《计算机在专业中的应用》第1章

1 计算机在专业中的应用 男中国郴州土著第一专业 化学第二专业 计算机从事教育工作33年 个人简介 湘南学院校训 明德博学创新笃行 关键 认真去做 笃行明德博学创新 何其辛勤育群葩笃行明德品无瑕贵有博学创新志点缀春秋园中花 何其辛勤育群葩笃行明德品无瑕贵有博学创新志点缀春秋园中花 计算机在生物学中的应用 形成了两门主要的边缘学科 交叉学科 一 计算生物学ComputationalBiology二 生物信息学Bioinformatics 一 计算生物学ComputationalBiology 一 定义指开发和应用数据分析及理论的方法 数学建模和计算机仿真技术 用于生物学 行为学和社会群体系统的研究的一门学科 美国国家卫生研究所 NIH 二 主要研究方向1 生物序列的片断拼接2 序列比对3 基因识别4 进化树的构造5 蛋白质结构预测6 计算机辅助药物设计 计算生物学的现状 正在成为现代生物学研究的核心方法之一 是当今生命科学最具活力的新兴前沿学科 美国国立卫生研究院 NationalInstitutesofHealth 是世界上从事生命科学研究最重要的研究机构 它的年度预算占了美国政府科学投入的60 左右 我国国家自然科学基金委员会将计算生物学作为重点资助的研究方向之一 其中 分子模拟和计算机辅助药物设计是当前计算生物学中的热点问题 又是计算生物学与生物医药产业结合最紧密的方向 中科院计算生物学研究所上海生命科学研究院计算生物学研究所北京基础医学研究所计算生物学中心 二 生物信息学Bioinformatics 生物信息学是现代生命科学与计算机科学 数理科学 化学等领域相互交叉而形成的一门新兴学科 定义 通过对分子生物学实验数据的获取 加工 存储 检索与分析 进而达到揭示这些数据所蕴含的生物学意义的目的 随着人类基因组计划 HGP 的不断推进 生物信息学已经成为当今生命科学和自然科学的核心领域和最具活力的前沿领域之一 主要研究方向 1 DNA序列比对 SequenceAlignment 2 蛋白质结构比对和预测3 基因识别 非编码区分析研究4 分子进化和比较基因组学5 序列重叠群 Contigs 装配6 遗传密码的起源7 基于人体蛋白质结构的药物设计8 其他 如基因表达谱分析 代谢网络分析 基因芯片设计和蛋白质组学数据分析等 计算生物学与生物信息学的区别 同 都是以生物信息为基础 以计算为工具 解决生物学问题 异 计算生物学 侧重于计算与问题 通过计算解决问题 生物信息学 侧重于数据管理与数据库的构建 二者相辅相成 互相促进 课程内容简介 计算机是一种模拟辅助大脑智能的强大的通用信息处理工具 已经广泛应用到人类社会的一切领域 极大地提高了人们处理日常事务的效率 取得了无比巨大的效益 尤其在自然科学领域内 率先掌握先进的科学技术 就有社会竞争的领先优势 计算机应用带来了前所未有的机遇和挑战 本课程通过学习使用本专业中的几类常用软件 使学生形成在专业领域内的应用技能 进一步提高计算机综合应用水平和解决问题的能力 本课程32学时 课程结束时以操作方式考核 教学内容 16学时 第一章Internet网络资源的利用4第二章数据分析处理及科学绘图软件3第三章化学编辑排版和分子模拟计算3第四章工程绘图软件2第五章计算机辅助数学计算软件2第六章计算机仿真软件2 上机内容 16学时 实验一网络搜索引擎 网络存储 下载技能 专业论坛2实验二网络专业资源利用 图书 论文 专利 标准 2实验三Origin软件 数据分析处理及科学绘图 一 2实验四Origin软件 数据分析处理及科学绘图 二 2实验五Chemoffice软件 数理化公式 结构式绘图2实验六Visio软件 工程绘图2实验七MathCAD软件 各种复杂数学计算2实验八ChemCAD软件 计算机仿真的应用2实验要求 1 每两个同学结成一组 互相研究交流经验提高应用能力 2 实验报告编成电子文档 文档名 专业班级姓名实验N 3 实验报告以邮件附件 发送到邮箱hedugui 第1章Internet网络资源的利用 第1节搜索引擎第2节电子邮件和网络存储第3节电子图书馆第4节期刊论文第5节专利文献第6节标准文献第7节论坛博客第8节电子商务第9节资源下载技法 