文献检索模板

医学文献检索综合报告一、 关于该课题的总体检索思想课题背景简介：近年来炎症学说在胰岛素抵抗, 肥胖及2-型糖尿病发病机制中的作用备受关注,炎症是指免疫系统所介导的、反复的慢性和亚临床性的过程,脂肪细胞也是重要的炎症细胞。脂肪沉积是一个复杂的生理过程,受饮食、内分泌、神经及脂肪组织自身等多方面的调控。本课题研究方向即探索高脂饮食与免疫机制的相互作用来研究糖尿病在这一方面的发病机制。检索课题涉及的主题概念：高脂饮食、自然免疫机制和2型糖尿病。选择数据库类型：该课题较新颖，侧重于基础和外文数据库的查询，并且兼顾中文数据库，以了解国内外的基本情况，为保证能够尽快了解最新进展，初步考虑查询近56年的文献。查询范围包括我校购买的电子数据库以及网络信息检索。查询文章类型不限可以是一次文献（如期刊论文），也可以是二次文献、三次文献（如综述）等。中文数据库检索关键词包括：“高脂饮食”或“高胆固醇饮食”、“自然免疫”或“免疫”、“糖尿病”。外文数据库检索关键词包括：high-fat diet/high cholesterol diet/high CHO diet(ary) Immune/immunity/immuno/immune,natural diabetes mellitus/diabetes/diabetic鉴于不同单词词形多变，可采用通配符来代替：high-fat diet or high cho* diet, immun*, diabet*.检索的总体思路：先查询CBMDisc数据库，了解各检索内容的中、英文主题词并且查询文献，可获得文献摘要及部分全文（与VIP链接）；再查询CNKI等全文数据库，利用主题词与自由词相结合的方法提高查全率和查准率。英文数据库可先参MEDLINE提供的主题词库，并同时查询文献摘要；再查询PubMed获取题录、摘要及部分全文。接着查询全文数据库如OVID平台、blackwell数据库、SCI等；最后查询事实型数据库及网络信息资源。二、 检索工具及检索过程 （一） 中文数据库1 CBMDisc CBMDisc数据库是文摘型数据库，可以进行主题词检索、直接检索、索引表检索、分类检索、期刊检索等；可进行逻辑运算符检索、通配符及字段限定符进行检索；还可以进行查询结果（检索史）的逻辑组配，也可以二次检索。我们先查找主题词，利用主题词与自由词相结合的方法提高查全率。另外考虑我国关于这方面文章可能不是很多，暂时不限制年限。具体步骤如下： 进入检索界面，先查找主题词。查询界面如下 分别输入检索词“糖尿病”、“高脂饮食”、“免疫”查询结果为：2型糖尿病糖尿病，2型，diabetes mellitus,Type 2;高脂饮食没有相应主题词，只有相近的膳食，胆固醇，cholesterol dietary免疫免疫，天然，immunity/immunity ,natural 检索“膳食，胆固醇”的相关文献为零篇，考虑用“高脂饮食”查找较合适。若使用逻辑组配式直接检索结果如下 因此不能直接使用逻辑组配各检索词，否则造成漏检。文献的检索 方法一、直接在检索栏里缺省状态下输入“高脂饮食”，对所有字段检索。检索后再分别检索其他关键词“高胆固醇饮食”，“糖尿病”“免疫”。 得出 #1 高脂饮食。164篇 #2 高胆固醇饮食。 131篇 #3 糖尿病。62789篇（该处不写2型糖尿病是因为许多作者在发表文章时直接笼统地写为糖尿病） 4免疫。23581篇（为提高查全率，该处用免疫这个范围较大的词） #5 （#1 or #2） and #3 and #4。16篇摘抄题录如下方法二、主题词检索。按功能键F9或屏幕上的主题检索，输入自由词，可进入主题词轮排表，可见到中英文主题词、树形结构（上位词、下位词）等，具体见步骤。选择相应的副主题词，按右边的检索按钮，进行检索。如果完全用主题词检索，则“高脂饮食”的主题词检索为0篇，又因其余的“免疫、糖尿病”自由词就和主题词相一致，故其余的检索结果与上同。由此可知，用中文的主题词检索有时会造成漏检。摘抄题录如下高脂饮食诱发大鼠胰岛素抵抗后肿瘤坏死因子-的改变鲁瑾; 邹大进; 张家庆第二军医大学附属长海医院内分泌科 200433中国糖尿病杂志 1999.10.18; 7(5): 284-286赵家伟,李秀钧. 胰岛细胞胰岛素抵抗: 2型糖尿病发病机制的主角? 中华内分泌代谢杂志, 2004, 20: 1832184.2. CNKICNKI是全文数据库，按学科知识属性分为九个专辑，医学的文献可在“医药卫生辑专栏目录中查询，因为CNKI不能进行检索史的组合，检索时可采用高级检索或专业检索。检索时注意几点：一是运算符与其他数据库不同，“*”表示“与”，“”表示“或”，“”表示“非”，不能用括号优先运算。二是关键词不同于CBM中的自由词，CNKI中的关键词由作者提供，用关键词可能降低查全率。方法一、高级检索步骤：进入界面，点击高级检索，限定检索区域为“内分泌腺及全身性疾病”，在“篇名/关键词/摘要”中检索，分别输入检索词，如上图所示，若将“高脂饮食”和“高胆固醇饮食”分别放入两个检索框用“或者”连接，则检出18篇，若将二者放入同一检索框，用“”来实现逻辑关系“或”，则检出19篇，由此可见，在CNKI中检索，用“或”连接的检索项尽量在同一框中输入，可以提高检出率。