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文档简介

1、第二章 核酸结构与功能,核酸的概念和重要性,核酸的组成成分,DNA的结构,DNA和基因组及基因组学,RNA的结构和功能,核酸的性质,核酸的序列测定,核酸的生物学功能和实践意义,一、核酸的概念和重要性,1869年Miescher从细胞核中分离出核素(nuclein)。,1889年Altman制备了核酸(nucleic acid)。,193040年,Kossel (5,368 碱基对)完全测序,成为第一个测定的基因组。,1995年,嗜血流感菌(Haemophilus influenzae,1.8Mb)测序完成,是第一个测定的自由生活物种。从这时起,基因组测序工作迅速展开。 2001年,人类基因组计

2、划公布了人类基因组草图,为基因组学研究揭开新的一页。 基因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的精确结构、相互关系及表达调控的科学。,五、RNA的结构与功能,RNA分子是含短的不完全的螺旋区的多核苷酸链。,(一)tRNA,tRNA约占RNA总量的15%,主要作用是转运氨基酸用于合成蛋白质。,tRNA分子量为4S,1965年Holley 测定AlatRNA一级结构,提出三叶草二级结构模型。,主要特征:1.四臂四环;2.氨基酸臂3端有CCAOH的共有结构;3.D环上有二氢尿嘧啶(D);4.反密码环上的反密码子与mRNA相互作用;5.可变环上的核苷酸数目可以变动;6.TC环含有T和;7.含有修饰碱

3、基和不变核苷酸。,(二)rRNA,占细胞RNA总量的80%,与蛋白质(40%)共同组成核糖体。,(三)mRNA与hnRNA,mRNA约占细胞RNA总量的35%,是蛋白质合成的模板。,真核生物mRNA的前体在核内合成,包括整个基因的内含子和外显子的转录产物,形成分子大小极不均匀的hnRNA。,(四)snRNA和asRNA,snRNA主要存于细胞核中,占细胞RNA总量的0.11%,与蛋白质以RNP(核糖核酸蛋白)的形式存在,在hnRNA和rRNA的加工、细胞分裂和分化、协助细胞内物质运输、构成染色质等方面有重要作用。,asRNA可通过互补序列与特定的mRNA结合,抑制mRNA的翻译,还可抑制DNA

4、的复制和转录。,(五)RNA的其它功能,1981年,Cech发现RNA的催化活性,提出核酶(ribozyme)。,大部分核酶参加RNA的加工和成熟,也有催化C-N键的合成。23SrRNA具肽酰转移酶活性。,RNA在DNA复制、转录、翻译中均有一定的调控作用,与某些物质的运输与定位有关。,六、核酸的性质,(一)一般理化性质,1.为两性电解质,通常表现为酸性。,2.DNA为白色纤维状固体,RNA为白色粉末,不溶于有机溶剂。,3.DNA溶液的粘度极高,而RNA溶液要小得多。,4.RNA能在室温条件下被稀碱水解而DNA对碱稳定。,5.利用核糖和脱氧核糖不同的显色反应鉴定DNA与RNA。,(二)核酸的紫

5、外吸收性质,核酸的碱基具有共扼双键,因而有紫外吸收性质,吸收峰在260nm(蛋白质的紫外吸收峰在280nm)。,核酸的光吸收值比各核苷酸光吸收值的和少3040%,当核酸变性或降解时光吸收值显著增加(增色效应),但核酸复性后,光吸收值又回复到原有水平(减色效应)。,(三)核酸结构的稳定性,1.碱基对间的氢键;2.碱基堆积力;3.环境中的正离子。,(四)核酸的的变性,:双螺旋区氢键断裂,空间结构破坏,形成单链无规线团状,只涉及次级键的破坏。,DNA变性是个突变过程,类似结晶的熔解。将紫外吸收的增加量达到最大增量一半时的温度称熔解温度(melting temperature, Tm)。,Tm,Tm,

6、影响Tm的因素:,(1)G-C的相对含量 (G+C)% =(Tm 69.3) 2.44,(2)介质离子强度低,Tm低。,(3)高pH下碱基广泛去质子而丧失形成氢键的能力。,(4)变性剂如甲酰胺、尿素、甲醛等破坏氢键,妨碍碱基堆积,使Tm下降。,(五)核酸的复性(退火),:变性核酸的互补链在适当条件下重新缔合成双螺旋的过程。,影响复性速度的因素:,(1)单链片段浓度,(2)单链片段的大小,(3)片段内重复序列的多少,(4)溶液离子强度的大小,(5)溶液温度的高低 (T 25),(六)分子杂交,:在退火条件下,不同来源的DNA互补区形成氢键,或DNA单链和RNA链的互补区形成DNA-RNA杂合双链

