医学信息的获取-08.ppt

1、1,医学信息的获取、利用,广义的信息指的是客观世界中各种事物的存在方式和它们的运动状态的反映。 通俗讲，信息就是客观世界一切事物存在和运动所能发出的各种信号和消息。 狭义的信息指的是能反映事物存在和运动差异的、能为某种目的带来有用的、可以被理解或被接受的消息、情况等。Information 一词理解为狭义的信息时，常被译为情报。,2,信息无所不在，可以感知，但它不是事件和物质本身，信息是客观事物的存在方式或运动状态，以及关于客观事物存在方式或运动状态的陈述。 信息是原料，经过人类的认识活动， 成为已知的知识。,3,第一节 概述 一、掌握信息检索技术的意义 1 提高科研起点，减少重复劳动 2 节

2、约时间，提高效率 3 减少语言障碍，扩大文献检索范围 无论什么语言，如果公开发表，均有英文摘要 二、信息（information）与知识（knowledge） 信息、物质和能量构成了现代社会的三大资源。 物质资源：提供各种各样的材料； 能量资源：提供形形色色的动力； 信息资源：提供浩如烟海的知识；,4,信息是知识的来源。信息资源形式： 1 纸质文献型信息：手稿、原始记录、病历档案等。 2 电子数字型信息：通过计算机阅读的，数字化形式 存储在介质上的信息及网络信息。 3 视听型信息：照片、电影拷贝等 4 缩微型信息： 5 实物型信息：样品、样机等 6 传播性信息：口头交流、传闻等 7 主体性信息

3、：以教育为手段形成的个人知识或技能,5,三、信息检索的类型 1 数据检索：指数值性数据（人口数据）和 符号组成的代码（化学分子结构图）。 2 事实检索：指能提供各种事实的直接信息 的检索，如癌症类型标准、诊断和治疗标 准等。 3 文献检索：文献的标题、文摘、作者、分 类号、主题词或关键词、文献出处，甚至 是文献全文存储在计算机中，形成的信息 资料。,6,四、文献的来源和种类 （一）科学文献：图书、期刊、科技报告、政府出版物、学位论文、专利文献、标准文献； （二）学术会议； （三）个人交流； （四）国际互联网：MEDLINE、SCI收录检索等。,7,五、文献的级别 （1） 一次文献（情报源）：期

4、刊论文（论著、论 著摘要、经验交流、病例报道、实验方法 等）、科技报告、学位论文、专利说明书、 会议论文。 （2） 二次文献（检索工具）：对一次文献加工整 理而成。各种目录、题录、索引、文摘。 （3） 三次文献：在利用二次文献的基础上，对一 次文献进行筛选、综合而成。如评论、手 册、综述、教科书等。,8,六、文献的特点 （1） 数量庞大，增长迅速； （2） 文种增多； （3） 载体多样化； （4） 内容既重复又分散； （5） 质量下降，寿命缩短； （6） 交流传播速度加快；,9,七、文献检索的方法 顺查法、逆查法、追溯法（综述法）、分段法 八、文献检索的手段 手工检索、计算机检索 九、文献检索

5、的途径 分类途径、主题途径、关键词途径、著者 十、文献检索的步骤 （1）分析研究课题，明确要求； （2）确定检索标志； （3）选择检索手段； （4）选择检索方法和途径； （5）查找和索取原文；,10,第二节 文献信息的组织及常用检索工具的使用,一、文献信息检索语言 （一）描述文献外表特征的检索语言 1. 文献题名索引系统：以书名、刊名等为标示的字顺序索引系统，如书名、刊名目录。 2. 著者索引系统：以文献署名作为标示的字顺序索引系统，如著者目录、专利人索引等。 3. 文献序号索引系统：以文献的特有序号为标示的索引系统，如专利号索引，技术标准号索引等。 4. 引文索引系统：以科学文献所附参考文献

6、为特征的索引系统，如美国SCI、中国科学引文索引。,11,（二）按构成原理描述文献内容特征的检索语言 1. 分类检索语言：常用的为等级体系分类系统，如中图法、国际十进制分类法（UDC）。 2.代码检索语言：如美国化学文摘中的化合物分子式索引系统。,12,（二）按构成原理描述文献内容特征的检索语言分类 3.主题检索语言：主题词法和关键词法 主题词法（subject headings）或叙词法（discriptor）：所采用的词语较严格、规范，常用的是美国国立医学图书馆（NLM）医学主题词表（medical subject headings，MeSH）； 主题词常与副主题词联合使用，以提高检索效率

