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果蝠属：棕果蝠、报尾果蝠 狐蝠属：琉球狐蝠：台湾狐蝠 狐蝠亚科 犬蝠属：犬蝠、短耳犬蝠 球果蝠属：球果蝠：布氏球果蝠 狐蝠科 大长舌果蝠属：大长舌果蝠：长舌果蝠 长舌果蝠亚科 小长舌果蝠属：安氏长舌果蝠 马铁菊头蝠、杏红菊头蝠、托氏菊头蝠、角菊头蝠、短翼菊头蝠、丽江菊头蝠、皮氏菊头蝠、云南菊头蝠、台湾菊头蝠菊头蝠科：菊头蝠属 大耳菊头蝠、贵州菊头蝠 间型菊头蝠：中菊头蝠 小菊头蝠：菲菊头蝠双色蹄蝠、大耳小蹄蝠、小蹄蝠、中蹄蝠、蹄蝠属 大马蹄蝠、台湾蹄蝠、普氏蹄蝠莱氏蹄蝠蹄蝠科 三叶蹄蝠属：三叶小蹄蝠 无尾蹄蝠属：无尾蹄蝠 小犬吻蝠属：皱唇蝠：皱唇犬吻蝠犬吻蝠科 犬吻蝠属：宽耳犬吻蝠 鼠耳蝠属：须鼠耳蝠 中华鼠耳蝠 喜山鼠耳蝠 ：南洋鼠耳蝠 宽吻鼠耳蝠 山地鼠耳蝠 西南鼠耳蝠 高颅鼠耳蝠 长尾鼠耳蝠：福建鼠耳蝠 绯鼠耳蝠：菲氏鼠耳蝠 水鼠耳蝠 中华水鼠耳蝠 长足鼠耳蝠 伏翼属：普通伏翼、小伏翼、东亚伏翼：家蝠 金背伏翼属 蝙蝠亚科 南蝠属：南蝠 蝙蝠属：双色蝙蝠、东亚蝙蝠：霜毛蝠、东方蝙蝠 棕蝠属 山蝠属：褐山蝠、绒山蝠、大山蝠 扁颅蝠属：扁颅蝠、褐扁颅蝠 阔耳蝠属 斑蝠属 黄蝠属：大黄蝠、小黄蝠：库氏黄蝠 中黄蝠 高头蝠 大耳蝠属：褐大耳蝠 灰大耳蝠 台湾大耳蝠长翼蝠亚科:蝙蝠科 长翼蝠属：亚洲长翼蝠（普通长翼蝠）、大长翼蝠（几内亚长翼蝠）、中长翼蝠/ 管鼻蝠属：金管鼻蝠、东北管鼻蝠、白腹管鼻蝠、中管鼻蝠、台湾管鼻蝠、管
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