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文档简介

1. 经过mriconvert转换之后，得到每个被试的4D数据，b值以及向量2. fslroi data nodif 0 1 %choose a no weighted imaging,named nodif从4D图像中选出一张需要的图像,0表示选择从第几个volume开始，1表示选择图像的个数3. bet nodif nodif_brain -m -f 0.2%generate binary brain mask（-m）, fractional intensity threshold is 0.2（-f）,result in the file nodif_brain_mask 去除头盖骨4. eddy_correct data eddy_unwarped 0%eddy_correct Choose interp from trilinear,spline def - trilinear %时间大概是10分钟5. Dtifit 使用ctrl+alt+t调出终端，输入fsl，选择fdt*下的dtifit，在option中手动加入对应文件，包括data的输入、输出，b值文件，梯度方向（矢量）文件，共4个。运行完成后，就可以得到FA图，MD图等-以上为预处理过程，一个人一个人的进行-%that processing is going in one subject separately-6. 打开生成的FA文件所在的目录7. tbss_1_preproc*.nii.gz 将每个人的FA图依次处理为tbss可处理的格式Ps：可能需要新建两个文件夹（一个为FA，一个为origdata）8. tbss_2_reg -T将FA图抽样到1x1x1空间，空间标准化9. tbss_3_postreg S把所有的FA图叠加到一起，生成4D文件mean_FA_skeleton10
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