《数量遗传》PPT课件.ppt

第九章 数量性状基因及其遗传,本章重点: 数量性状 多基因效应 遗传率(力) 近交系数 杂种优势遗传理论,第一节 质量性状与数量性状,数量性状：性状之间呈连续变异状态，界限不清楚，不易分类，用数字描述的性状。 例如：作物的产量，奶牛的泌乳量，棉花的纤维长度，人的身高、体重、血压、血糖等。,质量性状：表型之间截然不同，具有质的差别，用文字描述的性状称质量性状。,(1)对环境条件比较敏感：由于环境条件的影响，亲本与F1中的 数量性状也会出现连续变异的现象。 如：玉米P1、P2和F1的穗长呈连续分布，而不是只有一个长度。但这种变异是不遗传的。,数量性状的主要特点,油研7号,P1 P2 F1 F2 连续变异,(2)数量性状的变异表现为连续性：杂交后代难以明确分组，只能用度量单位进行测量，并采用统计学方法加以分析,易患性,阈值性状,(3)质量性状和数量性状的区别是相对的.,非患病 5 患病,数量性状的遗传在本质上与孟德尔式的遗传完全一样，只是需用多基因理论来解释。,(4)控制数量性状的遗传基础是多基因系统。,油研7号,质量性状 数量性状 变异类型 不连续 连续 F1表现类型 显性性状 中亲类型 对环境的敏感性 不敏感 敏感 后代个体数分布 孟德尔遗传 正态分布 基因数目 一个或少数几个 微效多基因 研究方法 系谱和概率分析 统计分析,质量性状和数量性状的区别,第二节 多基因效应,红粒小麦 X 白粒小麦 后代红、白分离 红色呈现程度上的差别 3对基因的独立遗传,A组 P 红粒白粒 F1 红粒 F2 3/4红粒：1/4白粒 B组 P 红粒白粒 F1 粉红粒 F2 15/16红粒：1/16白粒 C组 P 红粒白粒 F1 粉红粒 F2 63/64红粒：1/64白粒,Nilson-Ehle，瑞典.1908,数量性状是许多对微效基因或多基因的联合效应所造成； 多基因中的每一对基因对性状表现型的表现所产生的效应是微小的。多基因不能予以个别辨认，只能一起研究； 微效基因的效应是相等，而且相互累加，后代连续变异； 微效基因对环境敏感，因而数量性状的表现容易受环境因素的影响而发生变化。微效基因的作用常常被整个基因型和环境的影响所遮盖，难以识别个别基因的作用； 有些数量性状受一对或少数几个主基因（major gene）的支配，还受到一些微效基因或修饰基因的修饰。,1、多基因假说（multiple factor hypothesis）,2、数量性状基因数的估计,亲本1 穗长 6.6cm 标准差=0.8 亲本2 穗长 16.8cm 标准差=1.9 F1 穗长 12.1cm 标准差=1.5 F2 穗长 12.9cm 标准差=2.3 n = (16.8-6.6)2/8(2.32 +1.52) =4.3 4-5个基因,（1）Castle W E和Wright S:,n = D2/8(12 +22) n为基因数目，D为亲本平均数之差， 12 为F1代的表型方差，22为F2代的表型方差。,油研7号,4n = F2代个体总数/ F2代中极端个体数 例如:获得子二代22016个子代，其中极端子代86个，计算所涉及的基因数。 4n = 22016/86 n=4 4个基因,（2）极端类型概率数：,油研7号,第三节 数量性状分析的基本统计方法,1、基本概念,（1）随机事件和频率,随机事件：一定条件下，可能发生也可能不发生的事件。,频 率：在若干次试验中，某一事件出现的次数在试验总 次数中所占的比例。（实际测定的数值）,油研7号,概 率：在反复试验中，预期某一事件出现的次数在试验总次数 中所占的比例。（估计值）,（2）概 率,a)各种概率之和等于1。 b)概率值在0和1之间。1p0 c)概率的相成法则：两个或两个以上各自独立事件同时出现的概率，是他们各自概率的乘积。 P12= p1 X p2 d)概率的相加法则： A和B两个向斥事件， A和B事件发生的总概率，是他们独自发生的概率之和。