生化与分子复习提纲.doc

o生物化学与分子生物学复习提纲第2章 氨基酸1.凯氏定氮法2.蛋白质水解方法（优缺点）3.氨基酸结构通式4.氨基酸的分类（缩写，结构式，分类）5.氨基酸的酸碱性质（解离形式，HH公式，等电点：pHpI，带负电，pHpI，带正电）6.氨基酸化学反应（羧基反应，氨基反应，茚三酮反应，侧链基团反应：-SH）7.氨基酸的旋光性和光谱性质（蛋白的氨基酸为L型，近紫外区：Trp、Phe、Tyr，L-B定律）8.分离分析方法（分配层析，离子交换层析：类型、分离氨基酸用强酸型阳离子交换树脂、决定亲和力的因素、氨基酸洗脱顺序）第3章 蛋白质的通性、纯化和表征1.酸碱性质（等电点，等离子点）2.蛋白质沉淀（方法，原理）3.分离纯化方法（透析，超过滤，凝胶过滤：原理、分离顺序，盐溶，盐析：可逆，有机溶剂：防止变性方法，凝胶电泳，等电聚焦，离子交换层析，亲和层析，高效液相层析）4.相对分子量的测定（凝胶过滤，SDS-PAGE：原理，电泳顺序，速度沉降）5.含量和纯度测定（常用方法）第4章 蛋白质的共价结构1.分子大小（单体蛋白、寡聚蛋白、亚基）2.结构组织层次（一、二、三、四级结构，形成因素，一级结构决定高级结构）3.肽（肽键结构：构成、肽平面、反式，肽链书写方法，双缩脲反应）4.蛋白质测序策略5.测序的常用方法（末端分析：N端FDNB法、DNS法、PITC法、氨肽酶法，C端肼解法、还原法、羧肽酶法；二硫键断裂方法；多肽链部分断裂：常用内切酶、化学裂解；序列测定：PITC法；序列重建，确定二硫键位置）第5章 蛋白质的三维结构1.稳定三维结构的力（疏水相互作用，氢键，离子键，范德华力，二硫键）2.折叠的空间性质（二面角，拉氏图）3.二级结构（螺旋：结构，影响因素R基电荷性质、R基大小、Pro和Gly的存在；折叠：类型、结构特点；转角：结构）4.纤维状蛋白质举例5.超二级结构和结构域（概念，类型）6.三级结构（球状蛋白质的分类，特征）和四级结构（同多聚/杂多聚，驱动力和专一性，优越性）7.蛋白质的变性（概念，引起变性的因素，特征）第6章 蛋白质的功能与进化1.蛋白质功能2.血红素的结构（原卟啉IX-Fe2+）和珠蛋白结构3.血红蛋白结构（22-血红素，结合O2的机制）4.血红蛋白的功能（氧结合曲线双曲线/S形曲线，别构效应：概念、类型；R态和T态；Hill方程：Hill图、Hill系数协同程度的量度；BPG的作用：负异促调节物/别构抑制剂；Bohr效应）5.血红蛋白分子病（镰状细胞贫血病：机制，地中海贫血）6.免疫球蛋白（IgG结构，ELISA：原理）第7章 糖类和糖生物学1.糖的生物学作用2.糖的分类3.单糖的结构（链状结构：甘油醛D/L系醛糖，二羟丙酮D/L系酮糖，差向异构体；环状结构：半缩醛酮，异头碳/型，吡喃糖和呋喃糖）4.单糖的性质（氧化：Fehling/Benedict试剂还原糖；糖酯；糖苷：异头碳失去-OH，与另一化合物缩合，O/N/S/C-苷）5.重要的单糖（己糖葡萄糖：Glc，还原性吡喃醛糖；果糖：Fru，还原性呋喃酮糖；半乳糖：Gal，还原性醛糖；甘露糖：Man，还原性醛糖；戊糖核糖/脱氧核糖：Rib，还原性呋喃醛糖；木糖：Xyl，还原性醛糖；阿拉伯糖：Ara，还原性醛糖；核酮糖：还原糖；木酮糖：还原糖）6.单糖衍生物（糖醇：羰基还原为羟基；糖酸：醛糖酸/糖醛酸；脱氧糖：2-脱氧核糖；氨基糖：葡糖胺、N-乙酰葡糖胺、半乳糖胺、N-乙酰半乳糖胺、胞壁酸、N-乙酰胞壁酸、神经氨酸、N-乙酰神经氨酸）7.寡糖（表述方法；常见二糖：蔗糖Glc1 2Fru；乳糖Gal14Glc；麦芽糖Glc14Glc；海藻糖Glc1 1Glc；环糊精）8.