中国高发遗传病筛查ppt课件.ppt

中国高发遗传病筛查套餐 遗传病概况 u 人类疾病共有约14000种，其中遗传病约8000种。 u 在遗传病中，已经明确鉴别出单基因遗传病6500种左右 （据NCBI数据），即由一个特定基因的某一个片断或位 点的变异导致的遗传性疾病。 u 中国单基因遗传病的总发病率约为6.5% u 常见的单基因遗传病有遗传性耳聋、红绿色盲、脊髓性肌 萎缩症、享廷顿舞蹈症等等。 u 单基因遗传病的最可靠的诊断方式是基因诊断（分子诊断 ）。 LoongeneTM中国高发遗传病筛查套餐开发条件 u产品开发者： 复旦大学遗传工程国家重点实验室基因治疗课题组开发。 u病种选择原则： 本产品以上海市卫生和计划生育委员会发布的基于流行病学调查而总结 的中国高发65种遗传病为基础，剔除多基因遗传病（在技术层面上难以 给出诊断意见）、肉眼可见遗传病（如多趾症等，不需要进行分子诊断 ），保留了45种遗传病。 u目标基因选择。 本产品共使用3300对引物，检测100多个基因的3300个片断。目标基因 的选择主要依据美国国家卫生研究院（NIH）下属美国国家生物信息中 心（NCBI）整理的遗传病基因信息来确定。部分基因信息在中国的研究 中未见报道，但本着谨慎的原则仍予保留。 LoongeneTM中国高发遗传病筛查套餐检验方法 本产品基于二代基因测序平台开发，选用的平台为美国Life公司的Ion Proton。该 设备由达安基因申报了SFDA医疗器械证，可用于临床检验。 基因测序是分子诊断领域最可靠的 检测手段，被视为基因检测的金标 准。理论准确度可达到99.99%（根 据Life公司数据）。 LoongeneTM中国高发遗传病筛查套餐临床检验资质 u 本产品由“枫林-龙鼎遗传缺陷筛查联合实验室”进行检验，由上海枫林医药医学 检验所出具筛查报告。 上海枫林医药医学检验所系上海医药临床研究中 心下属单位，系根据国家科技部与上海市政府“ 部市协商”机制设立的政府项目（详见其官方网 站） 产品详情之一-遗传性耳聋 u 遗传性耳聋是中国常见遗传病之一，在中国其群体发病率为27/1000。 u 遗传性耳聋主要由以下5个基因引起： 其中，CJB2和CJB3突变检测可覆盖中国97%先天性耳聋人群。 u 判断标准：纯合突变即判为阳性。杂合突变为携带者。 基因突变位点 GJB235delG GJB2176_191del16 GJB2235delC GJB2299_300delAT GJB2167delT GJB3538CT GJB3547GA CJB6D13S1830（中国未发现） KCNQ4162bp移位缺失（中国未发现） COL11A21647CT（中国罕见） COL11A2907GA（中国罕见） 产品详情之二-肝豆状核变性 u 肝豆状核变性是中国常见遗传病之一，是中国神经系统遗传病中发病率最高的 疾病。 u 肝豆状核变性主要由以下1个基因的12种突变引起： u 判断标准：纯合突变即判为阳性。杂合突变为携带者。 基因 突变位点 占突变总人群比例 ATP7B ATP7B(p.D765N) 3.33% ATP7B ATP7B(p.M769V) 3.33% ATP7B ATP7B(p.R778L&p.R778N) 37.50% ATP7B ATP7B(p.R919G) 2.70% ATP7B ATP7B(p.T935M) 6.80%-12.75% ATP7B ATP7B(p.G943D) 2.30% ATP7B ATP7B(p.A952L) 23.33%-31.80% ATP7B ATP7B(p.P992L) 13.40% ATP7B ATP7B(p.R1041P) 2.27% ATP7B ATP7B(p.P1052L)2.00% ATP7B ATP7B(p.I1148T)4.60% ATP7B ATP7B(p.G1173K)2.30% 产品详情之三-脊髓性肌萎缩症 u 脊肌萎缩症是中国常见遗传病之一，新生儿发病率约1/6000。 u 脊肌萎缩症主要由SMN1基因SMN1基因内含子6至外显子8之间区域（ chr5:70240568-70248007）片断缺失引起运动神经元受损，造成肌肉萎缩和 肌动迟缓。 u 检验方法：用测序法对相关区域内的DNA序列进行测定。 u 判断标准：7号外显子或8号外显子纯合缺失即判为阳性。 产品详情之四-全套餐检测基因总表 编号名称检测基因编号名称检测基因编号名称检测基因 1先天性白内障CTDP116先天性眼球震颤FRMD731遗传性果糖不耐受ALDOB 2白化病OCA2、MC1R、TYR17血友病A/BF8、F932腺苷脱氨酶缺乏症ADA 3 威廉姆斯综合征 （主动脉瓣上狭窄） ELN18葡萄糖-6-磷酸氢酶缺乏症G6PD33 Fabry病 （X连锁隐性遗传溶酶体病） GLA 4软骨发育不全FGFR319Marfan氏综合症FBN134Noonan综合症PTPN11、Kras、Nras、SOS1、RAF1 5进行性肌营养不良DMD20先天性糖基化病Ia型PMM235共济失调FXN 6先天性青光眼CYP1B121半乳糖血症GALT36扭转痉挛DYT1 7先天性无虹膜PAX622地中海贫血（型）HBB37抗维生素D佝偻病PHEX 8枫糖尿病DBT、DLD、BCKDHA、BCKDHB23耳硬化症COL1A138血小板无力症ITGA2B、ITGB3 9肝豆状核变性ATP7B24红绿色盲OPN1LW、OPN1MW39眼白化病GPR143 10 葡萄糖脑苷脂沉淀病 （戈谢病） GBA25 Gitelman综合征 （家族性低钾-低镁血症） SLC12A340遗传性迟发性耳聋 GJB2、GJB3、GJB6、KCNQ4、 COL11A2 11成骨发育不全COL1A1、COL1A226先天性肌强直CLCN141遗传性肾炎COL4A5 12大疱型表皮松解症COL7A127苯丙酮尿症PAH42多发性结肠息肉APC 13脆性X综合征 X染色体上FMR1基因5端非翻译区的一段数目可变的 三核苷酸重复序列(CGG)n异常扩增 chrX:146993480- 146993720 28先天性肌驰缓 SMN1基因内含子6至外显子8之间区域（ chr5:70240568-70248007） 43黏多糖型/型IDS、IDUA 14多囊肾PKHD1、PKD1、PKD229先天性上睑下垂FOXL244视网膜母细胞瘤RB1 15肥厚型心肌病 RPS7、SLC25A4、TNNT2、TPM1、VCL、ACTC1、 CALR3、CAV3、MYBPC3、MYH6、MYH7、MYL2、 MYL3、MYLK、MYOZ2、PRKAG2 30强直性肌萎缩 DMPK基因3端非翻译区（CTG）n三核苷酸重复序列 异常扩增是DM1致病的原因（chr19:46273396- 46273575） 45视网膜色素变性 SNRNP200、SPATA7、TOPORS、TULP1、RP9、PRPF31、 PRCD、MERTK、ABCA4、ARL6、BEST1、CA4、RPGR、PRPH2 、PROM1、NR2E3、CERKL、CNGB1、CRX、EYS、SEMA4A、 RHO、PRPF8、FSCN2、KLHL7、LRAT 标本采集方法 u 使用本公