P12= p1 + p2 e)条件概率： A和B两个在条件S下的随机事件。 PA不等于0，则在A发生的前提下，B发生的概率成为条件概率。 PB/A = PBA / PA,油研7号,（3）平均数,平均数：某一性状的几个观察值的平均。,算术平均：是将每一观察值向加后除以观察的次数。,加权平均：是先将观察值归类，再以每类的观察次数同观察 值相乘，各类乘积之和除以观察的总次数。,油研7号,方差（variance，S2）：可变数（x）同平均数（x）之间偏差的平方之和来表示。 表示资料的分散程度，是全部观察数偏离平均数的重要参数。 观察数偏离平均数 越大，分布范围越大，该资料变异程度越大， S越大，则平均数的代表性越小。,（4）方 差,S2= X2 (X ) 2 / n/(n 1),例题：57个玉米穗 长度(cm， x ) 5 6 7 8 观察数(个 ) 4 21 24 8 平均数= (5x4+6x21+7x24+8x8)/57 =6.63 积加X2=52x4+62x21+72x24+82x8 =2544 积加 X=5x4+6x21+7x24+8x8=378 n=57 S2= X2 (X ) 2 / n/(n 1) = 2544(378 / 57 ) 2 /(571) 0.67 X S=6.63 0.82cm,S2= X2 (X ) 2 / n/(n 1),油研7号,S= S2,（5）标准误,标准误：即标准差，方差的平方根。,标准误表示平均数的变动范围。 S + x= 0.82 6.63cm 可信区间 95% - 1.96 S. and + 1.96 S 99% - 3.00 S. and + 3.00 S,3、统计检验方法,（2）差异显著性： 显著水平 （1-）可信度 0.05 显著 95% 0.01 极显著 99%,（1）假设检验：无效假设H0 H0 = Xi X=0,接受区,否定区,（3）卡方检验：,自由度n，实际观察类型数减1，K-1 按公式计算2值; 用统计参数2与查表得到的2,k-1比较； 为临界概率值，取0.05或0.01，通常用0.05； 当220.05,k-1时接受无效假设，反之接受备择假设。,20.05,k-1 =11.345,220.05,k-1 ，接受无效假设，试验结果与理论比例相符,= 0.4699,20.01,k-1 = 7.851,第四节 遗 传 率,遗传率: h2遗传方差/表型方差,表型方差 = 遗传（基因型）方差 + 环境方差 VP = VG + VE,2,h,总方差,）,广义遗传率（,例:已知:F2的标准差S=2.252cm， F1的标准差S=1.519cm，,AA，Aa，aa性状计量的模式图，O点表示两亲代的中间值，杂合体Aa位于O点的右方，表示A为部分显性。一对基因A,a,它们的3个基因型的平均效应是:AA，a； Aa，d； aa，-a；,VG = V A+ V D VP = VG + VE = V A+ V D + VE,狭义遗传率:h2N加性效应的遗传方差表型方差,F2平均值和遗传方差的计算,F2的遗传方差VG=x2-(x)2= a2 + d2,一、广义遗传率的计算,广义遗传率：h2=VG/VP=(VF2-VE)/VF2,例题：玉米穗长度 57个 世代 P1 P2 F1 F2 S2 0.67 3.56 2.31 5.07 h2,5.07(0.67 + 3.56 + 2.31 )/3 5.07, 57,则,表型方差VF2 = VA+ VD+VE 遗传方差VG = VA+ VD = VF2-VE,由于两亲代为纯合体，基因型相同，表型的变异可看作均来自环境的影响，所以： VE=(VP1+VP2) 或 VE=1/3(VP1+VP2+VF1),狭义遗传率：hN2=VA/VP hN2=VA VF2 VF2= VA+ VD+ VE,二、狭义遗传率的计算,要求出VA,需用F1个体回两个亲本： F1(Aa) X P1(AA) 得B1; F1(Aa) X P2(aa) 得B2 。 