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第六章 酶 v酶学研究历史(了解) v公元前两千多年,我国已有酿酒记载 v一百余年前,Pasteur认为发酵是酵母细胞 生命活动的结果 v1877年,Kuhen首次提出Enzyme一词 v1897年,Buchner兄弟用不含细胞的酵母提 取液,实现了发酵 一、 酶的概念 v生物催化剂(biocatalyst) v1、酶:是一类由活细胞产生的,对其特异 底物具有高效催化作用的生物大分子,它包 括蛋白质和核酸。 v2、核酶(ribozyme):具有高效、特异催 化作用的核酸,主要参与RNA的剪接。 v几个有关名词 与酶有关的基本概念: v底物(Substrate,S):酶作用的物质。 v产物(Product,P):反应生成的物质。 v酶促反应:酶催化的反应。 v酶活性:酶催化化学反应的能力。 二、 酶的化学本质 (一)大多数酶的化学组成是蛋白质(了解) 实验证据: 1、 酶对热不稳定 2 、酶是两性电解质 3 、引起酶变性的因素也是引起蛋白质变性的因素 4、 酶具有胶体物质的特征 5、 许多酶受蛋白水解酶的作用而丧失活性 6 、已经制得结晶的酶,经重结晶后,其均一性和活 力也不改变 7 、许多酶的氨基酸序列已被陆续测定 v因此,可以确认酶是蛋白质 v另外,通过实验证明核酸也具有酶的催化作用 (二)酶的分子组成 v1、单纯酶(simple enzyme):完全由蛋白 质组成 v2、结合酶(conjugated enzyme):由蛋白 质和辅助因子组成。二者作用不同 v酶蛋白(apoenzyme):决定反应的特异性 v辅助因子(cofactor):决定反应的种类与 性质 (辅助因子)小分子有机化合 物 的分类及作用 v分类: v 辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合较疏松, v 可用透析、超滤等方法除去 辅基(prosthetic group):与此相反 二者的区别: v金属离子: v作用: v参与酶的催化过程,在反应中起传递电子、质 子或一些基团的作用 金属离子的作用 v1、参与催化反应,传递电子 v2、在酶与底物间起桥梁作用 v3、稳定酶的构象 v4、中和阴离子,降低反应中的静电斥力等 金属酶和金属激活酶(了 解) v1、金属酶(metalloenzyme) v金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢 失 v2、金属激活酶(metal-activated enzyme ) v金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合 不甚紧密。 (三)酶的类型 v1、单体酶:只有一条肽链的酶 v2、寡聚酶:由几个或多个亚基组成的酶 v3、多酶复合物:由几个酶嵌合而成的复合 物 v4、多功能酶 :具有多种功能的酶 三、 酶的分类与命名(了 解) v1、酶的分类:主要根据催化反应的性质分为六大 类 v2、酶的命名: v惯用名:由发现者命名,常以底物名、反应性质 和酶的来源命名。 v系统名:(1961年国际酶学委员会确定),要求 确切表明底物的化学性质和酶的催化性质,因此 包括两部分,即底物名称和反应性质 四、 酶促反应的特点 (一) 酶与一般催化剂的共同点: 1、在反应前后没有质和量的变化 2、只能催化热力学允许的化学反应 3、只能加速可逆反应的进程,而不改变反 应 的平衡点。 (二)酶与一般催化剂的不 同点: v1、高效:降低活化能 v2、特异:(绝对、相对、立体异构)特 异 v3、易失活: v4、受调控: v5、活力与辅助因子有关: 酶促反应的特点: 1、酶促反应具有极高的催化效率 酶的催化效率通常比非催化反应高108 1020倍,比一般催化剂高107-1013倍。 