信息及文献的基本知识ppt课件.ppt

医学信息检索与利用MedicalInformationRetrievalAndApplication,一、信息与信息类型二、信息检索技术及其发展三、信息检索的基本概念及原理四、信息检索的基本步骤,一、信息的基本概念,信息知识文献情报,信息（information),广义：信息是指事物存在方式及其运动规律、特点的外在表现形式，以及信息活动中各种要素的总称包括了信息本体、与信息有关的人员、设备、技术和资金等各种资源。狭义：信息是指文献资源或数据资源，包括任何媒体中的片段、文章、图书、情报、观念等。,文献（literature）：记录有知识的一切载体情报（information）：解决特定问题所需要的知识,信息与文献、情报的关系：信息知识情报文献,信息的主要类型,1.按载体类型分：传统、电子文献2.按出版类型分：图书、期刊、特种文献3.按揭示内容程度级别分：一次文献二次文献三次文献零次文献,1.载体分类中的电子文献,光盘(全世界近2000种数据库，覆盖所有学科）网络（近100种搜索引擎可搜索几千万-上亿网页，基于internet检索系统，各种文本、超媒体、虚拟平台、网格）以上两种为主要存储和传输文献的载体,数字图书馆,电子文献的代表：“全球信息高速公路上信息资源的基本组织形式”“存储电子格式的资料，并对这些资料进行有效的操作”特点：信息存取多媒体化、信息组织有序化、操作电脑化、传输远程网络化、资源共享化结构连接化（跨库连接无缝化）ovid,电子文献的文件类型,文本型:Txt，DOC,PDF(Acrobatreader),超文本/超媒体型(hypertext/multimedia):HTML,XHTML(eXtensibleHypertextMarkupLanguage)JPG,流媒体视频点播VOD,网格：21世纪出现的第三代因特网。即把整个因特网整合成一台巨大的超级计算机，实现计算、存储、数据、信息、知识、专家资源共享。地区性、家庭性、个人网格。,2.按学术信息资源发布的类型：,图书：是指一些记录的知识比较系统.成熟的文献，比如教科书.专著.工具书等。期刊：是指一些记录的知识比较新颖.所含信息比较大的连续出版物，一般都有固定的期刊名称。如：中国科学、中华医学杂志等。特种文献：无法归入图书或期刊的文献，比如科技报告，学位论文，会议文献、专利文献等。,3.按信息著录级别分,一次信息源（primaryliterature)原始文献二次信息源(secondaryliterature）书目文献、索引三次信息源（tertiaryliterature）教科书、参考工具书、综述、零次信息源（口头交流的信息、电子论坛及各种国际组织、政府机构、学术团体、教育机构、企商业部门、行业协会等单位在网上发布的信息）,一次信息源（原始学术信息）：,是指原始的创造，首次记录科研成果，新技术，新知识，新发明，新见解。如期刊论文、学位论文、科研报告、专利文献、会议文献等。一次文献示例：,前置部分,正文,参考文献,正文,二次信息源（书目文献类）,图书馆目录OPAC，iPAC是按一定规律和方法编制成的查找图书馆文献收藏的工具，记录内容包括书名、期刊名、著者、以及主题、索书号等），可以从题名、著者名、期刊号、图书号等途径查找书目文献数据库等的检索工具、记录的内容包括文献中的题名、著者、原文的出处（刊登的期刊名称、年、卷期页、摘要、网址等，可以从任何实义词查找。,三次信息源,在阅读一次文献的基础上，分析综合归纳信息后，组织形成具有资料性、查考性、阅读性的文献（如教科书、综述、工具书、进展、调查报告等）综述(Survey,Review)是指综合分析和描述一定时间范围内，某一学科或专业科研发展、现状、并预测未来的一类文献。综述示例：,内容丰富、结构灵活的综述文献,现代三次文献事实数据库,二、信息检索技术及其发展,现代信息技术以计算机技术、通信技术和传感技术为核心，进行信息输入、信息存贮、信息输出、信息传递等。,（一）通信、硬件技术的发展：,1.脱机检索（20世纪50年代）2.联机检索（60年代末.70年代初）3.光盘检索（80年代）4.网络检索(90年代),脱机检索,联机检索,光盘检索,网络检索,计算机磁带数据库,终端,计算机磁盘、磁带数据库,通讯系统（卫星）,光盘数据库（单驱、塔网、镜像）,终端,用户,网络计算机（联机、光盘多媒体、超媒体）数据库,通讯系统,终端,终端,终端,（二）检索技术的发展巴伊赞.耶茨（RicardoBaezayates）2004现代信息检索,书目TableofContants:4000年历史,索引Index:目前仍是现代信息系统的核心现代发布ModernIssue:引擎、全文检索、多媒体、跨语种检索等（采用的技术包括Scanning扫描,opticalcharacterrecognized光点识别等）。