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第八章 类药性及其评价方法和应用 候选药开发失败原因 药效和药代的关系 吸收 分布 代谢 排泄 强度 选择性 解决方法 在研发早期对ADME T进行评价 研发中药物 发现 临床前 一期二期三期临床 及时淘汰及早淘汰 理想模式 传统模式 ADMET 吸收 Absorption 分布 Distribution 代谢 Metabolism 排泄 Excretion 毒性 Toxicity ADMET 吸收药物从给药部位进入血液循环的过程口腔 胃 小肠 大肠 直肠 肺部 鼻粘膜 角膜影响吸收的理化性质如解离度 水溶性 脂溶性 溶出速度 稳定性 ADMET 分布药物从循环系统转运至各脏器 靶组织的过程药物结构的不同会导致分布情况产生显著差异如肝肾等消除器官 脂肪组织 中枢 与血浆或组织蛋白结合 ADMET 代谢药物的生物转化过程 即药物最终被转化为水溶性物质而易被排泄影响药效的强度 持续时间I相转化利用氧化 还原 水解反应生成极性基团II相转化将极性基团与内源物质结合生成易溶 易排出的结合物 ADMET 排泄药物从体内消除的过程主要途径肾排泄肝消除 胆汁 随唾液 乳汁 汗液 泪液 呼气排出 ADMET 毒性靶标毒性脱靶效应活性代谢物氧化应激应激状态下产生自由基或过氧化物 亲电试剂自由基亲核试剂氧化还原反应物 类药性 类药性就是指和已知药物的相似性类药性分子 具有类药性的化合物并不一定是药物 成药可能大类药性是药代动力学性质和安全性的总和 类药性评价 理化性质 分子量 亲脂性和pKa拓扑结构特征 可旋转键 氢键数目 极性表面积药代动力学性质 生物利用度 代谢稳定性 血浆蛋白结合率毒性特征 药物 药物相互作用 类药性评价方法 基于经验判断的类药性评价基于理化性质的类药性评价基于ADMET性质的类药性评价 一 基于经验判断的类药性评价 在已知药物数据库中提取与类药性相关联的理化性质和拓扑结构特征的基础上形成的经验规律用途 用于化学库 组合化学物库或虚拟化合物库 的早期设计和评价缺点 不能区别单个化合物是 类药 还是 非药 数据库 药物数据库世界药物索引 WorldDrugIndex WDI MDL药物数据报道数据库 MACCS DrugDataReport MDDR 综合药物化学数据库 ComprehensiveMedicinalChemistry CMC 非药物数据库现有化学品目录数据库 AvailableChemicalDirectory ACD 基于经验的类药性评价方法 Lipinski法Ghose法Verber法类药片段分析法非类药片段分析法 一 利平斯基规则 WDI数据库中总结Lipinski RO5规则 五倍率规则分子量 500氢键给体 OH和NH 5氢键受体 10CLogP 5 0或 MLogP 4 15 化合物如果违背上述规则中的两条或多条 就很难被生物体所吸收 二 Ghose法 CMC数据库中80 药物的理化性质具有以下特征分子量在160 480之间 平均357原子数在20 70之间 平均48ALogP在 0 4 5 6之间 平均2 52摩尔折射率在40 130之间 平均97 三 Verber法 Lipinski的补充极性表面积PSA 140 2 或氢键供体和受体数之和 12 可旋转单键数 10 四 类药片段分析法 对CMC数据库中的药物分解为骨架和侧链 类药片段分析法 CMC数据库5121个分子中含有1179组不同的骨架32个骨架出现在50 的药物分子中六元环是最常见的结构1246组不同的侧链20中最常见的侧链出现的频率73 最常见 羰基 甲基 羟基 甲氧基 常见骨架 常见骨架 常见的侧链片段 五 非类药片段分析法 非类药性化合物 non drug like分子特征可能导致毒性 生物利用度低下等不适宜成药的特性 排除非类药化合物的标准 分子中存在 非药物 元素 如过渡金属元素 相对分子量小于100或大于1000碳原子总数小于3分子中无氮原子 氧原子或硫原子分子中存在一个或多个预先确定的毒性或反应活性子结构 常见的毒性或反应活性子结构 可以和蛋白质形成共价键并产生假阳性或毒性 二 基于理化性质的评价 亲脂性pKa水溶性 一 亲脂性 亲脂性是药物吸收 分布 代谢 排泄和毒性的主要决定因素之一亲脂性与溶解度 透膜性 代谢稳定性 蛋白结合率密切相关脂水分配系数logP 中性化合物的脂水分配系数logD 酸性或碱性化合物在特定的pH条件下的脂水分配系数 脂水分配系数 logD可由化合物的logP与pKa计算在一定的pH条件下 有机弱酸与有机弱碱化合物的计算公式分别为 亲脂性 测量方法 高通量摇瓶法 毛细管电泳法和反相色谱法预测方法 AlogP ACDlogP ClogP MlogP XlogP 二 pKa