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文档简介
细胞总蛋白的提取(1)离心后,弃去上清液,将收集的细胞用手指轻弹重悬于剩余的少量上清液中,转移至1.5ml离心管内,用1PBS溶液洗涤2次,每次加入1mL PBS溶液,1000r/min,4离心5min,弃上层液体。洗涤两次后,将上清液完全去除,用手指轻弹细胞团,使其分散重悬(若不分散,则无法与裂解液充分混匀)。(2)每管加入细胞团等体积的含蛋白酶抑制剂cocktail的RIPA细胞裂解液;如需检测磷酸化蛋白,则需另加入磷酸酶抑制剂。使细胞裂解液与细胞充分混匀,冰上裂解30min。如暂不提取蛋白,也可在洗涤细胞2次后加入含蛋白酶抑制剂cocktail和磷酸酶抑制剂的1PBS约100L,1000r/min,4离心5min后,完全弃上层液体,置于-80冰箱保存备用。(3)冰上超声处理细胞,每次超声2s,间隔3s,约10-20次。(4)13000r/min,4离心15min,收集上清溶液至另一干净并预冷的1.5mL离心管中,于-80冰箱保存备用。2. BCA法测定蛋白质浓度(1)配制工作液 根据标准品及待测样品的个数,按BCA试剂A和试剂B体积比为50:1配制足量BCA工作液,充分混匀,置于常温备用。(2)配制标准品 取原标准品BSA(2mg/mL)约100L,取出50L,用ddH2O按对数法稀释成如下浓度:1mg/mL、0.5mg/mL、0.25 mg/mL、0.125 mg/mL、0.0625 mg/mL;设置96孔板第一横排第一孔为空白孔,第二横排第一、二孔加入20L 1PBS,从第三横排起,按浓度梯度由低到高依次取20L标准品至96孔板中,每一浓度做2个平行孔。(3)稀释待测样品 取5l待测蛋白样品,用ddH2O稀释到50L,分别取20L至96孔板中,每一浓度做2个平行孔;(4)分别加入200L BCA工作液到蛋白标准品及待测样品中,轻轻混匀,并去掉每孔中的气泡,置于温箱37孵育30min。(5)将96孔板取出后用酶标仪测定OD570nm值。(6)根据标准品的OD570nm值绘制标准曲线,并根据标准曲线计算得到待测样品的蛋白质浓度。蛋白质变性(1)根据预计将要上样的蛋白质样品质量(25g-50gg,是蛋白质而定),取适量体积的蛋白质样品于预冷的EP管中,加入5SDS上样缓冲液(体积约为蛋白质样品体积的25%),通过调节上样缓冲液的体积将各样品混合液的终体积调节至相仿。用封口膜将离心管封口,7000r/min离心点离样品混合液3s,使其混合均匀。(2)将放置样品混合液的架子置于盛有适量dd H2O的磁盘中,用电磁炉加温至100,煮沸5min。点离样品,使其混合均匀。2.34.54. SDS-PAGE分离蛋白质根据将要检测的蛋白质大小,首先确定配制10%的分离胶(10ml):dd H2O 4ml30%Acr-Bis 3.3ml1.0MTris-HCl(pH8.8) 2.5ml10%SDS 0.1ml10%AP 0.1mlTEMED 0.005ml将配置好的液体吹打混匀,灌胶,再用注射器将dd H2O缓慢均匀的加于分离胶上层,待胶凝固后(光下可见明显的水胶分离线)将上层水倒掉,并用滤纸尽量将水吸干(注意不要碰到分离胶)。然后配制4%浓缩胶(3ml):dd H2O 1.8ml30%Acr-Bis 0.4ml1.0MTris-HCl(pH6.8) 0.76ml10%SDS 0.03ml10%AP 0.03mlTEMED 0.003ml将配置好的液体吹打混匀后,迅速灌胶并马上插入梳齿,待胶充分凝固后放入垂直电泳槽内,加入电泳缓冲液,小心将梳齿拔出,每孔加入等质量变性蛋白质(根据不同的蛋白质具体的上样质量会有所变化,但相同蛋白质的上样质量始终不变)后进行电泳。