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Linux认证:操作系统关于集群的安装与并行计算文章来源:/12859Linux认证:操作系统关于集群的安装与并行计算,安装过程就不多说了。需要注意的是安装时,如果机群不与联网则可以不考虑安全方面的因素而把rsh选为可信赖的服务,注意安装相应的软件包;如果还要与保持联网,出于安全需要应把ssh选为可信赖的服务。安装以后,应该各节点之间能够用ssh相互登录。每个节点的sshd都应该能正常提供服务。主机名:node1.noden(我所构建的系统n=2)在服务器节点public目录下建立mpi目录,并将其配置成NFS服务器,在/etc/exports文件中加入一行:在客户端节点的/etc/fstab文件中增加一行:将/public/mpi这个目录从服务器节点输出,并装载在各客户端,从而便于在各节点间分发任务3.修改/etc/hosts文件,将所有节点名称极其ip地址填入。例如:每个节点都进行类似的配置。这样做的目的是使节点之间能够通过node1.noden的名称相互访问。你可以通过pingnoden或sshnoden进行测试。将所有你允许访问本机进行mpi计算的机器名填入,一行一个机器名。这一步是为了使节点对其它的节点放权。例如,我的node1是我用于启动mpi集群计算的机器,其他的节点是参与计算者,在node1的/etc/hosts.equiv文件是这样的:密码node1#给自己放权,这样在只有一台机器时也可以模拟并行计算首先决定一个用于启动集群计算的用户名,不提倡使用root进行集群计算。这里在每个节点上建立新用户chief,他们的主目录是/home/chief,必须采用同样的密码,将来的计算程序必须放在相同的径上。譬如你的程序为:fpi.f和a.out,则必须把a.out放在同样的境内,比如/mpirun/a.out,每个节点都是如此。修改/.bash_profile文件,主要是加入下列几行脚本:这里我们预定了将来mpich的运行安装在目录/usr/local/mpich下面。其余的三个变量是用来通知mpi运行采用rsh(或ssh)来作为远程shell。linux的运行到此就配置完毕了。对于采用rsh来作为远程shell运行MPI的用户只要在各个节点上都具有相同的用户,并把这一用户的密码设为空密码就可以运行了。若采用ssh作为远程shell则按如下配置:以你设定的用于启动mpi计算的用户登录,运行ssh-keygen,这将生成一个私有/公开密钥对,分别存放在/.ssh/identity和/.ssh/identity.pub文件内。然后进行访问授权,运行:在每个节点重复一遍。试着在某一节点上登录其它节点,sshnoden,则在.ssh/成一个known_hosts2文
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