多糖（贮存同多糖：淀粉/糖原Glc -1,4/-1,6；结构同多糖：纤维素Glc -1,4，壳多糖GlcNAc -1,4；结构杂多糖：果胶质，半纤维素，肽聚糖，糖胺聚糖）9.糖缀合物（糖蛋白：N-糖苷键Asn，O-糖苷键Ser/Thr；蛋白聚糖；脂多糖）第8章 脂质与生物膜1.脂质的分类2.三酰甘油（脂肪酸：饱和/不饱和，必需脂肪酸亚油酸、亚麻酸；酰基甘油：皂化/皂化值，卤化/碘值）和蜡3.磷脂（甘油磷脂：表8-3）和鞘脂（鞘氨醇，神经酰胺鞘磷脂/鞘糖脂）4.萜和类固醇（胆固醇）5.血浆脂蛋白（结构，类型，功能）6.生物膜结构（脂双层+蛋白质）和特征（不对称性，流动性）第9章 酶引论1.碰撞理论和过渡态理论（活化能/活化自由能）2.酶降低活化自由能（邻近、定向结合自由能；底物形变、诱导契合）3.酶的特点4.酶的化学组成（辅基/辅酶）5.酶的命名和分类（6大类）6.酶的专一性（结构/立体专一性，假说：诱导契合）7.酶活力测定（酶活力：代表酶的量，酶单位国际单位/Katal单位；比活力：代表酶的纯度；测定方法：测酶促反应初速率）8.核酶（非蛋白质酶RNA）9.酶分子工程（固定化酶、化学修饰酶、抗体酶）第10章 酶动力学1.有关概念（基元反应，速率表达式，质量作用定律，速率常数，反应分子数和级数，一、二、零级反应的特征）2.米-曼式方程（方程表述，米式常数，动力学参数的意义）3.米-曼式曲线（双曲线，线性化作图求KM和Vmax）4.多底物酶促反应机制（序列/乒乓机制）5.其他影响因素（pH/温度/激活剂）6.酶的抑制作用（类型；可逆抑制的动力学：表达方程，双倒数做图，参数变化；抑制剂举例）第11章 酶作用机制和酶活性调节1.酶活性部位（特点，确定方法）2.基元催化的分子机制（酸碱催化，共价催化：亲核/亲电，金属离子催化）3.酶高催化能力的原因（邻近和定向效应，诱导契合，底物形变：去稳定化/去溶剂化/静电效应，电荷极化，多元催化，疏水微环境）4.丝氨酸蛋白酶催化机制5.酶活性的别构调节（相关概念，动力学特点：曲线形状，协同模型）6.酶活性的共价调节（可逆：磷酸化激酶/磷酸酶，级联放大；不可逆：酶原消化酶/凝血酶）7.同工酶第12章 维生素与辅酶1.维生素的类型2.维生素的辅酶形式及主要生化功能（表12-1）3.几种维生素缺乏症（脚气病B1，坏血病C，夜盲症A）第13章 核酸通论1.核酸的种类2.核酸的生物功能第14章 核酸的结构1.核苷酸（碱基：嘧啶C/T/U，嘌呤A/G；核苷：糖的C1与嘧啶的N1或嘌呤的N9形成N-糖苷键；核苷酸：磷酸的位置，常见核苷酸表14-4）2.核酸的共价结构（3,5-磷酸二酯键，表示方法，mRNA的特殊结构：3polyA尾巴，5帽子）3.DNA高级结构（双螺旋结构，超螺旋，染色体组装）4.RNA高级结构（tRNA：二级结构三叶草形/四环四臂，三级结构倒L形）第15章 核酸的理化性质和研究方法1核酸的水解（类型，优缺点）2.酸碱性质（碱基解离；核苷解离；核苷酸解离：等电点，解离曲线图15-1；滴定曲线图15-2）3.核酸紫外吸收（240-290nm，最大吸收在260nm；A260/A280：纯RNA2.0 纯DNA1.8；摩尔磷吸光度：单链比双链高增色/减色效应）4.变性（概念；引发因素；性质变化；爆发式熔解温度；影响溶解温度的因素：离子强度，G-C含量，甲酰胺）5.复性（二级动力学；影响因素；退火；退火温度）6.分子杂交（Southern印迹DNA，Norther印迹RNA）7.