但是浏览摘要就会发现完全与检索意向相同的很少，考虑原因为最初检索时就已经限定了检索区域为“内分泌腺及全身性疾病”，再用“糖尿病”去限定，则范围过窄。改为“高脂饮食高胆固醇饮食”并且“免疫”，结果查出23篇。摘抄题录如下【篇名】 高脂饮食肥胖大鼠胰岛细胞胰岛素抵抗机理的探讨 CAJ原文下载 PDF原文下载 【作者】 邬云红. 李秀钧. 李宏亮. 王煜. 张玄娥. 柯柳. 张祥迅. 【刊名】 中华医学杂志 2005年27期 编辑部Email 中文核心期刊要目总览来源期刊 “中国期刊方阵”入选期刊 ASPT来源刊 CJFD收录期刊 【机构】 四川大学华西医院内分泌科糖尿病研究室 . 四川大学华西医院内分泌科糖尿病研究室 610041成都. 【篇名】 高脂饮食对2型糖尿病大鼠肾脏核因子-B表达的影响 CAJ原文下载 PDF原文下载 【作者】 张亚萍. 陈璐璐. 王咏波. 王保平. 张皎月. 【刊名】 中华肾脏病杂志 2005年03期 编辑部Email 中文核心期刊要目总览来源期刊 ASPT来源刊 CJFD收录期刊 【机构】 华中科技大学同济医学院附属协和医院内分泌科 . 华中科技大学同济医学院附属协和医院内分泌科 430022 方法二、二次检索限定在“内分泌腺及全身性疾病”中检索，现查“免疫”2048篇，再结果中二次检索“高脂饮食”，共检出1篇，所以这种方法查全率不高。方法三、专业检索用组合逻辑式进行精确检索，结果和高级检索相似。（二）、外文数据库1、MedlineMedline数据库是文摘型数据库，有主题词表、副主题词表可供选择查询，可用通配符、逻辑运算符等组配，可进行检索史的组合。选定年限20002005年。步骤：进入界面，先查询主题词，主窗口下点击“Thesaurus按钮在CBM中已经检索过相关英文主题词表，但是是通过中文来查找英文的主题词，不如在medline中直接。查到相应主题词为High-fat diet. cholesterol dietary/dietary fatImmune.immunityDiabetes.diabetes在检索主界面下或直接在主题词表下通过选择副主题词来检索结果为 1 immunity1695篇 2 Immune68312篇 3Immun*.422680篇（有不同形式词存在） 4 Fat dietary.1284篇 5 High-fat diet804篇 6 Diabetes.64591篇 #7 Diabet*.72161篇（因为有些文献可能出现diabetic等词） #8 #3 and #4 and #7.28篇摘抄题录如下Rodrguez-Villar C, Manzanares JM, Casals E, et al. High-monounsaturated fat, olive oil-rich diet has effects similar to a high-carbohydrate diet on fasting and postprandial state and metabolic profiles of patients with type 2 diabetes. Metabolism 2000;49:15117.Ordovas JM. Gene-diet interaction and plasma lipid responses to dietary intervention. Curr Atheroscler Rep 2001;3:2008. 4、PubMedPubMed数据库也是文摘型数据库，但有些文章可链接免费全文。与Medline相比，PubMed收录范围更广，收录时间更早，更新速度快，检索途径人性化、个性化，自动词语匹配。也能进行布尔逻辑运算及截词检索，可通过网络免费检索。另外还可设置My NCBI,将更新内容定期发至用户邮箱，省去重复检索的麻烦。下面用自由词来检索，若直接输入检索式的组合，结果如下故考虑用检索史适当组合，结果如下点击6的结果可见以下界面，其中有橘黄色的为永久免费全文，有绿色的为有免费全文，第三个图标表示只有摘要。 可见用检索史的组合可提高查全率。摘抄文摘如下Vessby B, Uusitupa M, Hermansen K, et al. Substituting dietary saturated for monounsaturated fat impairs insulin sensitivity in healthy men and women: the KANWU Study. Diabetologia 2001;44:3129van Dam RM, Willett WC, Rimm EB, Stampfer MJ, Hu FB. Dietary fat and meat intake in relation to risk of type 2 diabetes in men. Diabetes Care 2002;25:41724.5、WOK平台数据库SCISCI和一般的参考数据库不同，除了其他数据库的功能外，还提供功能强大的引文检索。