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第三章蛋白质化学 protein 第一节蛋白质的概念 分类和功能第二节蛋白质分子组成第三节蛋白质的分子结构第四节蛋白质结构的测定与多肽的人工合成第五节蛋白质的理化性质第六节氨基酸及蛋白质的分析和分离 第一节蛋白质的概念 分类和功能 蛋白质的概念蛋白质的分类蛋白质的功能 一 蛋白质的概念 包括以下几点内容 存在于所有的生物细胞中 是由20种 氨基酸按一定的序列通过肽键缩合而成的 是构成生物体最基本的结构物质和功能物质 是生命的物质基础 各具有一定的相对分子质量 复杂的分子结构和特定的生物功能 占生物体干重的45 50 以上 有些蛋白质尚含有非蛋白成分 元素组成特点 蛋白质的含氮量接近于16 蛋白质系数 1克氮所代表的蛋白质质量 克数 即6 25 蛋白质系数是凯氏定氮法测定蛋白质含量的基础 粗蛋白含量 样品含氮量 6 25蛋白质含量 样品蛋白氮 6 25有些还含有 e Cu Zn Mn等 三聚氰胺 是一种重要的氮杂环有机化工原料 主要用于生产三聚氰胺 甲醛树脂 广泛用于木材加工 塑料 涂料 造纸 纺织 皮革 电气 医药等行业 目前是重要的尿素后加工产品 此外三聚氰胺还可以作阻燃剂 减水剂 甲醛清洁剂等 动物长期摄入三聚氰胺会造成生殖 泌尿系统的损害 膀胱 肾部结石 并可进一步诱发膀胱癌 二 蛋白质的分类 1 分类依据生物来源 理化性质 分子形状 化学组成 化学结构与功能等 2 常用的分类方法按分子形状根据溶解度根据组成 1 根据溶解度 清蛋白 白蛋白 球蛋白谷蛋白醇溶蛋白组蛋白精蛋白硬蛋白 2 根据组成成分进行分类 单纯蛋白质如 清蛋白 白蛋白 精蛋白 组蛋白 球蛋白谷蛋白 醇溶蛋白 硬蛋白 结 缀 合蛋白质如 核蛋白 色蛋白 糖蛋白 脂蛋白 磷蛋白 3 蛋白质的分子形状和大小 纤维状蛋白质 球状蛋白质 三 蛋白质的功能 功能的多样性催化功能调节功能结构功能运输功能免疫功能运动功能储藏功能生物膜的功能2 功能的复杂性 第二节蛋白质的的分子组成 组成蛋白质分子的基本单位 氨基酸肽键与肽 一 氨基酸 1 结构通式 14 氨基酸的构型指 氨基在空间的排布来区分的 D与L型 氨基酸的构型 15 除脯氨酸为 亚氨基酸外 其余称为 氨基酸 除甘氨酸外其它所有氨基酸分子A 具有旋光性 B 是L 型 2 蛋白质氨基酸的结构特点 20种 基本氨基酸 70页 表3 1 不常见的蛋白质氨基酸 是在蛋白质合成后由常见的氨基酸经化学修饰而来的 非蛋白质氨基酸 180多种 大多是L 氨基酸衍生物细菌中含有多种D 型氨基酸有一些是重要的代谢物前体或代谢中间物 丙氨酸 鸟氨酸 瓜氨酸等 三 蛋白质氨基酸 20种 的分类 1 按酸碱性质 酸性氨基酸 2种Asp Glu 碱性氨基酸 3种Lys His Arg 中性氨基酸 15种 2 按R基团的化学结构分 脂肪族氨基酸 15种 芳香族氨基酸 3种 苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸 杂环氨基酸 2种 组氨酸 脯氨酸 3 根据侧链R基团是否有极性分 极性带正电荷的氨基酸 pH7时 3种 极性带负电荷的氨基酸 pH 7时 2种 极性不带电荷的氨基酸 7种 非极性氨基酸 8种 