B1 , B2的表型方差分别计算如下,B1的平均数和遗传方差的计算(Aa X AA),B1的遗传方差：VB1= (a2+d2) (a+d)2 = (a-d)2,B2的平均数和遗传方差的计算(Aa X aa),B2的遗传方差：VB2= (a2+d2) (d-a)2 = (a+d)2,由VB1,VB2可分离出加性方差VA,B1,B2遗传方差的平均值： VB1+VB2= (a-d)2 + (a+d)2 = (a2+d2) = VA+ VD B1,B2表型方差值： VB1+VB2= VA+ VD+VE 而F2的表型方差: VF2= VA+ VD+VE V F2 (VB1 + VB2) = VA,狭义遗传率: hN VA (VG+VE ) = VAVF2 VA = V F2 (VB1 + VB2),2,（VB1+VB2） (17.35 + 34.29 )25.82 VA VF2 - (VB1+VB2） 40.3525.82=14.53 hN2VA(VG+VE ) = VAVF22 X14.5640. 3572%,世代 小麦抽穗期 表型方差 P1 13 11.04 P2 27 10.32 F1 18.5 5.24 F2 21.2 40.35 B1 15.6 17.35 B2 23.4 34.29,第五节 近亲繁殖和杂种优势,1、近交：近亲繁育简称近交，是指有亲缘关系的个体间的交配或配子的结合。自交、全同胞交配、半同胞交配、表兄妹交配和回交。 利：增加基因纯合性，提高基因的稳定性。 弊：近交衰退，后代生活力下降，适应力减弱，抗病差等。 2、杂交：杂交是指不同品种或不同种间进行的交配。杂交繁育也叫杂交改良。广义而言，是指不同基因型的个体或种群间的交配。 杂交增加基因杂合性，可以用来培育新品种或创造杂交优势。,P1,AA,aa,P2,B1,B2,s,一、近交和近交系数,近交系数（F）：一个个体从其某一祖先得到一对纯合的、且遗传上等同的基因的频率。,AAaa,F =() () 2 =() 2 2 =,近交系数的计算,P1,A1A2,A3A4,P2,B1,B2,s,（1）同胞兄妹婚配 在A1，A2，A3，A4四个基因座位上，S至少得到一对纯合子的概率（即近交系数）为： F=4 ()4 =,近交系数计算举例,A1A1,A2A2,A3A3,A4A4,（2）表兄妹结婚 所生子女的近交系数： F =4()6=1/16,A1A2,A3A4,P1,C1,P2,C3,C2,C4,B1,B2,S,近交系数计算举例,（3）舅父同甥女或姑母同内侄结婚 所生子女的近交系数： F =4 ()5=1/8,A1A2,A3A4,P1,P2,B1,B2,S,C,近交系数计算举例,（4）堂兄妹、姑表兄妹或姨表兄妹结婚 所生子女的近交系数： F =4 ()6=1/16,A1A2,A3A4,P1,C1,P2,C2,B1,B2,S,近交系数计算举例,（5）具有同一祖先的同父异母兄妹、异父同母兄妹 所生子女的近交系数： F =2 ()6=1/32,A1A2,P1,C1,P2,C2,B1,B2,S,近交系数计算举例,(2) X染色体 男性，X染色体伴性基因传递给女儿的机会是1。 家系中出现两个连续传代的男性，伴性基因中断传递。,性染色体基因的近交系数,(1)Y染色体 Y只传递给儿子 儿子(XY)是杂合子，无基因等同 F=0,（1）姨表兄妹结婚所生女儿的近亲系数： F = ()3+ 2 ()5 =1/16,X1Y,X2X3,P1,C1,P2,C2,B1,B2,X1X1 X2X2 X3X3,伴性遗传基因近交系数计算举例,（2）堂兄妹结婚所生女儿的近亲系数： F=0,X1Y,X2X3,P1,C1,P2,C2,B1,B2,S,伴性遗传基因近交系数计算举例,平均近交系数（mean coefficient of inbreeding ）：在一个群体中，近交婚配数占总婚配数的百分率。 平均近交系数是衡量群体中血缘关系程度或近交的流行程度。 