所以能方便的对检索结果进行分析、总结及扩展。检索年限为2000年至2005年。1 high-fat diet.3223篇# 2 immune100,000篇#3 diabetes100,000篇#1 and #2 44篇#2 and #33416篇#1 and #2 and #34篇由此可见单单这样搜索，命中率很低，还需进一步到引文中查找信息。如选中其中的第一作者查找相关文献。摘抄题录如下Arkan MC, Hevener AL, Greten FR, et al.IKK-beta links inflammation to obesity-induced insulin resistance NATURE MEDICINE 11 (2): 191-198 FEB 2005 Times Cited: 16 Keren P, George J, Keren G, et al.Non-obese diabetic (NOD) mice exhibit an increased cellular immune response to glycated-LDL but are resistant to high fat diet induced atherosclerosis ATHEROSCLEROSIS 157 (2): 285-292 AUG 2001 Times Cited: 2 Mito N, Hosoda T, Kato C, et al.Change of cytokine balance in diet-induced obese mice METABOLISM-CLINICAL AND EXPERIMENTAL 49 (10): 1295-1300 OCT 2000 Times Cited: 156、OVID平台OVID数据库为全文数据库，选择检索Zhongshan University jouralsovid。与其他数据库不同的是检索史组合时，检索式前不需加“”，直接输入“1 and 2”即可；另外在输字段限定格式时，形式是“检索词.字段名.字段名。当鼠标指向“Advanced Search”时并没有变成可点击的I，是因为OVID默认的检索界面为高级检索页面。检索年限为1993年2006年（因为考虑前几个数据库搜索出的文章并不太多，所以先不设年限限制）输入检索词，得出结果为1 high-fat diet.1175篇2 immnue.47075篇3 diabetes.51316篇1 and 2.201篇2 and 3.5935篇1 and 2 and 3.84篇得到检索结果太多，考虑原因有年限较长。现缩小检索范围，限定年限为2000年2006年，可检出结果如下1 high-fat diet.885篇2 immnue.33353篇3 diabetes.37773篇1 and 2 and 362篇摘抄题录如下van Dam, R. M., Willett, W. C., Rimm, E. B., Stampfer, M. J. & Hu, F. B. (2002) Dietary fat and meat intake in relation to risk of type 2 diabetes in man. Diabetes Care 25:417-424.Sanz, M., Lopez-Bote, C. J., Menoyo, D. & Bautista, J. M. (2000) Abdominal fat deposition and fatty acid synthesis are lower and -oxidation higher in broiler chickens fed diets containing unsaturated rather than saturated fat. J. Nutr. 130:3034-3037.7、引擎搜索MedscapeMedscape 是目前最大的免费提供临床医学全文和继续教育资源的网站。我们选择文献搜索功能。进入主页/，然后免费注册，再返回主页，进入Resource Center。先选择一般搜索，按相关度排序，用逻辑式组配，不作限制，结果如下再进行高级检索，限定年限2000年至今，在内分泌和代谢病中检索，仍按相关度排序。高级搜索结果数量比简单检索减少50以上若显示给医务人员的文章，仍按相关度排序，有12篇。