非极性氨基酸在维持蛋白质的三维结构中起着重要作用 蛋白质的疏水核心 4 根据人体能否自身合成 必需氨基酸 8种 赖氨酸 Lys 缬氨酸 Val 蛋氨酸 Met 色氨酸 Try 亮氨酸 Leu 异亮氨酸 Ile 酪氨酸 Thr 苯丙氨酸 Phe 半必需氨基酸 2种 Arg His婴儿期供给不足 非必需氨基酸 其余 C C CONH2 C CONH2 C COOH C C COOH H CH3 C OH C SH C C S C C C C C NH3 Centralline Aliphatic Amide Acidic Imino Circular Basic Sulfur Hydroxy Aromatic AminoAcidSubwayMap 四 氨基酸的性质 构成蛋白质的氨基酸是无色晶体 溶点高 一般能溶于水 稀酸或稀碱中 但不溶于有机溶剂 通常酒精能使氨基酸从其溶液中析出 除甘氨酸外都有旋光性 1 兼性离子 1 两性性质 2 氨基酸的解离 氨基酸是一类两性电解质 在水中 COO C H R H3N 例 甘氨酸的解离 解离情况受环境中pH值的影响 分步解离 解离常数 pK 是一种特定条件下的pH 即当质子供体与质子受体浓度相等时的pH值 解离常数按酸性递减顺序编号为 pK1 pK2 pK3等 Handerson Hasselbalch公式 pH pK lg 碱 酸 可计算出在任一pH条件下一种氨基酸的各种离子的比例 氨基酸的带电状况与溶液的pH值有关 例 计算在pH5 0时 甘氨酸的两性解离 阳离子及阴离子所占的比例 先写出解离方程式根据公式 3 氨基酸的酸碱滴定曲线 甘氨酸的滴定曲线 谷氨酸的滴定 解离 曲线 组氨酸的滴定 解离 曲线 赖氨酸的滴定 解离 曲线 生理条件下有明显的冲缓作用的氨基酸 缓冲剂 能阻止由于酸或碱的加入而引起的 H 的变化 大多数氨基酸的pK都不在生理pH pH 7 范围内 在生理状况下没有明显的缓冲作用 组氨酸咪唑基的pK为6 0 它在生理条件下有明显的冲缓作用 4 氨基酸的等电点 isoelectricpoint pI 等电点 在某一特定pH值溶液时 氨基酸主要以两性离子形式存在 净电荷为零 在电场中不向电场的正极或负极移动 这时的溶液pH值称为该氨基酸的等电点 当溶液pH低于该氨基酸等电点时 氨基酸净电荷为正 反之 为负 氨基酸在等电点时溶解度最低 不同氨基酸等电点不同 应用根据氨基酸的电荷不同 电泳法 分离混合物 根据氨基酸的等电点不同 调节溶液pH 分离混合物 电泳 在外电场的作用下 带电颗粒 如不处于等电点状态的分子 将向着与电性相反的电极移动 这种现象称为 练习题 组成蛋白质分子的碱性氨基酸有 和 酸性氨基酸有 和 氨基酸在等电点时 主要以 离子形式存在 在pH pI的溶液中 大部分以 离子形式存在 天然氨基酸都具有一个不对称 碳原子 一个蛋白质样品经酸水解后 能用氨基酸自动分析仪准确测定它的所有氨基酸 用纸电泳法分离氨基酸主要是根据氨基酸的极性不同 下列氨基酸溶液除哪个外都能使偏振光发生旋转 A 丙氨酸B 甘氨酸C 亮氨酸D 丝氨酸在生理pH条件下 具有缓冲作用的氨基酸残基是A TyrB TrpC HisD Lys在生理条件下 pH6 0 7 0左右 蛋白质分子中的 侧链和 侧链几乎完全带正电荷 但是 侧链则部分带正电荷具有缓冲能力 必需氨基酸包括哪些 