据库 ,获取全文

6、,（4）CNKI中国重要会议论文全文数据库 ,获取全文,（5）万方数据资源系统 ,获取全文,（6）超星数字图书馆,获取全文,（7）中国国家知识产权局的专利数据库,获取全文,（8）百度,获取全文,（9）Google 学术搜索（中文）,获取全文,（10）Elsevier SDOL(ScienceDirect Online),（11）ARL,（12）ProQuest,获取全文,（13）EBSCOhost,（14）美国专利商标局,（16）Google学术搜索（英文）,7 检索结果分析,中英文文献数量年变化趋势图,通过对各个检索工具的检索结果进行去重等处理，最后得到相关文献86篇，其中中文14篇，英文7

7、2篇。文献的年分布如下图所示：,从上图中我们可以看出对蛋白质生物芯片的研究呈逐年递增的趋势。 2007年前后出现峰值。 2007年后有略微上升的趋势，表明可能对生物芯片的研究出现了新的热点领域。 4 中文文献的数量远远少于英文文献的数量，这表明我国对蛋白质芯片制造方法的研究远远落后于国外，还有较大的研究空间。,分析,分析后得出的蛋白质芯片的制造方法：,蛋白质芯片是一种新型的生物芯片，是由固定于不同种类支持介质上的抗原或抗体微阵列组成，阵列中固定分子的位置及组成是以知的，用标记（荧光物质、酶或化学发光物质等标记）的抗体或抗原与芯片上的探针进行反应，然后通过特定的扫描装置进行检测，结果由计算机分析

8、处理。,分析,方法一：噬菌体抗体库技术,噬菌体抗体库技术就是典型的代表，它可以同时有效的处理大量的分子，而且抗体分子可以不经过动物的阴性选择，能从任一种属获得少有的抗体专一性和提高亲和力。最近deWildt等用scFv抗体制作微阵列，阵列化的抗体在数周乃至数月后保持稳定。也可用其他的蛋白质文库制作探阵蛋白，如全合成人重组抗体库、噬菌体肽库、噬菌体表达文库等。,分析,本方法的特征在于：首先采用标准的半导体工艺清洗和热氧化硅片；然后使用十八烷基三氯硅烷处理硅表面，再采用原子力显微镜(AFM)纳米刻蚀技术在硅片表面刻蚀纳米图形；之后用-氨基-丙基-三乙基硅烷处理硅表面，最后将加工好的纳米图形位置的硅片浸入蛋白质溶液，使蛋白质分子固定在非刻蚀图形位置的硅片表面上，而刻蚀过的硅片表面没有蛋白质分子。本方法的优点是能有效地保证蛋白质分子的活性，提高结合的牢固程度，且具有超高蛋白质分子集成度。,分析,方法二：刻蚀技术,分析,方法三：纳米生物技术与无细胞表达系统,方法四：亲和层析结合制备凝胶电泳技术,采用亲和层析结合制备胶电泳的方法，对16种用于构建蛋白质芯片的食管癌相关抗原基因进行克隆重组并在大肠杆菌中进行表达。对高表达的重组蛋白首先制备包涵体，然后采用Ni