核酸的分离纯化（超速离心；凝胶电泳：琼脂糖凝胶电泳凝胶浓度与孔径成反比，迁移率与碱基对的对数成反比，EB染色，紫外线下发橙红色荧光；脉冲电场凝胶电泳，聚丙烯酰胺凝胶电泳孔径决定于丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺的浓度；柱层析：羟基磷灰石柱层析双链吸附力比单链强，dsDNADNA-RNAdsRNA；寡聚脱氧胸苷酸亲和柱层析mRNA；DNA/RNA的提取与纯化）8.核酸测序（双脱氧链终止法：原理；化学降解法：原理四组特异反应；自动测序）9.核酸化学合成（固相亚磷酸三酯法：脱保护基、偶联反应、终止反应，氧化作用）第16章 激素1.激素的分类2.激素分泌的等级控制和反馈调节（图16-2、16-3）3.激素作用机制（细胞内受体：图16-4；细胞表面受体：第二信使cAMP、cGMP、IP3、DAG、Ca2+，cAMP介导的途径图16-6，IP3- Ca2+介导的途径图16-8）4.昆虫激素和植物激素（种类）第17章 新陈代谢总论1.相关概念（新陈代谢、中间产物、代谢物、分解代谢、合成代谢）2.新陈代谢的功能第18章 生物能学1.相关概念（体系3种、环境、热力学的两个定律、自由能方程G=HTS）2.自由能变化与平衡常数的关系（方程11、12；计算举例）3.高能化合物（概念；高能磷酸化合物：ATP、PEP、1,3-二磷酸甘油酸、磷酸肌酸、乙酰磷酸、磷酸精氨酸；其他：乙酰CoA、S-腺苷甲硫氨酸）第19章 六碳糖的分解和糖酵解作用1.糖酵解（过程，酶，能量结算）2.丙酮酸在无氧条件下的去路（乳酸、乙醇）3.糖酵解的调节（3个不可逆步骤及相关酶；果糖-2,6-二磷酸）4.其他六碳糖的分解（果糖、半乳糖、甘露糖分解过程；乳糖不耐症/半乳糖血症）第20章 柠檬酸循环1.丙酮酸形成乙酰CoA（转运丙酮酸移位酶，反应过程，丙酮酸脱氢酶酶复合体，5种辅助因子）2.TCA循环（反应过程，酶，化学结算）3.TCA循环的调节（丙酮酸脱氢酶系：别构调节/共价修饰；3个不可逆步骤：柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶复合体）4.TCA循环的双重作用（分解和合成双重作用图20-6；添补反应丙酮酸草酰乙酸，丙酮酸羧化酶；）5.乙醛酸循环（植物特有；过程及酶图20-7）第22章 戊糖磷酸途径1.戊糖磷酸途径（反应过程图22-2；NADPH的产生；C数目的变化）2.戊糖磷酸途径的调控（限速步骤：葡萄糖-6-磷酸脱氢酶NADNADPH+/NADPH；4种情况）3.生物学意义（细胞产生还原力的主要途径，另一个来源是脂肪酸合成中苹果酸酶催化苹果酸形成丙酮酸时产生；不同结构糖分子的重要来源）第23章 糖异生和糖的其他代谢途径1.糖异生的途径（3步迂回措施；与糖酵解的差异表23-1；能量结算）2.糖异生的调节（PFK/果糖-1,6-二磷酸酶；丙酮酸激酶/丙酮酸羧化酶/PEP羧激酶）3.乳酸的再利用（可立氏循环图23-2）4.糖的其他代谢途径（乳糖合成：乳腺组织/非乳腺组织；乳糖分解）5.糖蛋白的合成（N-连寡糖合成：图234；特异连接位点；共翻译加工；O-连寡糖合成：翻译后加工，逐个加入单糖）第24章 糖原的分解与合成代谢1.糖原的分解（反应过程，酶）2.糖原的合成（反应过程，酶）3.代谢调控（糖原磷酸化酶：别构调节/共价修饰图11-25；糖原合酶；激素图24-7、24-8）第26章 蛋白质降解和氨基酸的分解代谢1.蛋白质降解（溶酶体：无选择性；泛肽/泛素途径：选择性图26-1）2.氨基酸的脱氨基（转氨基，氧化脱氨基Glu脱氢酶，联合脱氨基；氨的命运：排氨/排尿素/排尿酸）3.尿素循环（部位；反应过程