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靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测、分析和验证,解放军总医院南楼血液科 卢学春 杨波 朱宏丽等,生物信息学在全球迅猛发展,基因基因组学 蛋白质蛋白质组学 表观遗传学表观基因组学 疾病状态的,如何利用数据库为我们服务?,生物信息学!,表观遗传学的贡献,抗癌基因的丢失与肿瘤的发生密切相关 ID4基因的表达缺失而非突变与白血病和淋巴瘤的发生密切相关,ID4丢失对白血病治疗前景的启示,重新表达! 转染-基因治疗 药物诱导,哪些药物能够诱导ID4基因的表达?,生物信息学可以预测!,实验室证实,ID4基因的启动子分析,ID4基因启动子活性分析,ID4基因5侧翼区顺式作用元件的预测结果,ID4基因表达谱的生物信息学预测,雌激素对ID4基因表达的影响 a. C57BL/6小鼠卵巢切除后的胸腺用17-雌二醇(E2)或E2的类似物三羟基异黄酮处理. b. 卵巢切除14天后,小鼠皮下注射黄体酮,在不同时间点切除子宫检测,对ID4基因表达具有抑制作用的因素 a.肺组织取自100氧损伤的野生型Nrf2敲除小鼠. b.用100uM ZVAD处理REtsAF-Bcl-2细胞,并在39.5条件下培养使caspases失活. REtsAF-Bcl-2细胞带有温度敏感的LT抗原突变体,能够在33而非39.5条件下抑制p53基因的活性. c.脊髓组织, 200ng的二羟维生素D3对多发脊髓硬化B10PL小鼠基因表达的影响. d. 比较对Sindbis病毒具有抗性和敏感性293细胞的基因表达,对ID4基因表达具有促进作用的因素 a.3日龄小鼠用ATRA处理.在第4天给一半小鼠以地塞米松(DEX). b. 额叶皮质的基因表达,取自过表达人类乙酰胆碱酯酶(AchE)的雌性小鼠和雌性FVB/N小鼠. C. 巨噬细胞和脐静脉内皮细胞用100nM白三烯处理1小时后的基因表达. d. 来自骨髓的巨噬细胞PIAS1用500U/ml的IFN-或10ng/ml IFN-处理2h或4h.,有关ID4基因表达调控的文献,*不同研究结果间存在矛盾. (-)抑制表达; (+)促进表达,二丁酰环磷腺苷钙对MOLT4白血病细胞系表达ID4基因的影响 DL2000为DNA分子量标准;M4为不做任何处理的MOLT4细胞系,M4-DC浓度为0.1mmol/L的二丁酰环磷腺苷钙处理48h。ID4基因的PCR产物长度为364bp。内参hHPRT的产物长度为231bp。,结 论,生物信息学可用于筛选靶向调控功能基因表达的药物 二丁酰环磷腺苷具有诱导ID4基因在白血病细胞中表达的作用,对ID4基因表达缺失的白血病

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