sp01第一章6微生物的分类和鉴定食品微生物学.ppt

第六节 微生物的分类和鉴定,一、微生物在生物界的地位 二、分类学规则 三、微生物的分类鉴定方法 四、各大类微生物的分类系统纲要 五、微生物形态结构的观察方法,一、 微生物在生物界的地位,生物的两大界动物界和植物界。 随着人们对微生物认识的逐步深入，从两界系统经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，直到20世纪70年代后期，Woese等发现了地球上的第三生命形式（古菌），导致了生命三域学说的诞生。 生命进化一直是人们所关注的热点，有人认为生命的共同祖先是一个原生物。原生物在进化过程中产生两个分支，一个是原核生物（细菌和古菌），一个是真核生物。在之后的进化过程中细菌和古菌首先向两个不同的方向进化，然后原真核生物经吞食一个古菌，并由古菌的DNA取代寄主的RNA基因组而产生真核生物。从进化的角度，微生物是一切生物的老前辈。 （此观点，你认为怎样？）,生物的界级分类学说 （提出时间、提出者、内容） 两界系统：1753年林奈提出，将生物分为植物界和动物界。 三界系统：1866年海克尔（Haeckel）将生物分成动物界、植 物界和原生生物界（低等生物）。 四界系统：柯普兰（Copeland，1938，1956）提出植物界、动物界、原生生物界和菌界；李德尔（Leedel，1974）提出植物界、动物界、真菌界和原核界的四界系统。,生物的界级分类学说 （续） 五界系统：1969年Whittaker提出原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界、动物界的五界系统。 六界系统：1977年王大耒提出植物界、动物界、真菌界、原核生物界、原生生物界和病毒界的六界系统；1996年，美国的P.H. Raven等则提出包括动物界、植物界、原生生物界、真菌界、真细菌界和古细菌界。 三域（三原界三总界、三超界）学说：1977年罗斯（Woses）提出古细菌、真细菌和真核生物三原界学说。,二、分类学规则,1. 种以上的系统分类单元 七级分类单元（taxon, taxa; category） 界 Kingdom （拉：Regnum） 门 Phylum（拉：phylum）或（拉：Divisio） 纲 Class（拉：Classis） 目Order（拉：Ordo） 科 Family（拉：Familia） 属 Genus（拉：Genus） 种 Species（拉：Species）,2、种的概念： 种是一个基本分类单位，它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株(type strain)来作具体标本，故这一典型菌株就是该种的模式种(type species)。种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上，把DNA同源性的大小作为划分种的标准。,种的分类地位举例： 灰色链霉菌： 原核生物界(Procaryotae)、 厚壁菌门(Tenericutes)、 枝形细菌纲(Thallobacteria)、 放线菌目(Actinomycetales)、 链霉菌科(Streptomycetaceae)、 链霉菌属(Streptomyces)、 灰色链霉菌(S. griseus)。,种的分类地位举例,三种微生物的分类地位举例：,3. 学名(双命名法） 1753年，瑞典植物学家林奈创立,学名 属名种的加词（首次定名人）现名定名人定名年份 ( 必要，用斜体排字） （可省略，均用正体排字） 举例： 金黄葡萄菌 ： Staphylococcus aureus Rosenback 猪霍乱沙门氏菌 ： Salmonella cholerae-suis (Smith) Weldin,1927 Bacillus cholerae-suis Smith,1894 蜡状芽孢杆菌荧光变种： 把Bacillus cereus var. fluorescens Laubach,variety,三名法 subsp 和var,学名的发音,4. 亚种以下的分类单元,亚种(subspecies)：当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状而有不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成亚种。变种是亚种的同义词，现在不再使用该词。 型(form)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 群(group)：有些微生物种类的特性介于两种微生物之间，彼此之间难以区分开来，就把这两种微生物和介于它们之间的种类统称为一个“群”。 菌株(strain)或品系：是指不同来源的相同的种（或型）。即从自然界中分离到的每一个微生物的纯培养都可以称为一个菌株。菌株名称常用数字编号、字母、人名、地名等表示。如生产蛋白酶的枯草杆菌1.398，生产淀粉酶的枯草杆菌7.628。,三、微生物的分类鉴定方法,1. 分类鉴定的基本方法 特征对比是分类的基本方法。 通常可把微生物的分类鉴定方法分成4个不同水平。 （1）细胞的形态和习性水平。 （2）细胞组分水平。 （3）蛋白质水平。 （4）核酸水平。 当然，还有其他方法，如数值分类法等。,2. 微生物的经典鉴定内容 （1）培养特征：菌落的形状、大小、颜色、隆起、表面状况、质地、光泽、水溶性色素等，在半固体或液体培养基中的生长状态。 （2）形态特征：个体细胞形态、大小、排列方式、运动性、特殊构造和染色反应等。 （3）生理、生化反应：营养要求、酶、代谢产物、环境要求、对药物的敏感性。 （4）繁殖方式与生活史：无性与有性繁殖。 （5）血清学反应 （6）噬菌体敏感性 （7）其他,四、 各大类微生物的分类系统纲要,分类依据：形态特征、培养特征、生理生化特征以及血清学反应和噬菌体敏感性等。 新的分类方法：核酸分析法、数值分类法和DNA体外杂交法等。 1、原核微生物分类系统纲要 伯杰氏鉴定细菌学手册1923、1974、1994（第九版） （1）手册中的高级分类单元，有四个门 （2）手册所包括的主要科属 （3) 重要原核微生物类群简介 伯杰氏系统细菌学手册1984-1989、2000 （1）表型、实用性鉴定指标向鉴定遗传型的系统进化分类体系转变 （2）内容丰富、5卷2界(古生菌界和细菌界）,2、真菌的分类系统纲要 （1）真菌界：真菌自成一界的原因 真菌的营养方式：分解吸收式 细胞结构和化学成分：独特，如细胞壁主要成分为几丁质；细胞中无叶绿体；线粒体、核糖体不同于植物。 组织分化程度差，一般有发达的菌丝体和各种子实体构造。 核分裂方式简单，除正常有性生殖外，还有准性生殖（发生在体细胞间的基因重组方式，从而导致了变异和广泛适应不同环境的特性）。 真菌细胞色素c的结构比较接近动物而远于植物，它与动物的差别要大与动物与植物的差异。,（2） Ainsworth系统（1966年） Ainsworth （ed.7, 1983）的真菌分类系统纲要: Dictionary of the fungi (Hawksworth, D. L. et al. 1983) 菌物界：两大门（粘菌门和真菌门），真菌门又分五亚门（鞭毛菌亚门、结合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌亚门 ）。 Dictionary of the fungi (ed. 8, Hawksworth, D. L. et al. 1995) 真核生物域的菌物：原生动物界、假菌界界、真菌界。 真菌界：子囊菌门（Ascomycota）、担子菌门（Basidiomycota）、壶菌门（Chytridiomycota）、结合菌门（Zygomycota）和有丝孢菌类（Mitosporic Fungi）。 Dictionary of the fungi (ed.9, Kirk, P. M. et al. 2001) Dictionary of the fungi (ed.10, Kirk, P. M. et al. 2009),五、微生物形态结构的观察方法,1、肉眼观察：群体 2、显微镜观察：光学、电子 3、染色法： 步骤：涂片、固定、染色、水洗、吸干 染色方法：