7、的过程。,探针:用放射性同位素或荧光标记的DNA或RNA片段。,原位杂交技术:直接用探针与菌落或组织细胞中的核酸杂交,未改变核酸所在的位置。,点杂交:将核酸直接点在膜上,再与核酸杂交。,Southern印迹法:将电泳分离后的DNA片段从凝胶转移到硝酸纤维素膜上,再进行杂交。,Northern印迹法:将电泳分离后的RNA吸印到纤维素膜上再进行分子杂交。,七、核酸的序列测定,目前多采用Sanger的酶法和Gilbert的化学法,|,八、核酸的生物学功能和实践意义,核酸是基本遗传物质,在蛋白质的生物合成上又占有重要位置,因而在个体的生长、生殖、遗传、变异和转化等一系列生命现象中起决定性作用。,(一)

8、核酸与遗传信息的传递,DNA是基本遗传物质 有了一定结构的DNA,才能产生一定结构的蛋白质,由一定结构的蛋白质才有一定形态和生理特征,所以根据DNA的特定遗传密码产生的蛋白质就代表特定生物的遗传性。在遗传过程中DNA的具体作用:(1)在细胞分裂时按照自己的结构精确复制传给后代;(2)作为模板将所贮遗传信息传给mRNA。,RNA在传递遗传信息上的作用 mRNA是蛋白质合成的模板;tRNA识别mRNA上的遗传密码,转运特定氨基酸到核糖体上合成肽链;rRNA是核糖体的主要成分,是翻译工作的场所。,(二)核酸与蛋白质的生物合成,DNA转录为mRNA是有选择的,tRNA和rRNA也是DNA的转录产物。,

9、(三)核酸结构改变与生物变异,一切生物的变异和进化都可以说是由于DNA的结构改变而引起蛋白质改变的结果。,生物遗传的变异起源于DNA碱基配对的改变,有的由于DNA碱基的颠倒(如TA被颠倒为AT)或被调换(如GC被换为TA);有的由于在DNA复制过程中被遗漏了一对或多了一对核苷酸,或者在转译时发生了差误,如氨酰tRNA合成酶错将一个结构与正常氨基酸十分相似的物质交给tRNA。还有一些生物的遗传性状发生了突变。,(四)DNA与细菌转化,一种细菌的遗传性状因吸收了另一种细菌的DNA而发生改变的现象,称为细菌的转化。,(五)核酸与病变,遗传性疾病是由于遗传缺陷而产生的,也就是DNA结构改变的结果。镰刀

10、型红细胞贫血和白化病(albinism)。,病毒对活细胞的侵染是寄主发生疾病,主要是由于核酸的的作用。流感、肝炎、带状疱疹、脊髓灰质炎、白血病、烟草斑纹病。,(六)遗传工程,遗传工程是用人工方法改组DNA,从而培育新型生物品种的技术。,实验室中将细菌作材料研究遗传工程过程可分为:(1)重组DNA分子(基因重组);(2)将重组DNA引入受体细胞(转化或转导)。,有利:(1)有可能培育出高产抗病、耐旱、耐寒、耐盐碱的优良性能的动植物新品种;(2)改良微生物品种使产生人工难以制得的生物活性物质如胰岛素、干扰素等;(3)解决某些疾病病因和控制这些疾病。,不利:引起某些疾病的广泛流行和使某些细菌失去对抗

11、菌素的敏感性,或者使某些酶或激素失去应有的生物活性等。,(七)克隆与克隆化,由单一亲代细胞用无性繁殖产生的子代细胞称克隆,形成克隆的过程称克隆化。,提要,本章主要介绍核酸的化学本质、结构和功能。总的要求是: 1.了解核酸的化学本质及DNA和RNA在组分、结构和功能上的差异。 2.弄清嘌呤、嘧啶、核苷、核苷酸和核酸在分子结构上的关系。 3.了解核酸的结构和它们的性质、功能的相互关系。 认识核酸在生物科学上的重要性及其实践意义。,注意:(1)核苷酸是核酸的基本组成单位,应以腺苷酸和胞苷酸为代表,彻底弄清核苷酸的化学结构和化学性质。结合有机化学把嘌呤和嘧啶的基本结构搞清楚,同时把核酸中存在的A、T、

12、U、C、G的结构记熟。(2)注意嘌呤、嘧啶同核糖在哪个部位连接成核苷,核苷如何同磷酸连接成核苷酸,核苷酸又如何连接成一级结构的核苷酸链。要特别注意核酸的二、三级结构中碱基的配对规律。(3)从分析比较核酸分子的组成和结构上的特点,进而联系它们的性质和生物功能。,主要特征:1.四臂四环;2.氨基酸臂3端有CCAOH的共有结构;3.D环上有二氢尿嘧啶(D);4.反密码环上的反密码子与mRNA相互作用;5.可变环上的核苷酸数目可以变动;6.TC环含有T和;7.含有修饰碱基和不变核苷酸。,模板,引物,GGC,GGCC,GGCCATC,C,ddCTP,GGCCA,GGCCATCGTTGA,ddATP,A,