摘抄文摘如下Targeting Abdominal Obesity to Reduce Cardiovascular Risk in Patients With Type 2 Diabetes CME Louis J. Aronne, MD, FACP; Alan D. Cherrington, PhD; Richard N. Bergman, PhD; Robert R. Henry, MD; Priscilla Hollander, MD, PhD; Stephen C. Woods, PhD DisclosuresRelease Date: December 16, 2005; Valid for credit through December 16, 2006DASH Diet May Reduce Risk in Patients With Metabolic Syndrome CME News Author: Laurie Barclay, MDCME Author: Charles Vega, MD, FAAFPDisclosuresRelease Date: December 6, 2005; Valid for credit through December 6, 2006 三、综合分析（一）对各个数据库的评价1、CBMdisc数据库学科涉及广泛，功能强大，有英汉对照医学主题词注释字顺表，检索方式灵活，可以自由词检索，也可以主题词搭配副主题词检索，可进行精确检索和模糊检索，有二次检索功能，可以进行检索史的组合，可与VIP全文数据库链接，页面简单，查询速度较快。是国内生物医学文献最重要的数据库。2、CNKI数据库是中文全文数据库。有中心站、华师站（电大站）可供选择，其区别是中心站收录1994年以后的文献，而华师站、电大站收录年限可追溯到1979年。阅览文献时最基本的需要PDF阅读器，几乎每篇文章都有PDF格式，方便下载。但有些文章需要CAJ浏览器才能打开。没有检索史可供组合，但可以进行高级检索和专业检索，检索词之间用“”“”连接。可限定查询的学科范围，但查询速度较慢，经常会要求重新登陆。3、Medline数据库是较早引入我国的一个外文文摘型数据库。我校购买的是光盘版的，XP系统的用户不能使用Window版，能使用web版数据库，光盘数据库按月更新。可以很方便地查询到主题词表，用主题词搭配副主题词可较快检索，适用于有医学专业知识的用户。可进行检索史的组合，没有全文数据库链接。4、PubMed数据库外文文摘型数据库，提供部分免费和付费全文链接服务。可通过网络途径免费检索。具有强大的链接功能。可提供个体化服务，如储存个人检索式的My NCBI服务（需要免费注册）。有多种检索方式，可以自动词语匹配，不用象在Medline里那样用主题词很繁琐，不用怕漏检。可以很方便的进行逻辑组配和检索史组合。但打开检索结果时较慢，有全文的很多只有HTML格式的文章，而没有PDF格式的，不方便下载。5、SCI数据库是外文引文检索型数据库。收录广泛、综合性较强，权威度高选录的是被引频次最高的文献，有功能强大且独特的引文检索功能。并且可利用引文检索快速方便地了解某个研究地的发展趋势，研究的主要人员是谁，那些机构在做这方面的研究，进展如何。也有WOK平台的个性服务，需免费注册。查询速度较快。6、OVID数据库有全文外文数据库，我校购买了一部分。有很多超链接，提供多种文章格式如PDF,HTML等。默认高级检索界面，检索速度中等。与其他数据库不同之处在于，检索式逻辑运算时不需加“”，默认检索词限定字段为mp(kw,ti,ab)，格式不同，不要加in，直接用“.”隔开即可。7、引擎搜索Medscape提供免费临床医学全文及继续教育资源，是专业型外文网站，用户不必要是校园网用户。查询资料前需免费注册，可按专业学科非类查询，有基本检索和高级检索，可以在检索框内直接输入逻辑式，方便简单，检索结果可以按相关度（Relavance）或出版时间（Time）排列。不知道该网站会不会象Medical Matrix开始收费。（二）、个人体会除了上述看法外，通过文检课的学习及实践，我认识到检索前首先应分析检索课题，了解课题侧重于科研还是临床，内容新还是旧，以决定选择哪个或哪类数据库。课题包含哪几个概念，各有什么不同的词形结构，需不需要用截词符或通配符。检索时要注意多数数据库不能直接输入检索式的逻辑组合（搜索引擎可以），不同的数据库有细微的但需注意特点，查询时要注意，如CNKI用“*”表“和”，用“”表“或”，OVID检索式前不加“”等等。一些数据库需免费注册才可以得到更多的服务，在注册时可使用相同的用户名和密码，以免遗忘。检索出结果时，若结果太少时需检查原因，是否检索策略有问题，确定没问题的话可以放宽检索要求，如检索年限、字段限制等；若检索结果过多的话，可加以限制，如缩小年限。查询时要兼顾查全率和查准率，用主题词和副主题词搭配时可增加查准率，用主题词和自由词搭配可提高查全率。对于有些数据库可以免费注册以获得更优服务。就这一课题来说，在外文数据库中找到较多文献，其中OVID和PubMed找到的较多，中文的CNKI检出较多，但速度太慢。因此在处于学习文检课的初级阶段，需要多个数据库联合使用，不断摸索，逐渐提高检索效率和质量。（二） 针对所选课题，与课题最密切相关的文献有 高脂饮食诱发大鼠胰岛素抵抗后肿瘤坏死因子-的改变鲁瑾; 邹大进; 张家庆第二军医大学附属长海医院内分泌科 200433中国糖尿病杂志 1999.10.18; 7(5): 284-286【篇名】 高脂饮食肥胖大鼠胰岛细胞胰岛素抵抗机理的探讨 CAJ原文下载 PDF原文下载 【作者】 邬云红. 李秀钧. 李宏亮. 王煜. 张玄娥. 柯柳. 张祥迅. 【刊名】 中华医学杂志 2005年27期 编辑部Email Vessby B, Uusitupa M, Hermansen K, e