,三、信息检索的基本概念及原理,信息检索基本概念:根据特定课题需要，运用科学的方法，采用专门的工具，从大量信息、文献中迅速、准确、相对无遗漏地获取所需信息（文献）的过程即信息检索。,用户,输入检索需求,分析转换处理需求,数据库,概念词典控制词表,信息源,筛选录入,分类索引文档预处理,信息检索的基本原理,概念词相关匹配运算,数据库及其结构,数据库由计算机进行处理的一定数量同类信息的有序集合，是用来存储和查找文献信息的电子化检索工具。,数据库的种类,书目数据库(Bibliographicdatabase)事实数据库(Factdatabase)数值数据库(Numericdatabase)全文数据库(Fulltextdatabase)超文本/超媒体系统（Hypertext/Multimediasystem),书目数据库的结构,文档顺排文档（记录）倒排文档（索引）记录(Record)字段(Field),字段举例,TI:Newantibioticsmiyakamidesproducedbyafungus.AU:Shiomi,-K;Hatae,-K;Yamaguchi,-Y;SO:J-Antibiot-(Tokyo).2002Nov;55(11):952-61IS:0021-8820PY:2002LA:EnglishAB:NewantibioticsMESH:*Antibiotics-biosynthesis;*Aspergillus-flavus-metabolismPT:Journal-Article,四、信息检索步骤,分析检索课题，明确检索要求选择检索工具，确定检索途径确定检索标识，确定检索运算构筑检索提问，获取初步结果调整检索策略，获取所需信息,1.科研课题常见信息需求：数据挖掘发现知识之类型,查找某概念的确切含义：如“什么是端粒酶”查找某概念的背景知识如：“谁最先发现了传染性蛋白”查找某些事物的数值及量化指标:如“2003-2004我国肺癌的发病率”如“阿司匹林的中毒剂量”查找某一类学科一般知识：如“有关分子生物学有哪些专著”查找学科专业领域的新进展:“有关端粒酶与白血病相关性研究的综述文献”查找专业课题相关的研究文献；“端粒酶在诊断白血病方面的价值评估”,特征型知识（事实、数值类数据库、搜索引擎）,关联型知识（文献数据库）,2.选择检索工具：,书目、文摘数据库：广泛获取检索课题相关的学术文献概况全文及网络数据平台：检索重要研究论文或综述学术全文网络检索引擎、事实、数值数据库：检索具体数值、特征、事实信息（如名词解释、统计数据等）或广泛的信息概况,枫林校区数据库查询环境,图书馆各阅览室、院系教研室、宿舍有免费查询校园网大部分数据库（全文、文摘、网络、光盘）的计算机。4楼电子阅览室有200台计算机，其中14台为免费区，上机不收费，但须办证才能上机。校外代理服务器,3.确定检索途径及检索标识,分类检索：分类名、分类号主题检索：自由词、规范词著者检索：姓名刊名：缩写引文：著者、关键词机构检索：缩写与全称,分类检索浏览学科、专业信息,中图法中国图书馆分类法Q生物学R医药卫生R1预防医学与卫生学R1R6外科学,分类号,分类名,规范词（规范主题词subjectheadings)检索系统规范词表控制的统一检索用词,文章A著者用词renalfailure规范词：kidneyfailure,文章B著者用词kidneyfailure规范词：kidneyfailure,词表中：renalfailureseekidneyfailure,自由词检索任意词检索,自由词著者写文章时所用的自然词语,在title,keyword,abstract,fulltext中检索。无系统规范词表情况下使用：(计算机，电脑，微机）查最新的文献时使用：（禽流感）,一体化医学语言系统（UMLS）UnifiedMedicalLanguageSystem,1.元叙词表：提供95多个生物医学辞典和分类法、词表，210多万词汇。2.语义网络：提供语义分类、语义关系、语义结构等。3.专家辞典：提供不同构词和句法信息应用：PubMed,MWS，CliniWebInternational,机构检索,机构检索以机构名称为检索词，来查该机构学者发表的文献。常见字段名称：address，addressword，institution，organization。,刊名检索,刊名检索检索指定刊物上发表的文献刊名全称NewEnglandJournalofMedicine刊名缩写NEnglJMed,引文检索法,引文回溯：是指通过文献原文后附有的参考文献（被引用文献）来查找文献的一种方法，它有助于研究课题的前期工作基础、相关文献，经典著者，重要期刊等。