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文档简介
用NTSYSpc 2.10e制作聚类图(实例讲解)1. 在EXCEL表中先建立一个0,1构成的矩阵:按如下规则输入数据,A1=1表示有带记为1,B1=38表示AFLP/SSR/RFLP有38个条带,C1=60表示样本数,D1=0表示无带记为0。如图(每个列为一个样本的条带情况):2.将EXCEL数据复制粘贴到文本格式,命名保存sz2.txt。3.打开ntsys软件的,将文本文件导入软件中:点Similarity,选中Qualitative data, input file栏导入保存的 sz2.txt。在Output file栏输入sz3,点Compute,会出现一个报告:4.点Clustering, 选SAHN, input file栏导入sz3.NTS, Output tree file栏输入sz4, 点Compute,又会出现一个报告:5.点Graphics, 选Tree plot, input file栏导入sz4.NTS, 点Compute, 就出现一个报告和聚类图:因为默认设置显示样本数是30,需改变设置为60, 点聚类图的Options, 选plot options, 在Phenogram中的OTUs/page栏改30为60:点OK, 全部样本的聚类图就出来了:点File进行图片保存即可。注:F
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