引言 图书馆PK互联网 图书馆历来被视为知识源泉 科技宝库 过去 大学师生 科研人员 工程师 政府机构等查询资料 以泡图书馆为荣 在计算机互联网时代 传统图书馆的绝大部分的资源和服务 纷纷建网服务大众 而商业机构 民间个人 也纷纷参与其中 提供了海量的网络资源和服务 一个超越时间 空间 国家地域限制 信息容量爆炸式扩充的信息资源网络 以多媒体形式提供浩瀚丰富的资源种类 提供各种商业服务和免费服务 任何传统图书馆无法比拟 湘南学院图书馆永远不如湖南大学 遑论清华北大 湘南学院可获得的网络资源却与清华北大几乎一样 随地电脑旁 世界任遨游 键盘鼠标点 资料立到手 百姓不出门 天下事知全 电脑中运筹 万里外决胜 信息网络化的地球村时代真正到来了 无 网 而不胜 怎样才算是会上网 你会上网吗 第1节搜索引擎 没有掌握搜索引擎的用法 就不可能在网络上熟练 迅速 深度查找资料 就算不上真正会上网 搜索引擎 能自动从英特网搜集信息 经过一定整理以后 提供给用户进行查询的数据库系统 搜索引擎三功能 自动搜索信息 自动整理信息 回馈用户查询 目前主要的搜索引擎 google 谷歌 baidu 百度 yahoo 雅虎 爱问 新浪网 搜狗 搜狐网 狗狗 迅雷 搜搜 腾迅 搜索引擎的用法 以Google为例 1 简单搜索将需查内容关键词 输入到检索框中 点击 搜索 按钮即可 2 命令搜索 用命令表达式实现复杂或特定的搜索 1 布尔代数 逻辑运算符 基本逻辑运算 与 或 非英文关键词是 AND OR NOT约定等价符号 空格 无 减号 可单独用 也可组合使用 用法1 计算机药学应用用法2 计算机化学OR化工应用用法3 计算机应用 游戏说明 搜索引擎 自作主张 智能拆分用户关键词 2 命令搜索 2 模糊搜索 通配符 或 含义 每个 号代表任意多个字符用法 何 贵何 贵3 语句强制搜索 含义 表示整串匹配 防止歧义或拆分用法 I服了U 2 命令搜索 4 按网站地址搜索命令 site 关键词用法 site 学生活动site 含义 在湘南学院的网站上 搜索学生活动的情况报道 妙用 通过此命令 可把google作为站内搜索引擎 5 查询网址链接或盗链命令 link 关键词用法 link 含义 查询有哪些网页链接了湘南学院的网址 2 命令搜索 6 按文档类型搜索命令 filetype 文件扩展名用法1 物理化学试卷硕士filetype doc用法2 地球filetype jpgORfiletype bmp用法3 资产负债表filetype docORfiletype xlsORfiletype ppt7 按URL内容搜索 URL 网页的存放路径 命令 inurl 关键词用法 filetype docinurl wjhxinurl jpkc含义 URL中含无机化学 精品课程及文件名为doc 2 命令搜索 8 按网页标题中的关键词搜索命令 intitle 关键词1 关键词2 用法 intitle 郴州冰雪含义 对网页的标题栏进行查询 9 按网页正文中的关键词搜索命令 intext 关键词用法 intext 无机化学试卷含义 在正文中搜索目标内容 3 高级搜索 将上述多个命令表单化 任意组合使用 4 分类信息搜索 可通过google网站的分类功能操作 大学搜索 搜索特定大学的网站地图搜索 查询地址 捜索周边和规划路线快讯搜索 定制实时新闻 直接发至邮箱图片搜索 搜索超过几十亿张图片图书搜索 搜索图书全文 并发现新书网页目录 按分类主题浏览互联网网页搜索 搜索全球上百亿网页资料库学术搜索 搜索学术文章 其它网络搜索引擎 其它网络搜索引擎 中国雅虎 其它网络搜索引擎 按搜索内容分类 5 网站导航服务 如 第2节电子邮件和网络存储 一 电子邮件技术ElectronicMail 缩写E mail 又称电子信箱 电子邮政 是Internet一种重要的 异步通讯 应用技术 它集电讯和邮政于一体 以电的速度传递邮件 收信者可随时随地多次收取 彻底颠覆传统通信方式 一 电子邮件将文字 图形 图像 音频 视频等多媒体信息 以电子文档的形式 