酶加快反应速度的机理是降低反应的活化 能(activation energy)。 活化能:底物分子从初态转变到活化态所需 的能量 活化能 反应总能量改变 非催化反应活化能 酶促反应 活化能 一般催化剂催 化反应的活化能 能 量 底物 产物 2、酶促反应具有高度的特异 性 v酶的特异性(specificity) v一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一 定的化学键,催化一定的化学反应并生成 提到的产物。酶的这种选择性称为酶的特 异性或专一性。 v绝对特异性(absolute specificity) v相对特异性(relative specificity) v立体异构特异性(stereo specificity) 酶的特异性 v 绝对特异性 v 酶只作用于特定结构的底物,进行一种 专一的反应,生成一种特定结构的产物 。 绝对特异性 相对特异性: v酶作用于一类化合物或一种化学键 相对特异性 立体异构特异性: v酶仅作用于立体异构体中的一种 立体异构特异性: 3、酶活性受到调节和控制 v细胞内酶的调节和控制有多种方式: v1)调节酶的浓度 v2)通过激素调节酶活性 v3)反馈抑制调节酶活性 v4)抑制剂和激活剂对酶活性的调节 v5)其他调节方式(如别构调控、酶原激 活、酶的可逆共价修饰和同工酶来调节酶 的活性) 五、 酶的作用机制 活化能 反应总能量改变 非催化反应活化能 酶促反应 活化能 一般催化剂催 化反应的活化能 能 量 底物 产物 v(一)酶的活性部位和必需基团 v必需基团:酶分子中氨基酸残基侧链的化 学基团中,一些与酶活性密切相关的基团 。 v必需基团的作用:指必需基团在空间上彼 此靠近,组成具有特定空间结构的区域, 能与底物特异结合并将底物转化为产物。 v酶的活性部位/活性中心:指酶分子中直 接和底物结合,并和酶催化作用直接有关 的部位。 v(P150,图6-6) 酶的活性部位的共同特点 (P151-152) v1、酶的活性部位在酶分子整体结构中只占 很小的部分 v2、酶的活性部位具有三维立体结构(酶的 活性部位的形成,图6-7,P151) v3、酶的活性部位含有特定的催化基团 v4、酶的活性部位具有柔性(见诱导契合假 说) v5、酶的活性部位通常是酶分子上的一个裂 缝 研究酶活性部位的方法: v1、酶分子侧链基团的化学修饰法 v1)非特异性共价修饰 v2)特异性共价修饰 v3)亲和标记(affinity labeling)法 v2、动力学参数测定法 v3、X射线晶体测定法 v4、定点导变法 活性中心内的必需基团 v结合基团 (binding group):与底物相 结合变成产物的基团。 v催化基团(catalytic group):催化底物 转变成产物的基团。 活性中心外的必需基团 v是维持酶活性中心应有的空间构象所必需 。 v构成酶活性中心的常见基团有以下几种: vHis的咪唑基、ser的-OH、Cys的-SH、 Glu的 COOH 活性中心的基团 活性中心以外 的必需基团 底 底 物 结合基团 活性中心 催化基团 酶的活性部位氨基酸的作用点 (一)酶-底物复合物(中间复合物)的形 成 1、中间产物学说 2、锁-钥学说 3、诱导契合假说 (一)酶-底物复合物(中间复合物)的形 成 1、中间产物学说 2、锁-钥学说 3、诱导契合假说 (二)酶与底物复合物的形成 1、中间产物学说 2、锁-钥学说(P149) 3、诱导契合假说(P149) v酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互 变形和相互适应,进而相互结合。 (三)酶促反应的机制 (P153-154) v1、 邻近定向效应与定向排列 v2、 多元催化 (四)酶作用机制的实例 vP156-158 六、 酶促反应速度及其影响 因素 (一)酶促反应速度的测定 v、单位时间内底物的消耗量 v 2、单位时间内产物的生成量(主要方法) 六、酶促反应动力学 v酶促反应动力学(kinetics of enzyme- catalyzed reactions):指研究每促反应的速率 及影响酶促反应速率的各种因素的科学。 (一)酶促反应速率的概念( P159) v酶促反应速率反应酶促反应的快慢程度 v研究前提 v1、 单底物、单产物反应 v2、 酶促反应速度用单位时间内底物的消 耗量或产物的生成量来表示 v3、 反应速度取其初速度,即底物的消耗 量很小(一般在5%以内)时的反应速度 (二)底物浓度对酶促反应速率的影 响(P160 图6-15) (三)酶促反应的动力学方程 式 中间产物学说: 米氏方程 v1913年Michaelis和 Menten提出反应速度 与底物浓度关系的数学方程式,即米-曼 氏方程式,简称米氏方程( Michaelis - Menten )。 v VmaxS vv= v Km + S v米氏方程式表明已知Km和Vmax时,酶促 反应速率与底物浓度之间的定量关系,若 以fANy速率对底物浓度作图,将得到一条 双曲线。 P(163) 图6-17(a) 根据米氏方程可推导出一些规 律: v1、当S Km 时,则该方程式变为 V=VmaxS/ Km , 由于Vmax 和Km为常数,二 者的比值可用常数K表示,所以V= KS,表明 底物浓度很小时,反应速率与底物浓度呈正比 ,其关系符合一级反应动力学。 v2、当S Km 时,则该方程式变为 V=Vmax,表明底物浓度远远过量时,反应速 率达到最大值,其关系符合零级反应动力学。 v v3、当S = Km 时,该方程式变为 V=Vmax/2,表明二者相等时,反应速率为 最大反应速率的一半。 v由此看出:Km值的物理意义:相当于酶促 反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度 , Km单位是mol/L。 v即:当v=1/2V时,则有Km=S 米氏常数的物理意义( 示意图) V V maxmax V V SS K K mm V V maxmax/2 /2 (补充)米氏常数(Km)的实 际意义 v1、是酶的特征常数,其大小与酶的性质有 关,而与酶的浓度无关。 v Km值随测定的底物、反应的温度、pH及离 子强度而改变。因此, Km值作为常数只是 对一定的底物、温度、pH及离子强度等条件 而言。故对某一酶促反应而言,在一定条件 下都有特定的Km值,可用来鉴别酶。 v2、 从Km值可以判断酶的专一性和天然底物。 v Km最小的底物,通常就是该酶的最适底物 ,也就 v 是天然底物。 v3、 1/Km值可近视地表示酶和底物亲和力的大 小。 v 1/Km 越大,亲和力越大,然而,Km值越 小, v 亲和力越大,反之亦然。 v4、根据Km值,可以计算出在某一底物浓度时 ,其 v 反应速率相当于Vmax的百分率。 思考题: v当S=3Km时,其反应速率(v)为Vmax的 多少? 2)Km值与 Vmax的测定 双倒数作图法 P163 图6-17(b) 七、影响酶促反应速度的因素 v1、酶浓度的影响 v当SE,反应速度与酶浓度成正比。 v关系式:V=kE 2、 PH对酶作用的影响( P166-167 图6-20) 生物体内酶的最适PH v不同生物体内酶的最适PH: 1、植物和微生物体内的酶,最适PH在 4.5-6.5 2、动物体内的酶,最适PH多在6.5-8,但 有例外,如胃蛋白酶最适PH为1.9,胰 蛋白酶最适PH为8.1 影响最适PH的因素 v酶的纯度: v底物的种类和浓度: v缓冲液的种类和浓度: PH影响酶活力的机制 v1、环境过酸、过碱能使酶本身变性失活。 