卢彦平-产前诊断相关技术及其临床应用简介课件.ppt

新一代测序技术及其在产前诊断领域的临床应用,解放军总医院妇产科卢彦平,遗传病的分类,染色体病：多基因病单基因病：孟德尔遗传病非典型遗传方式的单基因病,数目,结构,常规核型可见,微缺失，微重复,染色体病,数目异常,整倍体：,四倍体：92XXXX，92XXXY,三倍体：69XXX，69XYY，69XXY,非整倍体：,单体型：45,X;45XX,-21,三体型：21-三体,18-三体13-三体,47XXY(Klinefelter综合征),四体型：48,XXXX;48XXXY.,染色体病,结构异常,倒位（inv）：9号染色体臂间倒位,缺失（del）：猫叫综合征（5p-,重复（dup）,易位（t）：有无遗传物质的丢失,插入（ins）,环形染色体（r）,环形染色体（r）,双着丝粒染色体：（dic）,假双着丝粒染色体（psudic）,染色体病的筛查与诊断,环形染色体（r）,筛查血清学的筛查无创胎儿非整倍体检测（NIPT),诊断取胎儿细胞进行核型分析绒毛取样取羊水取脐带血基因芯片（CMA）全基因组测序,核型分析适用范围,主要针对染色体数目异常、大的结构异常核型分析是产前诊断的基础。需要对胎儿细胞进行培养（包括绒毛、羊水、脐带血）,其是羊水细胞培养有一定的难度。优点：价格便宜，直观、可以检查染色体数目异常及大的结构异常（5Mb）无法判断染色体上微小片段的缺失及重复异常。,CompanyLogo,严重智力低下：100%，小头畸形50%枕骨扁平53-82%发际低80%颈部皮肤赘生皱褶80%无意识做鬼脸90%眼距宽，外眼角上斜80%伸舌各种先心病手短、宽通贯手（双手）小耳朵鼻根低平,21三体,CompanyLogo,21-三体,NT6mm鼻骨缺失/发育不全长骨短肾盂积水，单独不作为穿刺指征心脏缺陷肠道强回声：约7%21-三体患儿,21三体：NT厚，心脏畸形,301,CompanyLogo,新生婴儿中的发生率为13500-8000，父、母亲高龄女孩比男孩发生率高，约为3-41寿命平均70天18三体综合征常为多发畸形,18-三体,CompanyLogo,18三体-多发畸形,颜面部：小下颌畸形、小眼、小嘴、小耳、耳位低颅脑畸形：草莓头45%，颅后窝池扩大、Dandy-walker畸形、小脑小、脉络丛囊肿肢体畸形：特殊握拳姿势、挠骨发育不良、挠骨缺如、拇指发育不良、并指等腹部畸形：小的脐膨出、膈疝肾脏：肾囊性发育不良、马蹄肾、肾积水心脏畸形：室缺，房室共道畸形、右室双出口其他：羊水过多，胎盘小，单脐动脉、脐带囊肿、脐静脉瘤、FGR,18-三体,301,301,301,CompanyLogo,13三体综合征（Pateau综合征）,发生率1/5000多合并重要畸形颅脑畸形：小头畸形、前颅无裂畸形、Dandy-walker畸形、颜面部畸形：独眼、长鼻、正中唇裂、双侧唇裂肢体畸形：多指（趾）畸形心脏畸形：室缺、房室共道畸形、左心发育不良、心室内强回声腹部畸形：脐疝、肾积水、多囊肾其他：FGR、羊水过多、胎儿水肿、NT厚,CompanyLogo,13-三体,30岁23周B超发现畸形：前脑无裂、正中唇裂、心脏畸形（右心大、左心小）、单脐动脉、脐疝、多趾畸形核型分析13-三体,301,性染色体异常,Turner综合征：45，X1/2500，女婴特征：FGR颈部水囊瘤原发性闭经、不孕，短颈、颈蹼、发迹低、身材矮小、肘外翻，15-50%合并心血管畸形,性染色体异常,克氏征（klinefeltersyndrome):47,XXY男性新生儿发病率为1/600-800，与母亲高龄有关表现：出生时表现正常，隐睾发生率高，身高较高，青春期中期出现睾丸功能紊乱，高促性腺激素性性腺功能低下，睾酮减少，除极个别情况外基本不育。,超雌（47，XXX；48，XXXX；49，XXXXX）发病率1/1000女婴，与母亲高龄相关。特征：外表正常，身材较高，智商较同胞稍低，语言能力差，社会适应能力差超Y:47，XYY，48，XYYY，49，XYYYY1/1000男婴特征：出生时无异常，从2岁开始发育速度加快，身高比正常人高，智商略低于同胞，但在正常范围。部分脾气暴躁，有对抗性行为，犯罪主要与低智商有关。可生育正常后代。,性染色体异常,微缺失重复的检测BoBs基因芯片全基因组测序,Wolf-Hirschhorn综合征-4p16.3缺失,具有特殊面容：头小而长前额突出。中线头皮缺陷。眼距宽内眦赘皮，鹫形鼻，高眉弓直通眉心，人中深、短下颌小而后缩。耳大且低，结构简单掌纹复杂，脚趾不规则生长发育障碍、智力低下、肌张力减退、癫痫、先心病、骨骼畸形等各种异常,Williams-beuren(7q11.23),spanning1.5millionto1.8millionbasepairsandcontaining26to28genes.,临床表型包括心血管疾病、特殊面容、神经行为异常和一过性婴儿期高钙血症特征性面容：张嘴凸唇，鼻梁扁平，鼻孔朝天，长人中，小下颌，星状虹膜和斜视，牙齿缺失，牙釉质缺陷，牙齿稀疏，咬合不正。