通过互联网与全世界Internet用户进行通讯和交换信息 瞬间完成通信任务的应用技术 二 电子邮件的特点 1 迅捷 几秒种就将信函发送到世界上任何有互连网的国家或地区 2 简单 随时随地 即写即发 并且可暂存 独发 群发 转发 定时自动发 3 经济 在上网基本费用的基础上 完全免费 免费邮箱 或适当收费 收费邮箱 4 安全 邮件可以长期保存 随时调取 传递失败会提示 退信 不会 丢失 信件 5 扩展用途 充当网络存储 6 集成附加功能 新闻 专题邮件 订阅电子杂志等等 三 邮件地址格式 邮件地址 又称邮箱地址 邮箱帐号 电子邮箱 电子信箱 获取途径 用户向ISP申请一个电子信箱 邮箱格式 由三部分组成 USER Name SERVER Name用户名 邮件服务器名 域名 1 USER Name 用户名 申请时自拟 必须具有唯一性 2 专用分隔符 读 at 或者 圈A 意为 在 3 SERVER Name 邮件服务器名 邮件送达目的地之域名 例如 hedugui 意为 何笃贵在网易公司 163公司 邮件服务器上的信箱 二 怎样选择电子邮箱 一般原则 安全性 稳定性 兼容性 功能性 长期性 简便性 明确使用目的和需求 选择最适合的电邮服务商 1 国际通信经常跟国外联系 建议使用国际电子邮箱 如Gmail Hotmail MSNmail Yahoomail等 2 国内通信相近性 QQ用户自动获得 QQ号 邮箱 腾讯公司收购了foxmail 在电子邮件领域有技术优势 地域性 根据用户所在区域选择地方性邮箱 工作性 大机构一般都自设邮件服务器 例如大学校园网 而且有的机构强调员工使用内部邮箱 3 超大附件 发送电邮附件 既有单件容量限制 又有总容量限制 目前很多邮箱总容量高达3 10G 可以用作 网络U盘 单件容量限制 单件容量一般不超过3MB 有的突破10MB 超大附件可用WinRAR之类软件压缩后再发 或者分割成多个允许容量的小包传送 关键问题 对方邮箱能否接受特大附件 否则毫无意义 4 是否会费费 收费邮箱提供更好 更安全的服务 一般来说 重要公务类 商务类的电子通信应该首选收费邮箱 目前网易VIP邮箱 188财富邮都很不错 尤其是提供多种名片设计方案非常的人性化 普通电子通信 使用免费邮箱完全满足需要 三 如何申请电子邮箱 选择合适的电邮服务商 登陆该网站 点击注册 填写用户信息 确定 设置信箱的辅助功能 四 如何发电子邮件 1 单发 群发 转发 演示 2 发附件 3 定时发信 4 自动转发 5 自动回复 6 验证收发功能 自己给自己发各类邮件 五 如何收电子邮件 演示 1 收阅邮件 2 下载附件 3 清理邮件 4 保存邮件 六 电子邮管理软件及用法 一 直接收发 直接登录邮箱帐户 即可收发邮件 适合于电子信箱不多的人 二 电子邮件管理软件拥有多个不同电子邮箱 通过专用邮件管理软件 极为方便 高效 目前常用的电子邮管理软件是 1 OutlookExpress Windows附带的 2 OfficeOutlook MsOffice组件之一 3 Foxmail 国产电邮管理软件 OutlookExpress的用法 一 设置邮件帐号 1 事先申请好一个电子邮箱的帐号 例如mymail 2 启动OutlookExpress 3 点击 工具 帐号 邮件 添加 邮件 4 进入Internet连接向导 出现 您的姓名 项 填入姓名 即将来发送邮件的发件人 5 进入 Internet电子邮件地址 项 选择 我想使用一个已有的电子邮件地址 在 电子邮件地址 栏中 填入已经申请过的电子邮件地址 mymail 6 需要填入电子邮件两个服务器名 大多数采用POP3与SMTP服务器 具体名称需从该电邮网站查找 7 键入帐户名和密码 帐户设置完成 即可收发邮件 二 邮件管理 收发邮件是OutlookExpress基本功能 管理邮件才是重要特色 1 设置接收邮件的规则 实现邮件自动化管理2 自动添加邮件签名3 拒收 垃圾邮件 4 备份地址簿5 脱机写邮件6 快速查找邮件 共享邮箱 特点 具有邮箱功能 网络硬盘功能 可直接共享他人网盘开放文档 例如吾乐邮箱 已经关闭 