v2、PH改变能影响酶分子活性部位上有关基 团的解离。 v3、PH能影响底物的解离。 3、温度对酶作用的影响 (P166 图 6-19) 生物体内酶的最适温度 v动物体内酶的最适温度在37-50 v植物体内酶的最适温度在50-60 影响最适温度的因素 v底物的种类 v作用时间(时间越长,最适温度越低) 温度对酶作用的实际应用: v临床上的低温麻醉 v低温保存菌种或作物的种子 v高温消毒灭菌 4、 激活剂对酶作用的影响 ( P1667) v激活剂(activator): 使酶由无活性变为 有活性或使酶活性增加的物质。 v如Mg2+是多种激酶和和合成酶的激活剂, Cl-是唾液淀粉酶的激活剂。 v激活剂的类型: v阳离子:K+、Na+、Ca2+、Mg2+、Zn2+、 Fe3+ v阴离子:Cl-、Br-、I-、CN-、PO43- 激活剂的主要特征: v1、具有选择性(一种酶的激活剂对另一种 酶可能是抑制剂,当激活剂的浓度超过一定 时,就成为抑制剂) v2、具有拮抗作用(Na+可抑制K+的激活作 用,Ca2+ 可抑制Mg2+的激活作用) 5、抑制剂对酶作用的影响( P163-166) v抑制剂(inhibitor) v概念: v分类:不可逆性抑制剂(irrenersible inhibitor )和可逆性 抑制剂(renersible inhibitor ) v竞争性抑制剂(competitive inhibitor ) v非竞争性抑制剂( noncompetitive inhibitor ) v反竞争性抑制剂(uncompetitive inhibitor ) v1)不可逆性抑制作用 v概念:抑制剂通常以共价键与酶活性中心的必需基团相结合 ,使酶失活,不能用透析、超滤等方法予以除去。 1)不可逆性抑制作用 v举例:巯基酶重金属离子及砷化合物 v 解毒鸡磷定(PAM) v v 解毒二巯丙醇(BAL) 2)可逆抑制作用 v概念: v分类: v(1)竞争性抑制作用(最常见) v定义:抑制剂与底物的结构相似,能与底物 竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物 的形成,使酶的活性降低。 (1)竞争性抑制作用 (1)竟争性抑制剂 (1)竞争性抑制作用的特点 (P166 图16-8) * 特点 *抑制程度取决于抑制 剂与酶的相对亲和力 及S; *I与S结构类似,竞争酶 的活性中心; *动力学特点:Vmax不 变,表观Km。 抑制剂 无抑制剂 1/v 1/S 举例:丙二酸对琥珀酸脱氢酶的 抑制 琥珀酸 琥珀酸脱氢酶 延胡索酸 FADFADH2 磺胺药对细菌FH2合成酶的抑 制 (P165) v5尿嘧啶:是一种重要的抗癌药物 抗代谢物的抗癌作用 (2)非竞争性抑制 v抑制剂与酶活性中心外的必需基团结合,底物 与抑制剂不存在竞争关系。 (2)非竞争性抑制 (2)非竞争性抑制的特点 (P166 图16-8) 特*点 *抑制剂与酶活性中心外 的必需基团结合; *抑制程度取决于I; *动力学特点:Vmax ,表观Km不变。 抑制剂 1/v 1/S 无抑制剂 (3)反竞争性抑制 v 抑制剂与酶和底物形成中间产物结合,使 ES的量下降。 (3)反竞争性抑制 (3)反竞争性抑制的特点 (P166 图16-8) 比较没有抑制剂和有抑制剂存 在时 Vmax 和 Km的变化 v v 不同类型可逆抑制作用的常数比较 v类型 最大反应速度 米氏常数 v无抑制剂 Vmax Km v竞争性抑制 不变 v非竞争性抑制 不变 v反竞争性抑制 一些重要的抑制剂 v 不可逆抑制剂 v1)非专一性不可逆抑制剂 v有机磷化合物(敌百虫、敌敌畏等)是神 经毒剂,但可用解磷定等解毒 v有机汞、有机砷化合物 v重金属盐(Ag+、Cu2+、Hg2+、Pb2+、 Fe3+) v烷化试剂(碘乙酸、碘乙酰胺、2,4-二 硝基氟本) v氰化物、硫化物和一氧化碳 v青霉素 2)专一性不可逆 vKs型:据底物的化学结构设计 vKcat型;据酶催化过程设计 可逆抑制剂(又称抗代谢物/代谢 类似物) v最重要和最常见的是竞争性抑制剂 v1)5尿嘧啶:是一种重要的抗癌药物 v2)磺胺药 八、酶活性的调节(P168- 174) v(一)酶活性的调节方式(主要有两种方 式) v (引导看 P168) v(二)酶的别构调控(P168) v 别构调控 v 别构酶 v 效应物 变构酶的S曲线 变构调节举例 变构调节 (三)可逆的共价修饰调 节 (P171-172 ) v可逆的共价修饰 v共价调节酶 酶的磷酸化与脱磷酸化 酶的磷酸化与脱磷酸化 共价修饰调节的特点 v1、受共价修饰的酶存在有(高)活性和无 v (低)活性两种形式 v2、具有瀑布效应(级联效应) v3、是体内经济、有效的快速调节形式 瀑布效应 瀑布效应 (四)酶原的激活 v1、概念: v酶原: v酶原激活: 2、酶原激活的机理 v 酶原 v 在特定条件下 v一个或几个特定的肽键断裂,水解掉一个或 几个短肽 v v 分子构象发生改变 v v 形成或暴露出酶的活性中心 胰蛋白酶原(P173 参看图6- 28) 3、酶原激活的生理意义 v1)避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化 ,并使酶在特定的部位和环境中发挥作用, 保证体内代谢正常进行。 v2)有的酶原可以视为酶的储存形式,在需 要时,酶原适时地转变成有活性的酶,发挥 其催化作用。 九 核酶、抗体酶和同工酶 v1、核酶(ribozyme)具有催化核糖核酸的酶 v2、抗体酶(abzyme)具有催化免疫球蛋白的酶 , v 又称催化性抗体 v3、同工酶(isozyme) v概念:指具有不同分子形式却催化相同化学反应 的酶 第一个同工酶乳酸脱氢 酶 * 举例:乳酸脱氢酶(LDH1 LDH5) v不同类型的同工酶LDH同工酶在 不同组 织中的比例不同,在心肌中LDH1的比例 较大,在骨骼肌和肝脏中LDH5含量较高 v临床检验: v思考:心肌受损病人和肝细胞受损病人, 血清中LDH发生什么变化? 同工酶的临床意义 临床意义 心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶谱的变化 1 酶活 性 心肌梗死酶谱 正常酶谱 肝病酶谱 2345 心、肝病将引起血清LDH同工酶 酶谱的变化,一般规律是: v1、心脏疾病LDH1及LDH2上升,LDH3及 LDH5下降 v2、急性肝炎LDH5明显上升,随病情好转 而逐渐恢复正常。 v3、慢性肝炎一般处于正常范围,部分病 例可见LDH5有所上升。 v4、肝硬病LDH1、 LDH3 和LDH5均升高 v5、原发性肝癌LDH3 、 LDH4和LDH5均上 升,但LDH5LDH4。 v6、转移性肝癌LDH3 、 LDH4和LDH5均上 升,但LDH4LDH5。 同工酶的生物学功能: v1、同工酶作为遗传标志,已广泛被遗传 学家用于遗传分析的研究。 v2、同工酶和个体发育及组织的分化密切 相关。 v3、同工酶与代谢调节 v4、同工酶与癌基因的表达 v此外,同工酶分析法在农业上已开始用于 优势杂交组合的预测。 v总之。同工酶是研究代谢调节、分子遗传 、生物进化、个体发育、细胞分化和癌病 的有力工具。 十 酶的研究方法与酶工 程 v(一)酶活力的测定方法 v酶的活性单位:在规定条件下,酶促反应 在单位时间内生成一定量的产物或消耗一 定数量的底物所需的酶量。 v国际单位(IU):
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