7、。 关键词法（keyword index）也称主题索引（subject index）,13,主题词（标题词）：指表现文献内容特征，经过规范化的名词术语（包括词组或短语）。 副主题词：主题词表示“事物”，副主题词表示事物的“方面”，是主题词的补充和限定。主、副主题词相结合可提高检索的专指度。 关键词：指那些出现在文献题目、摘要及正文部分，对表现文献主题内容具有实质意义的语词，一般没有规范化处理，多为科技人员习惯使用且易接受的自然语言。有些文摘也将关键词作了必要整理和规范。,14,主题词与关键词的区别,主题词与关键词最大的区别就是主题词经过了规范化处理。 主题词是规范化的检索语言，它对文献中出现的

8、同义词、近义词、多义词以及同一概念的不同书写形式等进行严格的控制和规范，使每个主题词都含义明确，以便准确检索，防止误检、漏检。如：白介素2、白细胞介素2、IL2、IL-2等表达同一概念的不同书写形式规范为“白细胞介素2”。 关键词是属于自然语言的范畴，未经规范化处理，也不受主题词表的控制。如：对于“白细胞介素2”这一概念可有白介素2、白细胞介素2、IL2、IL-2等不同形式来表达。,15,主题词与关键词的区别,例如：利用MEDLINE光盘数据库检索有关“肝肿瘤”方面的文献。 MEDLINE光盘数据库既提供了主题词途径，也提供了自由词（关键词）途径。如果选择关键词途径来进行检索，欲达到较高的查准

9、率和查全率，就得查找“liver cancer”、“liver carcinoma”、“liver neoplasm”、“liver tumor”、“hepatic cancer”、“hepatic carcinoma”、“hepatic neoplasm”、“hepatic tumor”等词，另外还得考虑像cancer、carcinoma、neoplasm、tumor等词还有复数形式；而如果选择主题词途径进行检索就只需查找“liver neoplasms”一词就行了，这一词就包括了以上所提及的不同的表达形式。 由此可见，选用主题词途径检索，既能满足较高的查准率、查全率，又能提高检索速度,16

10、,二、图书馆藏书的利用 图书馆的现刊、过刊基本上都是按刊名顺序排列，中文期刊按刊名的汉语拼音或笔画笔形排列，外文期刊一般按各文种的刊名在顺序排列。 中外文图书通常是按学科分类，依据是图书分类法；,17,中图法有22个基本大类，其中“R医药、卫生”类又下分17个二级类目,18,三、参考工具书的使用 （一）参考工具书的排检方法 1 字顺排检法：部首法、笔画法、号码法、标音法、英文 以字母顺序。 2 内容类序法：如中国医学百科全书按社会医学与卫 生管理学、医学统计学、儿少卫生学、流行病学等编排。 （二）参考工具书的类型 词（辞）典、字典、百科全书、年鉴、手册、图录表谱及名录等。 四、特种文献检索 科

11、技报告检索、专利文献检索、技术标准检索、会议文献检索、学位论文检索、政策性信息及统计资料等的检索。,19,第三节 光盘数据库检索,一、MEDLINE 光盘数据库检索 （一）检索途径与方式 1. Search检索 （1）基本检索 一个单词或词组，如：kidney或gastrointestinal infection； 用逗号隔开的多个词，如：stomach，kidney，liver； 用连号“-”连接的短语或词组，如：kidney-shaped； 带通配符“ * ” “ ？”的词，如：kionecto*或kidole？y； 检索史的序号，如#11； 带布尔运算符及位置运算符的表达式，如pig a

12、nd dog，Francis in au； 主题词与副主题词的组合表达式，如cancer/etiology； 人工限定表达式，如human in TI；(TI、AB、AD、AU、SO、MeSH),20,（2）Suggest 检索 当一般检索不能满足需要时可使用Suggest检索。在此方式检索时，输入检索词gastric后，系统自动打开一个窗口，该窗口提供一组主题词，并建议出一个最相关的词进行检索，选词结束后，点击“Search”按扭，系统自动提供副主题词，检索者根据需要点击一个或多个副主题词后，点击“OK”即可。 （3）Limit检索 在Search检索状态下，输入检索词后，点击“Limit”

13、按扭，对检索词进行：出版年限、出版国家、语种、出版类型等的限定，然后点击“OK”即可。 （4）横向检索（Lateral Searching） 检索者在浏览已检索出的文献记录时，如果发现一些同义词或相关术语，可将该词标记，并点击记录显示区下方的“Add to Search”按扭，该词自动显示在检索区，然后再点击“Search”即可。,21,2. Index检索（索引词表检索） 在Search状态下，输入检索词，点击“Index”按扭，系统自动提供一些组合词，再按住“Ctrl”键，同时标记多个索引作为检索式，检索时，系统会自动将这些索引以“OR”连接并输出检索结果。 3. Thesaurus 检索

