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第十一章 核糖体l 核糖体是细胞质中普遍存在的一种非膜性细胞器,由RNA和蛋白质组成,是细胞内蛋白质合成的场所。l 多聚核糖体是由多个甚至是几十个核糖体串联在一条mRNA上构成的,能高效的进行肽链的合成。l 蛋白质合成是以各种氨基酸为原料,mRNA为模板,tRNA 作为“搬运工具”以及核糖体作为“装配机” 合成肽链的过程。l RNA可能是生命起源中最早的生物大分子。关键词:核糖体;多聚核糖体;蛋白质合成第二节 多聚核糖体与蛋白质的合成核糖体(ribosome)是合成蛋白质的细胞器,其功能是以mRNA为模板,以氨基酸为原料高效且精确地合成蛋白质多肽链。在真核细胞中,核糖体以多聚核糖体的形式存在能高效的进行肽链的合成。一、多聚核糖体核糖体往往并不是单个独立地执行功能,而是由多个核糖体串连在一条mRNA分子上高效地进行肽键的合成。这种具有特殊功能与形态的核糖体与mRNA的聚合体称为多聚核糖体(polyribosome)。图11-2-1多聚核糖体二、蛋白质的合成蛋白质合成是以各种氨基酸为原料,mRNA为模板,tRNA 作为“搬运工具”以及核糖体作为“装配机” 合成肽链的过程。原核细胞蛋白质合成的过程已比较清楚,包括3个阶段:肽链合成的起始,延伸和终止。在起始之前还要进行氨基酸的活化(一)氨基酸的活化1. 定义氨基酸的活化是指各种参加蛋白质合成的AA与携带它的相应的tRNA结合成氨酰- tRNA的过程。活化反应在氨酰-tRNA 合成酶的催化下进行。2过程活化反应分两步进行:活化:AA-AMP-E复合物的形成转移:氨酰-tRNA形成 20种氨基酸中每一种都有各自特异的氨酰-tRNA合成酶。氨酰-tRNA合成酶具有高度的专一性,它既能识别相应的氨基酸(L-构型),又能识别与此氨基酸相对应的一个或多个tRNA 分子;即使AA识别出现错误,此酶具有水解功能,可以将其水解掉。这种高度的专一性保证了氨基酸与其特定的tRNA准确匹配,从而使蛋白质的合成具有一定的保真性。氨酰-tRNA合成酶和之相对应的tRNA分子被称为遗传密码第二。图11-2-2 氨基酸的活化(二)肽链合成的起始所需的条件:游离的核糖体大小亚基;mRNA 5端的起始信号;起始tRNAtRNAimet;GTP;三种起始因子(IF)。1. 30S小亚基与mRNA的结合在原核生物mRNA起始密码子上游有一段富含嘌呤碱基的序列,我们称之为SD序列。而在核糖体16S小亚基的3端有一段富含嘧啶碱基的序列,通过嘌呤碱基与嘧啶碱基的互补结合从而使mRNA模板与核糖体小亚基结合,进而寻找到起始密码子。三种起始因子的功能:IF1辅助IF3;IF2有GTP酶活性,特异识别fmet-tRNAfmet,形成fmet-tRNAfmet-IF2-GTP;IF3促进30S小亚基结合mRNA翻译终止时促使大小亚基分离。2. 第一个氨基酰-tRNA进入核糖体 第一个活化的氨基酸甲酰甲硫氨酰tRNA通过反密码子与起始密码子的识别相结合,形成30S起始复合体,释放IF3。3. 完整的起始复合物的组装 50S核糖体大亚基结合在30S起始复合体上形成70S起始复合体从而启动蛋白质的合成。该过程伴随与IF2结合的GTP水解,三种起始因子释放。图11-2-3 肽链合成的起始(三)肽链的延伸所需的条件:70S起始复合物;延长tRNA转运氨基酸;延长因子(EF); GTP。分三步进行:进位,转肽,移位。1. 进位氨基酰-tRNA根据遗传密码的指引,进入核糖体的受位。新的氨酰- tRNA进入A位。需要消耗GTP,并需EF-Tu(热不稳定),EF-Ts(热稳定)两种延伸因子。EF-Tu-GTP+下一个要进入的氨酰-tRNA 形成复合物,将这个氨酰-tRNA 送入核糖体A位,同时GTP GDP + Pi,EFTu-GDP释放。参与的延长因子:EF-Tu:协助AA-tRNA进入受位;具有GTP酶活性;EF-Ts:促进EF-Tu的再利用。2. 转肽在肽酰转移酶的作用下P位点上fMet-tRNAfMet的甲酰甲硫氨酸从相应的tRNA上解离下来,其-COOH(高能酯键)与刚进入A位的氨酰-tRNA上的-NH2形成肽键(实质是A位点氨酰-tRNA氨基亲核攻击酯键羰基),无负荷的tRNA留在P位,此时A位点携带一个二肽。3. 移位 在位A的二肽链连同mRNA进入P位。在EF-G(移位酶)的作用下,核糖体沿mRNA5 3方向移动,每次移动一个密码子的距离,结果使原来在A上的肽酰-tRNA移到了P位点,原来在P位点的无负载的tRNA进入E位后离开核糖体,同时一个新的密码子进入空的A位, EF-G 催化的移位过程需水解GTP提供能量。肽链合成从N-C。以上三步为一个延伸循环,肽链每掺入一个氨基酸就重复一次延伸循环;肽链合成从N-C。图11-2-4 肽链的延伸(四)肽链合成的终止当终止密码子出现在A位时,终止因子结合在A位,在三种释放因子的作用下肽链合成终止。RF1:识别终止密码子UAA和UAG ;RF2:识别终止密码子UAA和UGA;RF3:具GTP酶活性,激活RF1和RF2活性,协助肽链的释放。终止因子的结合使肽酰转移酶活性变为水解酶活性,肽基不转移给A位tRNA,而转移给H2O,并把已合成的多肽链从核糖体和 tRNA上释放出来,无负荷的tRNA随机从核糖体脱落,该核糖体立即离开 mRNA,在IF3存在下,消耗GTP而解离为30S 和50S非功能性亚基。再重复下一轮过程。图11-2-5肽链合成的终止三、RNA与生命起源人们从化学进化和生物学进化的角度,提出了RNA学说。即认为生物大分子的进化过程可分为三个阶段:RNA世界,RNA蛋白质世界和DNARNA蛋白质世界。认为生命起源于RNA,其主要根据有:1.研究表明,许多病毒只含单链RNA而不含DNA;2.研究发现,一些RNA具有酶的催化活性;3.由于RNA酶的发现,人们提出了从多核苷酸到多肽的学说;4.在
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