药物化学毕业论文写作要求.doc

稿件、毕业论文撰写的一般要求（version 1, 20060216）最近阅读、修改大家的论文（毕业论文、投稿论文），觉得在论文撰写方面存在很多普遍问题，修改起来非常麻烦。实际上，大部分问题只要稍加用心、注意，完全是可以避免的。为规范今后的写作，特准备了这份材料。以下内容主要针对投稿论文，请大家仔细阅读，在投稿、撰写论文时多加注意。当然，下面提到的大部分问题也提请大家在准备Seminar Reports、撰写毕业论文时注意（对毕业论文，如果研究生院、海洋所有特殊要求，则按照特殊要求进行）。-为使研究工作尽量系统 、深入，在实际工作中请大家注意自己的化合物类型与生物活性的关系，也就是说，请大家注意文献中与自己的化合物结构类似的化合物有哪些活性报道？一旦新化合物的结构确定无误、所有相关的波谱数据齐全、物理常数（高分辨质谱、红外光谱、含共轭体系的化合物要有紫外、手性化合物要有旋光、固体或晶体化合物要有熔点）测定完毕后（或者，分离获得的样品量很大），应该进行相应的活性测试。有些活性可以我们自己做，有些活性需要送其它单位做。总之，活性问题请大家自己多留意、多操心，早动手，有问题也请尽早与我联系，避免到最后要写文章投稿的时候才补做这项工作；-论文撰写之前当然需要确定自己的工作适合往什么杂志上投稿，这个很重要，因为不同的杂志对稿件内容、格式等有不同的要求。撰写之前需要先确定拟投稿的杂志，这样可以在一开始撰写的时候就严格按照拟投稿杂志的要求进行，避免以后转换、修改所带来的不必要的麻烦。有的时候很容易决定自己的工作所适合的杂志，有的时候不容易决定。建议在撰写之前与我讨论；-每个杂志都有自己的投稿须知（一般可以在其网页上免费获得），动手撰写论文之前，请先仔细阅读。撰写过程中当然也可以参考拟投稿杂志上的最新文章；-文章的第一页当然是题目、作者、作者单位、通讯联系人信息等，第二页是摘要，第三页开始正文。一般情况下，第一页、第二页不会占用整个页面，所以第一页和第二页之间以及第二页和第三页之间需要使用分页符分隔开，方法是，先将光标放置在需要分页的地方，然后点击Word中的“插入/分隔符”，在对话框中选择“分页符”；-每一段的第一行一般空两个字母；-全文（图、表除外）使用双倍行距，左对齐；-尽量采用Times New Roman字体（包括标点符号），字号12号（题目14号）；-注意单、双引号的使用，有些杂志（编辑）使用如或“”，而有些使用或，但对化合物中碳原子的编号一般使用后者，而Peoples Republic of China中一般使用前者。这个问题请注意参考拟投稿杂志的最新相关文章；-注意空格的规范使用：标点符号后要加空格（而不是在前面），破折号前后一般不加空格，有些特殊的缩写也不加空格（如e.g.，i.e.等，而不是e. g.，i. e.），但括弧的前后一般要加空格（除非括弧后面紧跟标点符号）；-化合物的编号必须使用黑体，如compound (1), compounds (1-3)，文章中和结构图中化合物的编号必须一致；-注意斜体的使用，拉丁名、质谱m/z、偶合常数J、构型R、S、cis-、trans-、E、Z、以及糖的表达如3-O-D-glucopyranoside中的O等要使用斜体，但须注意的是紧随之后的标点符号、括弧等一般不用黑体和斜体；-注意大、小写的要求，尤其是文章中出现的化合物的名字，各杂志的要求不一，如果不清楚，最好参照拟投稿杂志的最新投稿须知和文章；-注意参考文献在文中和文后的使用格式，需严格按照拟投稿杂志的要求录入，包括缩写形式、标点符号、正斜体、黑体、空格、起（止）页码（有些杂志只要求提供起始页，有些杂志则要求同时提供起、止页码）等；-在引用参考文献时间，一定要保证引用信息的准确性，特别小心对待作者姓、名的缩写（姓不用缩写，只缩写名，有的时候很难确定外国作者的名与姓，这种情况下请与我商量）、杂志名（及规范缩写）、年、卷（期）、页等的准确；-在论文写作、修改时往往会遇到参考文献数量的增减、前后位置的调整等问题，从而导致其顺序、编号的变化。这种情况下一定要注意对相应的变化做出准确的、相应的调整，保证引用的可靠性，保证文献在文章中的引用编号与后面list中的编号一致。这件事情看似简单，但要做到“万无一失”则很难，尽管很难，但杂志要求作者必须“万无一失”。对此有一个建议，或说小窍门，就是，在文章撰写的过程中（定稿、投稿之前），先不编号，但在文章的引用之处用括号给出作者姓，年，如mmmmmm（Wang, 1999），在后面的list中则先按照被引用作者的姓的字母顺序排列（同姓作者按照年代早晚的顺序排列，同姓、同年则用1995a, 1995b等表示）（实际上，有些杂志对参考文献的引用就是这么要求的，如Phytochemistry），待文章定稿、投稿之前，再按照相关文献在文章中出现的前后顺序给定编号，然后在后面的list中按照前面给定的编号重新排序。这种方法做起来比较麻烦，但会在很大程度上减少由于参考文献的增减而带来的混乱，从而减少失误。当然，如果大家有更好的办法，也可以尝试。但不管采取哪种办法，最终目的都是确保参考文献引用的准确性；-表格的使用要符合杂志的要求。为节省杂志的篇幅，尽量设计避免表格中出现大片空白（否则最好不要使用表格，而改为在后面的实验部分列出数据）。注意表格中的对齐方式（左对齐、右对齐、小数点对齐？），另外要做到一栏一行，避免一栏多行。在做表格之前，建议先找本组已经发表的文章参考。