微生物学06细菌的分类与命名课件

第一节 细菌的分类地位 第二节 细菌的命名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第四节 细菌分类的方法 第五节 细菌的分类体系 第六节 细菌的鉴定,第六章 细菌的分类与命名,Keywords,family 科 genus 属 species 种 subspecies 亚种 type 型 subtype 亚型 strain 菌株,第六章 细菌的分类与命名,一、生物的分类 六界：动物界、植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界、病毒界。 细菌分类层次与其他生物相同，即：界、门、纲、目、科(Family)、属(Genus)、种(Species)。,第六章 细菌的分类与命名,第一节 细菌的分类地位,1. 属（Genus） （P70） 是具有共性的若干种的组合，应与其他属有明显的差异。不同属之间的16S rRNA序列有较大的差异，差异应大于5%-7%。,第六章 细菌的分类与命名,第一节 细菌的分类地位,2. 种（Species) 生物分类的基本单位。凡属同种的生物，均具有共同的基本性状特征。它是生物在一定演化阶段，具有相对稳定的一定性状特征的实体。 16S rRNA序列同源性大于97%,第六章 细菌的分类与命名,第一节 细菌的分类地位,3. 种以下的分类单位 (1) 亚种(subspecies)：种内可能存在一些在某些性状上相互差异的类别。 (2) 型(type)与亚型(subtype)：仅仅是某一方面的性状， 如血清型。型内还可按进一步的性状差异区分为不同亚型。,第六章 细菌的分类与命名,第一节 细菌的分类地位,(3) 菌株(strain)：是指同种细菌中不同来源的纯培养物。 具有典型特征的菌株称为典型株或代表株或标准株。 不同菌株可能性状完全相同，也可能有某种微小差异。,第六章 细菌的分类与命名,第一节 细菌的分类地位,“双名法”命名（国际细菌命名法规） 由属名和种名两部分组成。属名（第一字母大写）在前，种名在后。均用拉丁文或拉丁化的文字表示。 在出版物中，属名和种名均应排成斜体。如Staphylococcus aureus 翻译时，种名在前，属名在后。,第六章 细菌的分类与命名,第二节 细菌的命名,未确定种名的细菌命名 ：在属名后加上sp.或spp.（正体）。 新种的命名：在学名之后加注sp. nov. （novo species）（正体）。 亚种的命名：ssp. 或subsp.（正体）。,第六章 细菌的分类与命名,第二节 细菌的命名,一、细菌分类的指征 1. 形态学特性 2. 培养特性 3. 生活方式 4. 生理生化特性 5. 抗原构造 6. 对噬菌体的敏感性 7对抗生素及其他化学物质的敏感性 8病原性 9遗传学特征。,第六章 细菌的分类与命名,第三节 细菌分类鉴定的标准,二、细菌种系发生关系的研究方法 1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定 （G+C）mol%含量：某一生物DNA中的G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的百分数（反映该生物遗传性状的一种本质特征）。 测定方法：梯度密度离心法、解链温度法(Tm)等。,第六章 细菌的分类与命名,第三节 细菌分类鉴定的标准,2）DNA或RNA同源性的测定 DNA-DNA杂交试验(hybridization) 原理：同源DNA单链或非同源DNA单链，只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互补的部分，就可产生不同程度的结合。,第六章 细菌的分类与命名,第三节 细菌分类鉴定的标准,2）DNA或RNA同源性的测定 应用：通过在体外测定菌株间DNA的杂合率，据此推算出DNA的相似程度，判断它们在亲缘关系上的亲疏，帮助分类鉴定。 DNA-RNA杂交试验,第六章 细菌的分类与命名,第三节 细菌分类鉴定的标准,3）rRNA的分析 rRNA在遗传信息传递中起重要作用，特别是16S rRNA 能反映各种细菌间在系统发生方面的关系。从该rRNA的碱基序列可绘制系统发生树。,第六章 细菌的分类与命名,第三节 细菌分类鉴定的标准,1. 数值分类法 2. 分子生物学分类法 3. 血清学方法 4. 化学分类法,第六章 细菌的分类与命名,第四节 细菌分类的方法,1. 数值分类法 根据数值分析，借助电子计算机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定位。,第六章 细菌的分类与命名,第四节 细菌分类的方法,国际系统与进化微生物学杂志 （International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,IJSEM) 分离鉴定的新细菌 论文副本 2年,第六章 细菌的分类与命名,第五节 细菌的分类体系,细菌分类有三个主要体系 前苏联、法国、美国 伯杰氏分类系统细菌学手册，该手册共四卷（1984-1989）。并于1994年出版了伯杰氏鉴定细菌学手册第9版，将细菌门分为33个部分，其中与兽医学和医学有关的计13个部分。,第六章 细菌的分类与命名,第五节 细菌的分类体系,国际著名的菌种保藏机构 ATCC（美国） （American Type Culture Collection) NCTC（英国） (National Collection of Type Cultures） CCTCC (中国） （China Center for Type Culture Collection）,第六章 细菌的分类与命名,第五节 细菌的分类体系,球菌 G+芽胞杆菌 G+菌 杆菌 抗酸染色阴性 G+无芽胞杆菌 抗酸染色阳性 丝状及树枝状,第六章 细菌的分类与命名,第六节 细菌的鉴定,球菌/球杆菌 MZN染色阳性 弧状杆菌 杆菌 中等大小杆菌 MZN染色阴性 丝状菌 螺旋状菌,第六章 细菌的分类与命名,第六节 细菌的鉴定,G-菌,小 结,细菌的分类基本单元是种，细菌种命名遵循双名法。 细菌分类标准主要长期以来以细菌的表型特征为依据的，近年来随着分子生物学技术的发展，人们对细菌基因认识更加深入，采用核酸分类方法逐渐得到认识，特别是根据16S rRNA基因