pKa决定水溶性和透膜性的主要因素之一酸性或碱性较强的分子 在体内以较多解离形式存在 导致透膜性和生物利用度差 改善pKa可提高生物利用度胺类化合物 pKa10 11酸类化合物 pKa3 5 pKa 测量方法 毛细管电泳法和光谱梯度分析法预测方法 商业软件预测 2020 1 13 34 可编辑 三 水溶性 LogS表示S 化合物饱和水溶液浓度 浓度单位 mol L 85 的药物 LogS在 1 5之间其余药物 小于 5少数药物 大于 1 水溶性 影响水溶性的因素化合物的亲脂性分子大小pKa晶体能熔点等 水溶性 测量方法 浊度法 散射法 直接紫外以及高效液相法预测方法 商业软件预测 水溶性 结构修饰改善化合物水溶性增加离子化基团降低亲脂性 增加离子化基团 降低亲脂性 降低亲脂性 增加水溶性 提高生物利用度 三 基于ADMET性质的类药性 透膜性转运蛋白代谢稳定性血浆稳定性血浆蛋白结合细胞色素P450酶的抑制或诱导作用hERG通道阻滞 一 透膜性 Permeability 化合物通过生物膜的能力决定因素亲脂性 logP 氢键数目离子化特征大小及柔性 口服吸收程度评价 通常以表观渗透系数 Papp 表示 评价模型Caco 2人肠上皮细胞系犬肾上皮细胞系 MDCK QSAR模型预测极性表面积和亲脂性系数 logP 是决定膜渗透率 对于被动转运 重要的因素 血脑屏障穿透能力 血脑屏障 blood brainbarrier BBB 血脑分配系数 logBB 平衡时化合物在脑和血液中的浓度分配 BB C脑 C血 血脑屏障穿透能力 穿透血脑屏障的决定因素与膜渗透决定因素相似亲脂性 logP 氢键数目离子化特征大小及柔性对化合物性质要求更加严格 性质范围更小 血脑屏障穿透能力评价 评价模型过度表达P 糖蛋白的MDR1 MDCKII TR BBB和TM BBB等细胞单层模型预测模型 Log C脑 C血 0 0148 PSA 0 152 ClogP 0 139 二 转运蛋白 转运蛋白介导的主动转运是药物透膜的主要方式之一小肽转运蛋白氨基酸转运蛋白单羧酸转运蛋白有机铵盐转运蛋白外排转运蛋白 P 糖蛋白 转运蛋白 提高药物的主动转运效率 可在分子中加入与底物相似的片段 如氨基酸片段伐昔洛韦的生物利用度提高3 5倍 三 代谢稳定性 代谢稳定性描述化合物的代谢速度和程度代谢稳定性低 药物在体内容易代谢生物利用度低半衰期短清除率高 代谢稳定性评价 全肝细胞代谢分析 肝微粒体代谢分析 S 9肝匀浆液代谢分析 代谢稳定性评价 全肝细胞 肝微粒体 仅包括I相代谢酶易于保存分析操作容易 费用低 包括所有代谢酶和转运蛋白费用高 细胞保存不易 S9肝匀浆液 包括主要I II相代谢酶分析操作容易 费用低匀浆液保存不稳定 提高代谢稳定性 引入不易代谢的原子或基团增加易代谢片段的位阻 引入不易代谢的原子或基团 t1 2 52 3min t1 2 4 6min 易氧化羟基化 增加易代谢片段的位阻 例 倍他洛尔的甲基 易发生去甲化代谢 t1 2 3 5 6ht1 2 16 22h 四 血浆稳定性 化合物在血浆中被水解的速率和程度血浆中含有大量的水解酶 可水解特定的官能团酯 酰胺 氨基甲酸酯 内酰胺 内酯 磺酰胺等血浆稳定性低 高清除率和较短的半衰期 提高血浆稳定性 经结构修饰提高特定基团耐受水解酶的能力酰胺基代替酯基增加易水解片段位阻 酰胺基代替酯基 半衰期延长 t1 2 1mint1 2 69h 增加易水解片段位阻 t1 2 0 5ht1 2 1 5ht1 2 6ht1 2 16h 五 血浆蛋白结合 药物与血浆蛋白结合可降低药物的分布容积 肝脏代谢和组织穿透能力 延长半衰期研究方法 平衡透析和超过滤 血浆蛋白结合 提高血浆蛋白结合率 增加药物的亲脂性引入烷基 芳基 卤素等疏水基团降低血浆蛋白结合率 引入极性基团 如氨基 羟基和羧基 六 细胞色素P450酶的抑制或诱导作用 药物对CYP450的抑制和诱导作用是导致药物相互作用的重要因素70 酶的抑制23 酶的诱导7 其他 七 hERG通道阻滞 阻滞钾离子通道产生心率失常格帕沙星阿司咪唑西沙比利结构共性一个碱性氮亲脂性较强缺乏阴离子基于受体和配体的预测 实验方法 研发中药物 发现 临床前 一期二期三期临床 及时淘汰及早淘汰 理想模式 传统模式 类药性研究的目的 指导药物化学家不仅仅设计并合成具有特定生物活性的化合物更重要的是指导设计并合成出能够发展成为药物的分子 将类药性整合到药物发现中的策略 早期评估类药性 从hit到lead阶段的早期性质评估能够排除问题化合物 据此强化lead的选择 并帮助设计初步合成修饰 类药性整合到药物发现中的策略 建立结构 性质关系 活性 O Me N Me Et血浆水解 酯渗透性 酯 COOH 活性 O
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