生物信息学实验

生物信息学实验Tag内容描述：<p>1、核酸序列分析核酸序列分析 【实验目的实验目的】 1、掌握核酸序列检索的基本步骤； 2、熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）； 3、掌握使用 DNAclub 软件进行核酸序列的基本分析； 【实验内容实验内容】 1、使用 Entrez 信息查询系统检索人瘦素 (leptin) 的 mRNA、基因组 DNA、外显子等核酸序列，连接提取该序列内容，阅读序列格式的解释，理解其 含义； 2、使用 DNAclub 对上述核酸序列进行分析 3、使用 DNAclub 软件对人瘦素 (leptin) 的 mRNA 序列进行可读框架分析； 4、使用 NCBI 查询系统进行人瘦素 (le。</p><p>2、广州大学学生实验报告开课学院及实验室：生命科学学院 计机楼407 2013年 12 月 6 日 学 院生命科学学院年级、专业、班生物工程10姓名学号10142000实验课程名称生物信息学成绩实验项目名称实验六 蛋白质序结构与预测指 导 教 师一、实验目的1、掌握蛋白质序列检索的操作方法；2、熟悉蛋白质基本性质分析；3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测；4、了解蛋白质结构预测。二、实验内容1、提交使用上述软件对人脂联素蛋白质序列进行基本性质分析、同源性分析、motif结构分。</p><p>3、xxxxxxxx 学院实验（实习）报告专业班级： xxxxxxxxxx专业 xxxx 级 xx班 组别： 1 学号：xxxxxxxxxx课程名称： 生物信息学设计性实习 指导教师： xxx 实验时间： 201x年xx月xx日至xx月xx日 成绩： DNA序列的统计学、信息学和比对分析姓名(Email Address) xxx通过本实习，旨在利用国际生物信息资源库了解某一基因DNA序列物种来源，序列信息，最后通过序列两两比对和多序列比对分析构建系统进化树，探讨其进化意义。1 材料与方法描述查询序列物种来源及基因名称，简单描述查询过程和比对操作方法.1 序列查询方法 ：2.2 序列比对方法:2 结果。</p><p>4、实验一 生物信息学资源的利用Genebank核苷酸序列的查找一、实验目的：了解生物信息学的各大门户网站以及其中的主要资源，并以NCBI提供的Genebank为例，学习核苷酸序列的分类学检索方法和使用技巧。二、实验器材：计算机，NCBI、EMBL等生物信息学网络资源。三、实验原理：根据Genebank 提供的数据资源，应用分类学方法进行核苷酸序列的查找。 四、实验内容：查找下列不同物种的不同基因组的核苷酸序列。表1：不同物种的不同基因组的核苷酸序列表中文名学名基因名称备注松材线虫Bursaphelenchus xylophilus18S-ITS1-5.8S-ITS2-28S黑腹果蝇Dr。</p><p>5、实验一 常用生物信息学数据库的使用一、实验目的：1、 掌握核酸序列检索的操作方法；2、 熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；3、 了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；4、 熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；二、实验器材：计算机，NCBI等生物信息学网络资源。三、实验原理：建立生物分子数据库的动因是由于生物分子数据的高速增长，而另一方面也是为了满足分子生物学及相关领域研究人员迅速获得最新实验数据的要求。生物分子信息分析已经成为分子生物学研究必备的一种方法。数据库及其相关的分析软。</p><p>6、实验一 生物信息学资源的利用Genebank核苷酸序列的查找一、实验目的：了解生物信息学的各大门户网站以及其中的主要资源，并以NCBI提供的Genebank为例，学习核苷酸序列的分类学检索方法和使用技巧。二、实验器材：计算机，NCBI、EMBL等生物信息学网络资源。三、实验原理：根据Genebank 提供的数据资源，应用分类学方法进行核苷酸序列的查找。 四、实验内容：查找下列不同物种的不同基因组的核苷酸序列。表1：不同物种的不同基因组的核苷酸序列表中文名学名基因名称备注松材线虫Bursaphelenchus xylophilus18S-ITS1-5.8S-ITS2-28S黑腹果蝇Dr。</p>