引文检索：是指通过被引用文献，来检索文献的相互引证关系的情况，包括：某一著者的文献被什么人、什么文章引用？引用的频率？某些期刊被文献引用的频率？某些文献的主题被引用的频率等。,【参考文献】1.张嗣芳，汪晶莹，柳秋云，等干扰素2b短疗程治疗98例肾综合症出血热J中华传染病杂志，2000,18:572.杨为松，黄长形.肾综合症出血热研究的现状与未来J中华传染病杂志，1996,14:1913.4.王耀宗，徐伟，李莉，等W肾综合症出血热抗病毒治疗的实验研究JW中华传染病杂志，1994,12:69,引文回溯例：,冯智霖，徐邦强.干扰素-1b治疗肾综合症出血热的临床疗效.中国临床药学杂志.2003，12(1)：9-10参考文献,引文检索从“被引用文献”（citedpaper）检索到“引用文献”(citingpaper),例：1994年至2003年华罗庚教授的著作被别人引用的情况，并按相关度排序,最后一页,引文数据库,Webofscience中国科学引文数据库全文数据库、文摘数据库中的引文（参考文献）字段检索专业引文数据库,默认检索,默认检索又称缺省检索、隐含检索，在检索系统预先设定的多个字段中进行检索。Medline默认在标题、著者、出处、文摘、主题词等字段中检索。CBMDisc默认在标题、关键词、主题词、特征词、出处、文摘字段中检索。,数据库中的各种检索方式,分类浏览Categorybrowse简单检索Simplesearch,Basicsearch高级检索advancedDetailedFocussearch专家检索Expertsearch,全文数据库检索方式界面例：,确定检索标识,课题：序列分析研究工具和方法的相关文献检索标识：序列分析（sequenceanalysis)工具（instrument,tool)方法（method,plan,technique,way),4.确定检索运算符（operator）,布尔算符：and，*（逻辑与）or，+（逻辑或）not，-（逻辑非）位置算符：有near,N,W,adj等形式字段限定符：常用的有in.=截词符：*，？,布尔算符,AB,AandB,B,AorB,ABAnotB,运算次序：notandor,A,序列分析and方法,工具or方法,序列分析not综述,布尔算符应用举例,课题：序列分析的工具和方法序列分析and(工具or方法)sequenceanalysisand(instrument*ortool*ormethod*),位置算符应用举例,序列分析更具体的概念词检索：Sequencenear3analysisNear：检索词出现在同一句子中，near3表示两个检索词中间最多允许插2个词。SequenceAminoAcidAnalysis；SequenceProteinAnalysis；SequenceDNAAnalysis；SequencePeptideAnalysis；SequenceRNAAnalysis；,字段限定检索举例,hepatomainti标题中检索smith-binau著者字段检索anemiainti,mesh标题或MeSH字段检索natureinso检索期刊Nature上的文章reviewinpt检索综述文献综述inpt同上la=english检索语种为英语的记录,截词符检索举例,用computer*可检索到含有以下词的记录computerscomputeredcomputerizeComputerizationComputer?能多检索到computers的记录,5.构筑检索提问（式）,检索式又称检索提问式，是情报用户向检索系统表达文献需求的句式。简单检索式含一个检索词复合检索式含有布尔算符和至少两个检索词,检索式举例：课题1：人类序列分析的方法,自由词检索：(Sequencenear3analysis)intiand(method*ortool*orinstrument*)andhuman自由词检索限在ti字段中，可提高提高检索准确度,规范词检索：Explodesequenceanalysis/methods,instrumentationinmjmeandhumanExplode为规范词检索的系统扩展指令，可检索所有Sequenceanalysis的下位概念。mjme为主要规范词检索指令。methods,instrumentation为副主题词,副主题词(subheading)：,限定规范主题词某一方面内容的规范词:MEDLINE数据库82个：如：诊断：diagnosis,radiography,治疗:drugtherapy,radiotherapy,surgery病因:etiology,pathology,chemicallyinduced药物作用：therapeuticuse,adve