非凡的音乐才能,Langer-Giedion（8q23.2-8q24.1）,（毛发-鼻-指（趾）综合征）,Prader-Willi综合征,隐睾-侏儒-肥胖-智力低下综合征,大部分(70)有15q11q13父源缺失母源单亲二倍体（UPD）约占25少数(5)存在甲基化过程异常或单一致病的印记基因突变特征：临床以多食、肥胖、身材矮小、发育迟缓、出生后低张力、性腺功能低下以及生长激素缺乏为特征糖尿病面容：颌小畸形，耳畸形，牙齿缺损，齿列异常,Angelman综合征,快乐木偶综合征，天使综合征母源15q11.2-13缺失(约70)父源单亲二倍体,Miller-Dieker综合征（17p13.3）,无脑回、巨脑回胼胝体缺如面部异常小头、前额高低不平小鼻，伴鼻孔前倾，上唇有细小的朱红边线，耳位低，或后移隐睾、藏毛窦、第5指弯曲,Smith-Magenis综合征,染色体17p112微缺失或RAI基因杂合性突变自我伤害行为、痛阈低下；褪黑素分泌异常、昼夜睡眠颠倒、生物钟紊乱；喜将外物插入身体有孔部位，易怒。,AgeprogressionoffemalesubjectswithSMS.TypicalSMSinfantphenotypewithtentedupperlipanddepressednasalbridgeatbirth(a),atage4months(b),andwithhand-claspingbehavioratage1year(c)isshown.Awhitepatchonthedorsumofleftforearmduetoskinpickingisillustratedinatoddler(alsohandclasping)atage2years(d).Thesameindividualatages13years(e)and20years(f),andphotosat21yearsofageillustratingopenwoundsandscarringonforearmsfromskinpicking(g),brachydactylyandnail-yankinglesionsonhands(h),andfeetwithbrachydactylyandnailsdamagedfromnailyanking,Digeorge综合征,22q11.2缺失特殊面孔，如眼眶距离增宽，耳廓位置低且有切迹，上唇正中纵沟短颌小和鼻裂。常存在大血管异常，如法洛四联症和主动脉弓右位,染色体微阵列技术(CMA),CMA在全基因组水平进行扫描可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copynumbervariant，CNV)，尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排等具有突出优势。可检测从几十到上千kb的基因组缺失或重复。其检测水平由所用探针序列大小及两种探针序列间的距离决定基于比较基因组杂交的微阵列(array-CGH)基于单核苷酸多态性的微阵列(SNParray)。可以检出单亲二倍体和三倍体,产科、产前诊断领域的应用范围对自然流产、胎死宫内、新生儿死亡等妊娠产物的遗传学检测。对产前诊断中核型分析结果异常，但无法确认异常片段的来源和性质者进行DNA水平的更精细分析。对产前超声检查异常而染色体核型分析结果正常的胎儿进一步行遗传学检测。,局限性,无法可靠地检出低水平的嵌合体无法检出平衡性染色体重排和大多数的基因内点突变aCGH检测平台无法检出三倍体CMA的阳性检出率仍然较低，对于超声检查发现结构异常但胎儿染色体核型正常的病例，目前CMA增加检出致病性CNV的比例Amutation(G607S)intheendothelin-convertingenzyme-like1(ECEL1)geneinaconsanguineouspedigreeofTurkishoriginpresentingwithasyndromeofcamptodactyly,scoliosis,limitedkneeflexion,significantrefractiveerrorsandophthalmoplegia.ECEL1mutationswererecentlyreportedtocauserecessiveformsofdistalarthrogryposis.ThisreportexpandsonthemolecularbasisandthephenotypicspectrumofECEL1-associatedcongenitalcontracturesyndromes.,Abstract,Sendto:,Didntgetthemessage?Findoutwhy.SeecommentinPubMedCommonsbelowAmJHumGenet.2013Jan10;92(1):150-6.doi:10.1016/j.ajhg.2012.11.014.Epub2012Dec20.MutationsinECEL1causedistalarthrogryposistype5D.McMillinMJ1,BelowJE,ShivelyKM,BeckAE,GildersleeveHI,PinnerJ,GogolaGR,HechtJT,GrangeDK,HarrisDJ,EarlDL,JagadeeshS,MehtaSG,RobertsonSP,SwansonJM,FaustmanEM,MeffordHC,ShendureJ,NickersonDA,BamshadMJ;UniversityofWashingtonCenterforMendelianGenomics,Abstract,Sendto:,Didntgetthemessage?Findoutwhy.SeecommentinPubMedCommonsbelowAmJHumGenet.2013Jan10;92(1):150-6.doi:10.1016/j.ajhg.2012.11.014.Epub2012Dec20.MutationsinECEL1causedistalarthrogryposistype5D.McMillinMJ1,BelowJE,ShivelyKM,BeckAE,GildersleeveHI,PinnerJ,GogolaGR,HechtJT,GrangeDK,HarrisDJ,EarlDL,JagadeeshS,MehtaSG,RobertsonSP,SwansonJM,FaustmanEM,MeffordHC,ShendureJ,NickersonDA,BamshadMJ;UniversityofWashingtonCenterforMendelianGenomics,Abstract,Sendto:,Didntgetthemessage?Findoutwhy.SeecommentinPubMedCommonsbelowAmJHumGenet.2013Jan10;92(1):150-6.doi:10.1016/j.ajhg.2012.11.014.Epub2012Dec20.MutationsinECEL1causedistalarthrogryposistype5D.McMillinMJ1,BelowJE,ShivelyKM,BeckAE,GildersleeveHI,PinnerJ,GogolaGR,HechtJT,GrangeDK,HarrisDJ,EarlDL,JagadeeshS,MehtaSG,RobertsonSP,SwansonJM,FaustmanEM,MeffordHC,ShendureJ,NickersonDA,BamshadMJ;UniversityofWashingtonCenterforMendelianGenomics,AmJHumGenet.2013Jan10;92(1):150-6.MutationsinECEL1causedistalarthrogryposistype5D.Distalarthrogryposis(DA)syndromesarethemostcommonoftheheritablecongenital-contracturedisorders,and50%ofcasesarecausedbymutationsingenesthatencodecontractileproteinsofskeletalmyofibers.DAtype5D(DA5D)isarare,autosomal-recessiveDApreviouslydefinedbyusandischaracterizedbycongenitalcontracturesofthehandsandfeet,alongwithdistinctivefacialfeatures,includingptosis.Weusedlinkageanalysisandwhole-genomesequencingofamultiplexconsanguineousfamilytoidentifyinendothelin-convertingenzyme-like1(ECEL1)mutationsthatresultinDA5D.Ev