13、GGCCATCG,GGCCATCGTTG,G,ddGTP,GGCCAT,GGCCATCGT,GGCCATCGTT,T,ddTTP,核酸的种类、分布、功能,种类,脱氧核糖核酸(DNA):是主要的遗传物质。,核糖核酸(RNA),tRNA (15%),mRNA (3-5%),rRNA (80%),其它RNA:如反义RNA等,所有生物细胞都含有DNA和RNA这两类核酸,而病毒只含DNA或RNA。 真核生物染色体DNA是线型双链DNA。原核生物的染色体DNA、质粒DNA和真核生物的细胞器DNA都是环状双链DNA。 细胞RNA通常都是线型单链,但病毒RNA则有线型与环状、双链与单链之分。,分布,DNA,原

14、核生物,真核生物,拟核,质粒,染色体(质),细胞器:如线粒体、叶绿体等,RNA:核内(snRNA、hnRNA)、胞质(scRNA)、细胞器,质粒DNA为cccDNA。类病毒为环状ssRNA。 卫星病毒或卫星RNA是指没有辅助性病毒协助时,不能在宿主细胞内复制的病毒或RNA。,功能,DNA:是主要的遗传物质,遗传信息以密码形式编码在核酸分子上,表现为特定的核苷酸序列。,RNA,参与蛋白质合成,tRNA: 转运、识别,rRNA: 装配、催化,mRNA:信使、模板,多种细胞功能,RNA的5种功能,控制蛋白质合成,作用于RNA转录后加工与修饰,基因表达与细胞功能调节:如反义RNA、RNAi (RNA干

15、扰),生物催化与细胞持家功能(细胞基本功能),遗传信息的加工与进化,生物体通过DNA复制将遗传信息由亲代传递给子代。通过RNA转录和蛋白质翻译使遗传信息在子代中得以表达。 基因是指具有遗传效应的DNA片段或RNA,它能编码蛋白质或功能RNA。某些病毒的基因组是RNA。,核酸结构,核酸分子的组成 核酸的四级结构,基本内容,核 酸,核酸分子组成,核苷酸,磷酸,核苷,戊糖,碱基,A,G,T,C,U,核糖,脱氧 核糖,碱基结构、稀有碱基、核苷三磷酸、环化核苷酸,磷酸基的位置 在RNA分子中,磷酸在2、3、5均可;在DNA分子中,磷酸在3、5( D-2-脱氧核糖 )。 核酸分子的形成 由多个核苷酸分子聚

16、合而成,无分支结构。核苷酸分子之间以 3,5磷酸二酯键相连。磷酸二酯键的走向为3 5。 DNA与RNA的四级结构与蛋白质四级结构比较。,DNA的四级结构,一级结构:由多个4种脱氧核苷酸分子通过3,5磷酸二酯键连接形成的直线型或环型多聚体。,二级结构:在碱基互补配对的基础上形成的DNA双螺旋结构。,三级结构:在二级结构上,DNA双螺旋结构通过折叠和扭曲所形成的特定构象。如超螺旋等。,四级结构:指DNA与蛋白质形成的复合物。如染色体(质)。,重要概念,碱基互补配对与Chargaff规则 DNA双螺旋结构 DNA双螺旋的几种构象 超螺旋 染色体(质)的结构,碱基互补配对 指碱基A、T配对,碱基G、

17、C配对。它们之间分别通过2个氢键和3个氢键配对。即A=T G =C 。 Chargaff规则 在双链DNA分子中,碱基摩尔数存在下列关系:A=T G=C A+C=G+T A+G=T+C DNA双螺旋结构 1953年,Watson和Crick在前人工作的基础上提出DNA双螺旋结构模型。该模型的特征如下: 两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕,且两条链均为右手螺旋。碱基平面与纵轴垂直,糖环平面与纵轴平行;,嘌呤与嘧啶碱基位于双螺旋的内侧; 双螺旋的平均直径为2nm, 两个相邻碱基对之间的距离为0.34nm,即碱基堆积距离为0.34nm;沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸,故每一转的高度为3.4nm,即螺距为3.4nm;两个核苷酸之间的夹角为36; 两条核苷酸链依靠碱基之间形成的氢键而结合在一起,即A与T配对,C与G配对; 碱基在一条链上的排列顺序不受限制,但一旦确定后,即可决定另一条互补链上的序列。 该模型中的DNA结构称为B型构象,表示DNA钠盐在较高湿度下制得的纤维的结构,可能比较接近大部分DNA在细胞中的构象;DNA能以多

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