等电点的计算 侧链不含离解基团的中性氨基酸pI pK1 pK2 2 侧链含有可解离基团的氨基酸酸性氨基酸 pI pK1 pK 2硷性氨基酸 pI pK pK3 2 2 紫外吸收 三种芳香族氨基酸在中性pH条件下 都吸收紫外光溶液中蛋白质在280nm处有最大吸收峰 用紫外分光光度计可以测定样品中蛋白质的含量 3 氨基酸的化学反应 1 氨基参加的反应 2 羧基参加的反应 3 氨基和 羧基共同参加的反应 4 侧链R基参加的反应 1 氨基参加的反应 与亚硝酸反应 范斯莱克法测定氨基酸氮的依据 可用来进行氨基酸定量和蛋白质水解程度的测定 氨基酸的甲醛滴定 用于氨基酸定量分析 氨基酸不能直接用酸 碱滴定来进行定量测定 2 HCHO 是生物化工产品 食品和发酵物等产品中氨基氮的测定原理和方法 与2 4 二硝基氟苯 DNFB或FDNB Sanger试剂 首先被英国的Sanger鉴定多肽蛋白质的N末端氨基酸 FrederickSanger 桑格 英国化学家 在生物化学领域的贡献很大 他两次获诺贝尔奖1958和1980年 1953年确定了牛胰岛素一级结构 1975年和1977年确定了DNA的两种用酶测序的方法加减法和终止法 与酰化试剂反应 与酰氯或酸酐在弱碱溶液中作用 氨基即被酰基化 常用的酰化试剂 叔丁氧甲酰氯 对甲苯磺酰氯 邻苯二甲酸酐 丹磺酰氯等 生成西佛碱的反应 Schiff 西佛碱是以氨基酸为底物的某些酶促反应的中间物 食品中氨基酸与葡萄糖醛基反应 羰氨反应 非酶褐变 2 羧基参加的反应 成盐和成酯 羧基被保护 氨基被活化 重金属盐不溶于水 成酰氯反应 氨基被保护 羧基被活化 在多肽人工合成中常用 脱羧基反应 叠氮反应 常用于多肽的合成 3 氨基和 羧基共同参加的反应 与茚三酮反应 所有具有游离氨基的氨基酸都生成紫色化合物 570 脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应直接生成的是黄色化合物 440 成肽反应 4 侧链R基参加的反应 侧链功能团羟基 酚基 巯基 包括二硫键 吲哚基 咪唑基 胍基 甲硫基 非 氨基 非 羧基等 蛋白质的化学修饰就是在较温和的条件下 以可控制的方式使蛋白质与某些试剂起特异反应 以引起蛋白质中个别氨基酸侧链或功能团发生共价化学改变 Cys侧链上的巯基 SH 与卤化烷生成稳定的烷基衍生物 可保护 SH以防被氧化 巯基能和各种金属离子形成络合物 SH酶遇到重金属离子而生成硫醇盐时 将导致酶失活 对羟基汞苯甲酸 对氯汞苯甲酸 巯基易受空气或其他氧化剂氧化 形成两种氧化衍生物 形成二硫化物 胱氨酸的形成 胱氨酸 二硫键 形成磺酸基 对游离的巯基具有保护作用 保护Cly巯基之间的氧化 二硫键的还原 打开 SH与 S S 是一对氧化还原体系 常用的打开二硫键的试剂主要有 氧化剂 过甲酸 HCOOOH 还原剂 巯基乙醇 巯基乙酸 二硫苏糖醇等 HSCH2CH2OH 氧化剂 过甲酸 HCOOOH 磺酸基 还原剂 巯基乙醇 游离的巯基极易被氧化 需与卤化烷试剂作用将其保护 羟基 OH 丝氨酸 苏氨酸 酪氨酸 磷酸酯 Pi 思考题 1 蛋白质的20种氨基酸的结构特征 是否都有旋光性 是否都是L 氨基酸
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