先采用80V恒压电泳约30min后,改用100V恒压电泳约2h(具体视溴酚蓝跑到胶的最底端的时间而定)。2.34.6 转膜(1)预先裁剪出大小适宜的PVDF膜和滤纸,尽量使PVDF膜面积稍大于凝胶,但不大于海绵。 (2)电泳结束后,将凝胶剥下,小心的将浓缩胶切除,将分离胶浸泡于预冷的转移缓冲液中约15min,洗去杂质。(3)将PVDF膜完全浸泡在甲醇中约30s。(4)在倒满转移缓冲液的塑料盘中依次加入转膜用的夹子(正极一侧在下,保持水平)、一块海绵垫、滤纸、浸泡好的PVDF膜、浸泡好的凝胶、滤纸和另一块海绵垫,整个操作过程中要不断赶走气泡,在夹紧夹子前要确认各层中没有气泡(否则会影响转膜结果)。(5)将夹子放入电泳转移槽中,确认夹子的正负极与转移槽正负极相对,整个转移槽埋在冰中进行转膜。根据将要检测的蛋白质分子量大小确定转膜时间,小分子蛋白一般为恒压80V,1.5h;大分子蛋白一般为恒压100v,2h。(6)转膜结束后打开夹子,小心去除负极一端的海绵、滤纸和胶,在PVDF膜的右上角剪一个角以确定正面,然后取出,根据预染蛋白Marker标准判断转膜效果及目的条带的大致位置。2.34.7 免疫反应(1)封闭:将PVDF膜浸泡于含5%脱脂奶粉的PBST封闭液中(如要检测磷酸化蛋白,则需使用含5%BSA的PBST封闭液进行封闭),室温下摇床摇动封闭约1-2h。(2)剪膜:依据预染蛋白Marker标准判断目的蛋白的条带位置,并将其小心剪下,膜的宽度应适当,并尽量保留周围可能出现条带的位置。(3)一抗孵育:用5%BSA溶液将一抗稀释至适宜浓度,并加入到大小合适的孵育槽中,将剪好的PVDF膜置于其中,稀释好的一抗应当至少没过PVDF膜。4下摇床摇动封闭过夜。(4)洗膜:室温下,用1PBST在摇床上洗涤PVDF膜4次,每次10min。(5)二抗孵育:根据一抗选择相应的羊抗鼠IgG二抗或羊抗兔IgG二抗,用含5%脱脂奶粉的PBST将辣根过氧化物酶标记的二抗稀释至适宜浓度,并加入到大小合适的孵育槽中,将PVDF膜置于槽中,室温下摇床摇动孵育2h。(6)洗膜:室温下,用PBST在摇床上洗涤PVDF膜3次,每次10min。2.34.8 显影(1)用水冲洗好平板,将保鲜膜平整的铺于平板上,并用滤纸赶走气泡,将孵育好的PVDF膜取出置于保鲜膜上,放置整齐,并用滤纸轻轻吸去PVDF膜上的液体;(2)取适量ECL试剂A、B液等体积混合后滴于PVDF膜上,避光孵育5min,用滤纸吸去剩余的发光试剂,并将平板放入凝胶扫描成像系统中,根据荧光强度确定曝光时间(5s-30min)。待成像后将图片以.tif格式保存。(3)用灰度分析软件Quantity One软件对实验结果进行灰度扫描。2.4 5 HDAC组蛋白去乙酰化酶活性比色分析试剂盒检测HDAC活性(1)取对照组和实验组各50g待测蛋白质样品,用ddH2O将其稀释,使终体积为85l,并按0M,1.25M,2.5M, 5.0M浓度依次加入96孔酶标板中。(2)加入10l 10HDAC Assay Buffer。(3)再加入5l HDAC Colorimetric Substrate,彻底混匀。(4)在温箱中37孵育1h。(5)加入10l Lysine Developer并彻底混匀,终止反应。(6)在温箱中37孵育30min。(7)将96孔板取出后用酶标仪测定A450 OD450nm值。将其转化为酶的活性值并进行统计学分析。2.5 细胞周期及凋亡率检测(1)收集实验组和各个对照组K562细胞5106个,1000r/min,4离心5min,弃去上清。(2)1PBS洗涤细胞两次,1000r/min,4离心5min,完全弃去上清。用手指轻弹细胞团,使其分散重悬。(3)每管加入约1
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