平均近交系数是近交婚配数子女数与近交系数的乘积的平均值 例：100个人的群体,其中5人是表兄妹婚配（1/16）所生,7人是从表兄妹的婚配（1/64）所生，计算该群体的平均近交系数（） 5 X 1/16 + 7 X 1/64 100,平均近交系数（mean coefficient of inbreeding ）,= 0.0042,近亲婚配的危害,近亲婚配的危害表现在： 1）单个隐性基因的纯合，遗传病的表现 2）纯合度的提高和基因的累加效应,如果近亲婚配中的祖先的有害基因是纯合隐性致病的基因，个体在群体中的携带有害基因的机会是概率事件，近亲婚配的子女的有病可能性大大高于随机婚配子女。,（1）杂种优势（heterosis）:是杂合体在一种或多种性状上优于两个亲本的现象。 例如不同品系、不同品种、甚至不同种属间进行杂交所得到的杂种一代往往比它的双亲表现更强大的生长速率和代谢功能，从而导致器官发达、体型增大、产量提高，或者表现在抗病、抗虫、抗逆力、成活力、生殖力、生存力等的提高。这是生物界普遍存在的现象。,3、杂种优势,（2）杂种优势的共同的基本特点,1、优势大小：决定于双亲性状的相对差异和补充。 在一定范围内，双亲亲缘关系、生态类型和生理特性差异越大，并且优缺点彼此能互补，其杂种优势就越强。说明杂种基因型的高度杂合性是形成杂种优势的根源。 2、优势大小与双亲基因型的高度纯合有关。 双亲基因型纯度高,F1群体具有整齐一致的异质性不出现分离混杂, 优势明显。 例：玉米自交系间的杂种优势 品种间的杂种优势。 3、F2 的衰退表现： F2生长势、生活力、抗逆性和产量等方面明显低于F1的现象。 F2群体内必然会出现性状的分离和重组。,显性学说：杂合态中，隐性有害基因被显性有利基因的效应所掩盖，杂种显示出优势。 P AAbbCCDDee.X aaBBccddEE F1 AaBbCcDdEe.(出现杂种优势),（3）杂种优势遗传理论-显性学说,显性基因互补假说 科学家在1910年提出了显性基因互补假说，1917年琼斯(D.F.Jones，18901963)又对这一假说进行了补充完善。该假说认为，多数显性基因是有利基因，而隐性基因多是不利基因，当两个遗传组成不同的亲本交配时，来自一个亲本的显性有利基因就会将来自另一个亲本的隐性有害基因遮盖住，从而使杂种个体表现出优势。 野生型基因一般是显性的，显性基因多编码具有生物学活性的蛋白质，突变基因一般是隐性的，隐性基因多编码失去或降低活性的蛋白质。因此杂合体AaBb的生活力高于纯合体AAbb或aaBB。这便是显性假说所说的杂种优势的生化基础。,超显性说：基因处于杂合态时比两个纯合态都好。 P a1a1b1b1c1c1d1d1.X a2a2b2b22c2d2d2 F1 a1a2b1b2c1c2d1d2(出现杂种优势),首先由G.H.沙尔于1911年提出。后来E.M.伊斯特于1918年认为某些座位上的不同的等位基因（比如 A1和A2）在杂合体（A1A2）中发生的互作有刺激生长的功能，因此杂合体比两种亲本纯合体（A1A1及A2A2）显示出更大的生长优势，优势增长的程度与等位基因间的杂合程度有密切关系。 两个等位基因各自编码一种蛋白质，这两种蛋白质的相互作用的结果比各自独立存在更有利于个体的生存。例如，粉红色白色，获得的F1表现为红色；淡红色蓝色，获得的F1表现紫色。异质等位基因的存在常可导致来源于双亲新陈代谢功能的互补，或生理生化反应能力的加强等。,（3）杂种优势遗传理论-超显性说,超显性假说所说的杂种优势的生化基础至少有两种可能情况： 两个等位基因各自编码一种蛋白质，这两种蛋白质的相互作用的结果比各自独立存在更有利于个体的生存。例如人类的镰刀形血红蛋白杂合体（HbAHbS）的红细胞中同时存在着两种血红蛋白：成人血红蛋白（HbA）和镰刀形细胞血红蛋白（HbS）。杂合体既不是贫血症患者，又较不易为疟原虫感染，因而在疟疾流行的地区更有利于生存。 两个杂合等位基因所编码的多肽结合成为