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文档简介

xx分子标记连锁图的构建 报告人 指导教师 研究员 主要内容 1国内外研究综述2主要研究内容和研究意义3研究材料和方法4预期结果5研究进展6可行性和创新性分析7可能出现的主要问题及解决方法 1xx的基本生物学特性和产业现状 一国内外研究综述 xx主打品种的亲本来源较为局限 遗传多样性缺乏 近年来xx生产中面临的问题日益严重 亟需拓宽xx的遗传多样性 培养抗病 优质新品种 一国内外研究综述 2国内外分子生物学研究现状瓠瓜的分子生物学基础研究却远远落后于黄瓜 西瓜 甜瓜等其他瓜类作物 目前主要依赖RFLP RAPD等分子标记对种质资源进行遗传多样性研究 最近本实验室利用Roche454技术测序了瓠瓜10 的基因组 自主开发了400对SSR标记 并构建了基于UPGMA的系统树图 一国内外研究综述 一国内外研究综述 1 瓜类作物分子标记连锁图谱研究现状 3瓜类作物分子遗传图谱研究进展 2 遗传图谱构建意义和步骤遗传图谱的构建是分子生物学和基因组学研究的重要环节 是目的基因定位 标记辅助育种 背景选择和比较基因组分析的前提 遗传图谱作图的基本原理是染色体的交换与重组 一国内外研究综述 选择适合的遗传标记 构建群体 搜集遗传标记 构建连锁群 数据的处理分析 构建连锁群 建立一个能充分 准确反映染色体重组交换的分离群体 搜集反映染色体交换信息的遗传标记 一国内外研究综述 研究内容 二研究内容和意义 意义 二研究内容和意义 技术路线 三研究材料和方法 群体基因型分析 多态性分析 连锁作图 带型分析 U F2 分离群体SSR基因型 数据化基因型 F1 SSR标记 多态性SSR引物 xx分子标记连锁图 比较基因图谱 已测序的模式基因组 比较基因组学分析 方法 DNA提取和SSRs标记分析 用改进的CTAB法提取DNA 首先在亲本间进行多态性标记筛选 选出的多态性引物进一步用于对F2群体的基因型分析 连锁作图 对获得的标记基因型资料进行赋值 用卡平方法进行分离比的适合性测验 用软件对标记资料进行连锁分析 LOD值设定为3 0 利用函数计算遗传图距 cM 三研究材料和方法 图谱特征分析 比较基因组学分析 三研究材料和方法 开发SSR引物1000对以上 构建的xx分子标记连锁图骨架图和其他研究整合后 可构建一张高密度的分子标记连锁图 使用该高密度的分子标记连锁图和已定位的模式基因组克隆比较分析 可绘制出比较基因组图谱 四预期结果 五研究进展 现阶段 亲本已确定 而F2群体也已构建完成 SSR标记开发已完成 共开发出SSR标记1000对 亲本SSR标记筛选已完成 筛选出有多态的SSR标记200对左右 五研究进展 六可行性和创新性分析 可行性 创新性 实验中出现的偏分离标记的处理 共线性
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