细胞外周血DNA提取ppt课件

实验三、外周血细胞基因组DNA的提取(NaI法),1,基因组DNA提取原理,Loparev等报道利用NaI提取DNA的方法，从全血制备白细胞DNA，可用双蒸水溶涨红细胞及白细胞膜，释放出血红蛋白及细胞核。加NaI破核膜并使DNA从核蛋白中解离，用氯仿/异戊醇抽提使蛋白质沉淀完全（异戊醇去泡沫），DNA存在于上层水相中，以异丙醇沉淀DNA，离心弃去异丙醇，并重复操作一次，即可获得白细胞DNA。,2,氯仿/异戊醇：使蛋白变性。氯仿的作用是蛋白变性剂、抽提脂溶性物质;异戊醇作用是A.降低表面张力、阻止气泡的产生(剧烈震荡时容易产生气泡，气泡会阻止相互间的充分作用);B.有助于分相(使离心后水相、有机相稳定)异丙醇：沉淀DNA70%乙醇：洗涤DNA;(盐、蛋白等溶于70%乙醇，而DNA不溶)100%乙醇：可以用于沉淀DNA，也可以用于使DNA快速干燥,3,限制性核酸内切酶作用原理,限制性核酸内切酶是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列（48bp），并对其进行切割的核酸内切酶。,4,PCR反应原理,基于DNA的半保留复制，两条链都可以作为模板。在体内，DNA复制是周期性的，所以基因扩增的数量有限；PCR技术在体外利用人工合成的引物，再加上DNA聚合酶和一些合适的底物和因子，通过对温度的控制，使DNA不断位于变性、复性和合成的循环中，达到扩增DNA的目的。,5,PCR反应反复进行三步骤的循环过程：热变性退火引物延伸1）热变性：基因组DNA在95下加热5分，双螺旋结构被热变性解链为两股单链。2）退火：将反应混合物降温至5565，引物与上述单链DNA上互补的序列杂交在一起，即退火，形成模板引物复合。3）引物延伸：将反应混合物调节至72，在DNA聚合酶作用下，以dNTP为原料，从引物3端开始，沿着53的方向，按照模板链的序列，合成一条新DNA链，其序列与模板序列互补。,6,7,8,器具和试剂,离心机、振荡器、Eppendorf管，移液器等抗凝人外周血，双蒸水，6MNaI溶液，氯仿/异戊醇，70乙醇，TE溶液,9,试剂,抗凝人外周血，双蒸水，6MNaI溶液，氯仿/异戊醇，70乙醇，TE溶液,10,步骤,1取外周抗凝血（全血）200ul于Eppendorf管中，12000rpm离心12min。2.弃上清，加双蒸水200ul溶解，摇匀20s。混匀后加6MNaI溶液200ul，充分摇匀20s。3.加入氯仿/异戊醇（24：1）400ul，边加边摇，摇匀20s，12000rpm离心12min。,11,步骤,4.取上层液350ul，加入另一新Eppendorf管中，加210ul异丙醇，重新摇匀20s，室温放置15min，静置后的反应体系15000rpm离心12min，使沉淀紧贴Eppendorf管壁。5.弃异丙醇，加70乙醇1ml（不振动，可轻轻颠倒混匀），以15000rpm离心12min。,12,步骤,6.弃乙醇，敞开Eppendorf管盖，烘干（37恒温箱）后，加1xTE溶液30ul，溶解DNA。（制成的DNA液置于-20冰箱保存备用）7用DNARNACalculator检测DNA的含量和纯度。纯DNA的此比值约为1.82.0。纯RNA的比值约为大于2.0。,13,步骤,8、限制性内切酶酶切：下述各试剂加入Eppendorf管内：a、涡旋混匀，短暂离心。b、置恒温水浴箱内，按EcoRI限制酶的活性温度要求，37酶解过夜C、置于4或-20保存。,14,步骤,9、聚合酶链式反应：a、25ul标准PCR反应体系各成分终