夏红剑毕业设计开题报告.ppt

徐州工程学院毕业设计（论文）开题报告,课题名称：牛蒡18s rDNA序列和分子演化分析 学生姓名：夏红剑 学号：20070806228 指导教师：侯进慧 所在学院：食品（生物）工程学院 专业名称：生物工程,说 明,1根据徐州工程学院毕业设计(论文)管理规定，学生必须撰写毕业设计（论文）开题报告，由指导教师签署意见、教研室审查，学院教学院长批准后实施。 2开题报告是毕业设计（论文）答辩委员会对学生答辩资格审查的依据材料之一。学生应当在毕业设计（论文）工作前期内完成，开题报告不合格者不得参加答辩。 3毕业设计开题报告各项内容要实事求是，逐条认真填写。其中的文字表达要明确、严谨，语言通顺，外来语要同时用原文和中文表达。第一次出现缩写词，须注出全称。 4本报告中，由学生本人撰写的对课题和研究工作的分析及描述，没有经过整理归纳，缺乏个人见解仅仅从网上下载材料拼凑而成的开题报告按不合格论。 5. 课题类型填：工程设计类；理论研究类；应用（实验）研究类；软件设计类；其它。 6、课题来源填：教师科研；社会生产实践；教学；其它,研究背景,牛蒡是一种菊科牛蒡属的二年生草本植物,其肥大的肉质根是可食用且营养价值较高的农产品。其在江苏徐州的丰县地区种植面积占全国总种植面积的40%以上,产品出口到日本、韩国等地区,经济价值较高。在我国,牛蒡长期以来一直作为药用植物,在本草纲目等古籍上都有关于它药用价值的详细记载。近年来,人们加强了牛蒡的营养、食用和药理等方面的研究,逐渐认识到其抗菌、抑制肿瘤的效果,并有东洋参之称。因此牛蒡是一种值得深入研究开发的农产品资源 。 日本等东亚国家受中华传统医学影响，对牛蒡的药用价值情有独钟，开发出了许多食用品种，享有“蔬菜之王”的美称。由于牛蒡具有药用与食用双重利用价值，资源丰富，综合开发简便易行，被国家卫生部认定为“新资源食品”。牛蒡的开发不但能产生良好的经济效益，还能产生良好的社会效益和生态效益。 更深层次地去了解其功能特性就需要对其遗传物质DNA做研究。因为DNA分子贮存了决定物种的所有蛋白质和RNA结构的全部遗传信息；策划生物有次序地合成细胞和组织组分的时间和空间；确定生物生命周期自始至终的活性和确定生物的个性。因此，积极研究和探讨牛蒡基因组DNA和其序列,对开发相关牛蒡保健食品，其提取物的利用均具有积极的理论和实践意义。本研究拟对牛蒡基因组DNA及18S rDNA序列进行分析，为研究牛蒡的实用价值提供基础资料，并为开发相应的牛蒡产品做准备。,研究内容,内容：（1）提取牛蒡基因组DNA。 选用植物基因组提取试剂盒对牛蒡基因组DNA进行提取。 （2）牛蒡基因组DNA的电泳实验。 使用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测其完整性. （3）使用PCR方法获得牛蒡18S rDNA序列。 （4）牛蒡18S rDNA序列分析 将获得的序列送往南京金斯瑞生物科技有限公司进行测序分析，通过双向测序，利用软件进行序列拼接，获得全序列。 (5) 分析分子演化的研究进展。 要求：熟悉科学研究方法和数据分析方法，以科学客观的态度认真完成实验分析工作，掌握DNA提取和18S rDNA序列分析方法。,实验步骤,1.牛蒡基因组DNA的提取。 依照植物基因组DNA的提取方法，经多次提取，获得了白色絮状的沉淀物,并室温干燥保存于TE溶液中。 2.电泳实验。 对所提取的DNA，使用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。 3.牛蒡18SrDNA PCR反应体系。 用2Long Taq PCR Master Mix来做PCR反应或用反应总体积为100L,其中LA-Taq Enzyme 1L, 10LA-Taq buffer(Mg2+plus) 10L,dNTP mixture(各2.5 mmol/L) 8L,模板DNA 2L,18S rDNA基因上、下游引物(20mol/L)各2L,ddH2O 75L来做PCR. 4.PCR产物的连接。 将通过PCR获得的目的基因与载体进行连接，用于测序实验。 5.化学转化。 DH5a感受态细胞的制备 6.筛选测序。 重组质粒的提取及鉴定 18SrDNA序列测定和分析,研究意义,日本等东亚国家受中华传统医学影响，对牛蒡的药用价值情有独钟，开发出了许多食用品种。牛蒡作为食疗蔬菜被搬上了餐桌，受到消费者的极大欢迎，且享有“蔬菜之王”的美称。由于牛蒡具有药用与食用双重利用价值，资源丰富，综合开发简便易行，被国家卫生部认定为“新资源食品”。但是目前牛蒡的国内市场开发较少，国人极少有食用习惯，这可能与栽培时间短、上市供应量少、尚不了解其营养价值有关。随着出口事业的发展，在国内大力宣传牛蒡的药用保健价值、食用价值，让人们逐渐了解牛蒡的食用方法，培养科学的饮食习惯，使牛蒡产品既有出口市场的规模又有国内市场作后盾，并逐渐由稀特蔬菜发展为日常蔬菜。牛蒡的开发不但能产生良好的经济效益，还能产生良好的社会效益和生态效益。 目前对其在DNA分子水平上的研究还很少。因此，对牛蒡进行分子水平上的研究很有意义。本文通过对牛蒡基因组DNA提取以及对其18SrDNA序列进行分析，对牛蒡的分子演化分析，相信本文的研究结果会为牛蒡的进一步研究提供很好的基础资料。,参考文献,1高明侠,苗敬芝,曹泽虹,等 双酶法提取牛蒡多糖的研究J 食品科学,2008,29(9):260-263 2汪晓琳 21世纪保健食品牛蒡J 烹调知识,2008,23:8-9 3王郁，吴学明，朱秀苗，等青海省牛蒡的种子萌发特性研究J安徽农业科学，2008，36(3)：889890 4檀子贞牛蒡的综合开发及展望J安徽农业科学，2O0634(12)：2698，2702 5张艳秋，风舞剑，赵虎，等牛蒡根结线虫病发生规律分析及综合防治J河北农业科学，2OO8，12(8)：3840 6 严奉坤，许兴，魏玉清，等.枸杞基因组DNA提取及指纹图谱分析J.时珍国医国药，2007，18（1）：46-48. 7 罗禹，王天志，杨兵，等.川芎DNA提取方法的研究J.华西药学杂志,2007，22（2）：124-126. 8 戴思兰，陈俊愉，高荣孚，等.DNA提纯方法对9种菊属植物RAPD的影响J.园艺学报,1996，23（2）：169-174. 9 张志红,谈凤笑,何航航,等中山大学学报(自然科学版),2004, 43(2):63-66. 10 汪小全,李振宇. rDNA片段的序列分析在苦