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问题:融解曲线前端不太正常。1:融解曲线形成原理融解曲线是不断升温至95过程中采集的荧光值。也就是说在不同温度条件下,DNA进行解链,荧光染料从双链中游离出来,从而出现荧光值的降低。但是当温度达到DNA解链一半的温度时,也就是Tm值时,荧光染料会大量游离出来,从而使荧光值迅速降低,最后转换成导数后形成高峰。利用荧光染料可以指示双链DNA熔点的性质,通过熔点曲线分析可以识别扩增产物和引物二聚体,因而区分非特异性扩增。图一:纵坐标为将荧光强度的变化对温度的变化求导。(-dI/dT)(融解曲线呈单一峰时,表示无非特异性产物,荧光定量准确)2:融解曲线的两种不同形式图二对图二曲线每一个位置求导,负导数(-dI/dT)作为纵坐标,得到图三:图三3:红色框位置曲线解释图四 融解曲线的采集过程中,温度的变化为每0.05s上升0.3,buffer成分(Tris-HCl)随着温度的上升,pH降低,导致SYBR Green 的荧光信号强度降低。因此在68-75度之间,虽然没有DNA双链解开,但是荧光信号发生降低。 温度在65-68之间(红色框框位置),虽然温度逐渐上升,但是荧光信号强度不变,可能的原因是:(1) 虽然温度上升,pH值降低,但是如果pH值依旧在SYBR Green完全发光的范围内,则荧光信号不发生变化。(2) 起始荧光信号过强,荧光信号在一定范围内的减弱不能被仪器检测到,因此显示的荧光信号不发生变化。4:AceQ融解曲线问题-为什么有时候在融解曲线的前端出现凹下去的曲线。以stepone one为例:图五 AceQ促解链成分相对较多,抑制退火延伸;因此在退火延伸阶段(60度,1min)存在部分链退火不充分;因此在信号刚开始采集阶段,部分链会继续退火形成双链,荧光信号增强,退火充分后荧光信号达到最大值,此后随着温度的上升,pH降低,导致
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