电子邮件注意事项 1 邮件主题必须一目了然 以免忽略或延误 2 书写邮件正文 应遵从传统书信的格式 礼仪 尊称收信人 敬语 寒暄 邮件正文内容 结尾客套语 发件人署名 日期3 零散小附件 用WinRAR压缩成合适的包文件 4 节日祝福邮件 切忌群发 网络存储 一 联想提供的5G免费网络硬盘随时随地收藏网址 记录文字 备份文档 与好友分享上传方便 可一次上传多个文件 有详细进度显示 内容不能完全公开 仅能与 我的圈子 或 二人世界 中的好友分享 申请地址 网络存储 三 阿里网盘阿里巴巴800M超大永久免费空间 最大上传文件支持200M支持提取码 提取文件更方便推荐好友注册赢取VIP会员资格支持个性空间 吧吧变你的空间你的地盘申请地址 四 G宝盘打造中国最大的文件社区 注册就拥有了G宝盘上传文件到1G免费空间永久保存 将你的文件和家人朋友分享 在G宝盘搜索你想要的文件 创立至今拥有6 513 682个文件 有3 547 082用户申请地址 网络存储 五 永硕E盘申请地址 专业数据存储 交流平台功能 保存文件 记事 可随时随地调用或与朋友分享 适用 个人文件存储 办公文件传递 团体资源交流等 特点 以二级域名形式直接登录 http 用户名系统稳定 反应迅速 界面简洁 易操作 支持各种类型文件 30M免费 六 纳米盘一种专用于交流文档资料的网盘 一般保存七天 资料下载频度越高 保存时间相应延长 需要安装一个特殊的客户端软件 才能上传 下载 多见于 小木虫 科研学术论坛的资源管理 第三节网上图书资源 一 网上图书资源目前主要有三类 专业图书馆 商业图书馆 免费图书馆1 专业图书馆国家 省市 大学 科研机构等图书馆 可在网上查询馆藏资源 检索书目 特点 公益性基础建设 以非盈利为目的 以传统出版物为主 主要供教学 科研机构 政府机关等内部使用 2 商业图书馆以盈利为目的 以数字化为基础的图书资源经营机构 我国目前主要的数字化图书馆有 1 超星数字图书馆 2 方正数字图书馆 3 书生之家 4 读秀 3 免费电子图书馆 网上有很多这类图书馆 但知识产权状态不明 图书种类单一 主要是文学类 史籍类无版权书籍 社科类 电脑类书籍 自然科学类的专业书籍极少 门类种类不全 科技学术应用价值不大 特点 非营利性经营 其动机不明 可能是为了增大网站的访问量 聚集人气 提高知名度 二 超星数字图书馆 国内最成功 最大的中文数字图书馆 据悉有30万 100万册无重复的电子图书 甚至被国家图书馆选作电子图书资源 其使用步骤如下 1 免费下载超星专用浏览器软件 并且安装 2 免费申请一个超星数字图书馆会员帐号 3 购买超星用户卡 并充值到帐号中 每年100元 07年增至300 4 联网 登录验证会员身份 在浏览器软件界面上检索所需的图书 既可在线阅读 也可下载阅读 5 下载 打印图书 有数量限制 每月 年 限多少本 多少页 6 付费会员可免费下载一些图书 但有些新书要额外缴费才能下载 通常是扣减会员有效期 7 通常 图书阅读软件每次都要联机验证有效性 方可阅读或下载图书 8 非付费会员无权阅读他人下载的图书 过期会员无法阅读过去下载的图书 续费则可 第四节学术期刊论文 一 学术期刊服务网站目前国内有三家影响较大的学术期刊文献网 1 中国知网国家知识基础设施 NationalKnowledgeInfrastructure CNKI 的概念 由世界银行提出于1998年 中国CNKI工程 1999年6月由清华大学 清华同方发起 集教育部 中宣部 科技部 新闻出版总署 国家版权局 国家计委 全国学术界 教育界 出版界 图书情报界等社会各界的力量和资源 建成了世界上全文信息量规模最大的 CNKI数字图书馆 号称 中国知识资源总库 为全社会提供知识资源传播 共享 增值利用 数字化学习 知识创新的信息化服务 主管部门 国家教育部主办单位 清华大学 2 万方数据资源系统 主要服务项目 3 维普资讯 重庆维普资讯有限公司 成立于1993年 前身是中国科技情报所重庆分所数据库研究中心 2005年 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