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文档简介

如何分析基因序列中的启动子 外显子和内含子 生命科学学院 启动子 RNA聚合酶特异性和结合的DNA序列 启动子是基因的一个组成部分 控制基因表达的起始时间和表达的程度 外显子 断裂基因中的编码序列 外显子是真核生物基因的一部分 它在剪接后仍会被保存下来 并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质 内含子 断裂基因的非编码区 可被转录 但在mRNA加工过程中被剪切掉 故成熟mRNA上无内含子编码序列 怎样利用互联网中的网站或软件分析该序列中的外显子 内含子和启动子呢 现有人基因组中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT 一 根据一段碱基序列找到其对应的基因名或其序列号 任选浏览器 搜索 NCBI 找到后点击进入 出现如上界面 点击 BLAST BasicLocalAlignmentSearchTool BLAST 当出现如上界面时 点击 nucleotideblast 打开页面后 在检索框中输入需要查找的序列 如图所示 根据索要查询的基因来源 选定需要查询的基因 人类基因 点击 BLAST 打开 出现页面后向下滑动直至出现图1寻找Ident 一致性 最高的一项点击进入 点击进入后见所查序列名称以及序列号据此进行操作 二 已知基因的基因名或序列号找到其启动子 外显子和内含子 1 输入网址进入UCSC网站 2 点击GenomeBrowser 3 点击进入后可看到以下页面 1 选择是何种生物的基因 如人类 老鼠等 2 输入你所需要查询的基因名称 输入完毕 点击SUBMIT 4 可看到以下页面 1 将EnsemblGenes设置为dense 显示 2 点击refresh 5 可看到以下页面 找到EnsemblGenes点击所对应的序列图形 6 可看到以下页面 继续点击所对应的序列图形 7 可看到以下页面 选择GenomicSequence 8 可看到以下页面 2 选择表现形式 如外显子大写 其余都小写 1 根据需要选择所要展现的内容 如外显子 内含子 3 点击submit 9 可看到以下页面 此为HBB基因的全部序列 第一段大写部分为第一个外显子 第一个外显子前面的所有小写部分为该序列的启动子 大写部分之间夹杂的小写部分为该序列的内含子 三 检验所得序列是目的序列 1 验证 利用word输入我们所得到序列的第一个外显子的部分序列进行验证 看
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