-对表格内容的一般建议是：第一栏，编号，之后依次是1H NMR shifts, 1H NMR multiplicity and J values, 13C NMR shifts (DEPT, s, d, t, or q), HMBC correlations (from H to C)；特别提醒：在编制表格、论文写做之前，一定要敲定化合物结构中的原子编号顺序，否则以后的变化、调整会很麻烦。如果对原子编号顺序有不清楚、不确定的地方，请与我商量；-大多数杂志一般希望作者将表格的宽度限定在单栏。通常情况下，一个化合物的1H NMR data, 1H NMR multiplicity and J values, 13C NMR data (DEPT, s, d, t, or q), HMBC correlations (from H to C)等数据列在一个单栏的表格中；其它的选项是，可以在一个表格中放置2个化合物的1H NMR data, 1H NMR multiplicity and J values, 13C NMR data (DEPT)数据，或者3个化合物的1H NMR data, 1H NMR multiplicity and J valuesT数据，或者3-4个化合物的13C NMR data (DEPT)数据，可以根据自己的实际情况决定；-一般情况下，表格放置在参考文献之后，化学结构之前（正式发表时由编辑决定它们在文章中的位置）；有些杂志有自己的特殊要求，特别是如Org Lett, Tetrahedron Lett等杂志，要求作者使用它们的Template来撰写稿件，作者可以自己决定表格、结构在文章中的位置；-注意破折号（ 较长）和连字符（- 较短）的区分使用。一般地，连字符（-）用于化合物的命名（如，-D-glucopyranoside）、或者如 six-membered, R-configuration等词语（词组），或者如原子编号如C-2，H-3等，而破折号（）一般用于参考文献中的起止页码，如756759，而不是756-759，请注意参考相关的杂志。当然，有的时候如果错用了，编辑会帮助修改过来，但我们自己应该尽量避免，尽量自己做好；-关于化学结构的画法：原则上只提供新化合物的化学结构。对结构的画法各个杂志的要求也不一样（包括键长、键角、基团字母大小、字体、编号数字大小等），请分别参考其投稿须知；-化学结构一般采用ChemDraw软件绘制，所有化合物的结构应尽量绘制在一个文件中，整体粘贴到Word文件中，避免一个一个地粘贴（很容易引起Re-size时的差异、排版、打印错误等），当然，HMBC、ROESY、质谱碎片等也应尽量按类型分别绘制在另一个文件中。-ChemDraw中预设了一些期刊的格式，如美国化学会（ACS）的期刊JNP、Org Lett等杂志，可直接应用，方法是在ChemDraw中，点击File/ Apply Settings/ACS Document 1996。一般的要求是：基团字母用Arial（10号）、碳原子编号数字用Arial（6号。请注意，如果一篇文章中报道多个新化合物，一般只需要把同骨架类型的第一个化合物进行碳原子编号。而用于Graphical Abstracts的结构则不需对碳原子进行编号）、化合物的编号使用12号Arial或Times New Roman字体（加黑）；-对于表示构型的化学键，尽量选用锲形线，避免使用棒状线；五元环使用五角形的（避免使用含平行线的）；尽量保证画出来的结构整洁，特别需要注意合理安排用于碳原子编号的数字在结构中的位置，不能离化学键太近，也不能太远；-还有一点需要提醒，有时会发生一种情况，即，如果在ChemDraw中画的结构很宽，粘贴到Word时会导致边上的基团换行。避免的方法是回到ChemDraw中调整，将化学结构适当往中间挪（紧凑些），如果已经很紧凑了，则可考虑移至下一行（做较大调整）；-大多数杂志希望正式发表时化学结构式的宽度只占一栏。如果结构太多，则有两种选择，一是可以占用两栏，二是只占一栏，但可以上下加长。这两种情况，一般倾向使用后者；当然，画结构的时候也应考虑尽量节省杂志的版面，结构类似的化合物尽量使用取代基R来代表不同的化合物，只需另外指出R的不同即可，如：1 R = OH, 2 R = Br, 3 R = OAc, 等等；其它问题：-对于天然产物化学的文章，在Results and Discussion（结构鉴定论述）的结尾部分，一般应该增加一段文字，简要讨论一下如下的内容：1）生物活性（活性数据，或，做了哪些活性模型？数据或活性强弱如何？或没有表现出活性？）；2）本文报道的化合物与相关的已知化合物的关系、异同点，或者，本文报道的化合物的结构新颖性（new skeleton or new ring system, etc.?）3）针对你的化合物，能否讨论一下有关其生物合成途径（biosynthetic origin or pathway）?4）本文所报道的化合物（或化合物类型）是否之前从同种（same species, same genus, same family, or same organism）资源中报道过？或者本文是首次从某某资源中报道？-对于初次撰写英文文章的同学，有时候会觉得很难组织、表达。对此，我建议大家在撰写论文的时候，可以找几篇自己感觉写的比较好的文献，参考一下别人的语言组织、结构鉴定的论述思路等，这是可以的。但需要注意的是绝不能把别人的语言整段整段（或大段大段）地照抄、照搬（特别是在Introduction部分），避免抄袭的嫌疑。另外，注意尊重别人的工作、贡献，也就是