14、(MeSH词检索)是查准率最高的一种检索 点击“Thesaurus”，在其右测空白栏输入检索主题词，点击“Look up”按扭，亮光带出现在相关词表中该词的位置，检索者（1）可以根据需要调整主题词，点击Search Options栏内的“Single Term”（执行单一主题词检索）；再点击“Search Now”按扭，系统弹开副主题词选项对话窗，选择副主题词后，点击“OK”即可。 （2）可不调整主题词，点击Search Options栏内的“explode”（执行扩展主题词检索）；,22,二、中国生物医学文献数据库光盘数据库检索 （Chinese Biomedical Disc,CBMDis

15、c） (一)检索途径与检索方法 1. 基本检索 （1）选择检索字段“关键词”； （2）输入关键词，如：肿瘤，检索式为“TW=肿瘤”； （3）点击“检索”按扭，检索策略显示为：#1 787 TW=肿瘤； （4）点击“显示”按扭，即可显示787篇文献的全部信息。 2. 高级检索 使用布尔逻辑运算符和限定运算符进行检索。 3. 主题词检索 （1）点击“主题词”按扭； （2）输入提问词； （3）点击“检索”按扭，显示主题词表的局部； （4）选择规范主题词，即可将该主题词或其全部下位词的文献检出来。 4. 分类检索；5. 期刊检索；,23,（二）提高检索的查全率和查准率 1 提高查全率 （1）多采用主题

16、词与关键词相结合的检索； （2）多用同义词进行“OR”运算检索； （3）主题词检索中多用扩展检索，最后使用全部副 主题词； 2 提高查准率 （1）主题词组配副主题词进行检索； （2）字段限定检索； （3）用AND或AND NOT限定检索； （4）用出版年月、期刊名称、文献类型等限定检索；,24,三、中国学术期刊全文数据库的检索 （一）初级检索 1. 在检索界面选择检索字段，输入检索词； 2. 选择检索的年份； 3. 选择检出文献排序方式：不排序、按相关程度排序及按更新日期排序； 4. 在“总目录-医药卫生专集”下的分目录中选择想要检索的学科范围后，点击“检索”按扭即可； （二）高级检索 1 在

17、“总目录”中选择检索范围； 2 可以指定多个检索字段，每个字段可以分别指定相应的检索词，并通过逻辑运算符将表达式相连； 3 指定检索年限； 4 指定检索结果的排序方式； 5 点击“检索”按扭，系统会在右边显示出符合要求的所有文献的篇名； 6 浏览检索出的篇名，点击满意的文献，将显示出相应文献的文献题录； 7 如果想阅读全文，点击题录中的“原文”连接即可；,25,四、BA on CD数据库（生物学文摘） 五、CA on CD 数据库（化学文摘） 六、EI数据库（工程索引） 七、SCI数据库（Science Citation Index- Compact Disc Edition） 八、中国科学引

18、文数据库（Chinese Science Citation Database,CSCD）,26,第四节 网上医学信息的获取,一、PubMed 检索 （一）检索功能 1. 组配检索：如，Yao K AND cancer ; 2.提问词的自动转换：当用户输入的检索词后，系统会自动在 主题词表、期刊名表、短语一览表及作者索引中查询与该检 索词相匹配的形式； 3.著者姓名的自动截词检索； 4.限制条件检索：可以限定字段、文献类型、文种等； 5.预检索：点击“Previews/Index”按扭，只显示命中文献的篇数 而不直接显示检出的文献记录；,27,（二）检索结果中相关资料的获取 1. 联机获取论文全

19、文：在检索结果界面点击“Display” 按扭，选择“Abstract”、 “ Citation”、 “ Linkout” 来获取其相关超链，并由此联机获取全文； 2. 通过点击“Order”按扭，向NLM索取论文原文； 3. 通过“Linkout”格式获取与记录相关的其它资源； 4. 获取其它数据库相关信息：在“Display”菜单中的 “Protein Links”、”Nucleotide Links”格式中获取相 关信息； 5. 通过每条记录的“Related Article”超链，扩大检索 范围，获取与所选记录相关的文献；,28,第四节 网上医学信息的获取,29,二、其他主要医学网站及

20、综合网站 1. Medical World Search 2. Medical Matrix 3. HealthAtoZ 4. MedSite 5. MedExplorer 6. Med Engine 7. HealthGate 8. 万方数据（）,30,31,32,三、医学多媒体信息 （一）虚拟医院（Virtual Hospital） /（提供各类医学图书） （二）可视人计划（The Visible Human Project） /extramural-research.dir/visible-human.html（提供不同部位和层面的图象资料） （三）全脑图谱（The Whole Brain Atlas） /AANLIB/home.html（提供正常或脑部疾患的核磁、CT等不同断层的图象资料，包括正常脑、脑血管疾病、肿瘤、变性病变、炎症及感染性疾病。） 四、远程医学,33,五、检索核心期刊 （一）国际期刊 S