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文档简介
精品文档关于开展检验新项目的申请报告呈医教部领导、院务部领导及相关领导:根据临床科室要求,依据上海物价收费规范,实验诊断科在充分验证的基础上,拟开展肿瘤药物相关基因检测(脱氧核糖核酸(DNA)测序),其上海物价收费代码如下:病原体检测项目编码项目名称价格标准肿瘤化疗药物相关基因检测270700003脱氧核糖核酸(DNA)测序600/项肿瘤靶向药物相关基因检测270700003脱氧核糖核酸(DNA)测序600/项该项目可以面向肿瘤科,胸外科,甲乳外科等。预计将新增收入1000万/年。化疗药物检测基因列表:药物名称检测基因检测位点吉西他滨CDAA79CG208A紫杉醇MDR1C3435TG2677T/A长春新碱MDR1G2677T/A甲氨蝶呤MDR1C3435TMTHFRC677T环磷酰胺MDR1G2677T/AXRCC1R399QMTHFRC677T铂类药物XRCC1R194WR399QERCC1C118TGSTP1I105V表柔比星GSTP1I105V5-FUMTHFRC677TDPYDIVS14 +1G A卡培他滨DPYDIVS14 +1G A阿那曲唑CYP19A1G161T来曲唑他莫昔芬CYP2D6C100T靶向药物检测基因列表:药物名称检测基因检测位点吉非替尼(易瑞沙)EGFR,KRASEGFR18,19,20,21号外显子厄洛替尼(特罗凯)KRAS 12,13,61,146密码子西妥昔单抗(爱必妥)KRAS,BRAFKRAS 12,13,61,146密码子帕尼单抗(维克替比)BRAF V600E威罗菲尼(Zelboraf, vemuragenib, PLX 4032)BRAFBRAF V600E伊马替尼(格列卫)KIT,PDGFRAKIT 9,11,13,17号外显子PDGFRA 12,18号外显子舒尼替尼KITKIT 9,11,17号外显子伊立替康UGT1A1启动子TA重复序列 有关该项目的临床意义和性能验证报告见以下附件。 妥否,请批示! 实验诊断科 2014-6-20附件 1一、肿瘤药物相关基因检测(脱氧核糖核酸(DNA)测序)(一)临床意义: 据我国卫生部统计,20世纪90年代我国肿瘤发病率已上升为127例/10万人。近年来我国每年新增肿瘤患者160170万人,总数估计在600万人左右,肿瘤已经成为我国的第一死亡原因。肿瘤患者对治疗有效性的提高需求迫切,2007年我国医院肿瘤用药销售额累计约为158.7亿元人民币,同比上一年增长高达61.2%,大大高于其它医疗药品的市场增长幅度。但抗肿瘤药物广泛应用的同时,给患者带来严重的问题:治疗的有效率不高、针对性不强、副反应较多、费用昂贵等。开展肿瘤诊疗个体化、靶向诊疗工作,开展预测预报职能的转化医学分子病理检测项目,把基础研究中某些经循证研究成熟的项目在规范化的医疗系统平台上进行转化应用,过渡到临床肿瘤的术前、术后、姑息、支持等各阶段的治疗方案应用,配合跟进临床路径进行检测。首先针对肿瘤病人的各种个体化/靶向治疗需求,用药前进行临床预测分析和治疗预后评估,根据个体化肿瘤临床方案和路径设计检测项目,深入NCCN癌症综合治疗规范内容体系内,规范检测结果,引导临床路径治疗方案,努力使不同个体基因特征的肿瘤病人治疗获益,减少毒副作用,提高无病生存期和延长生存预后;其次可使晚期癌症患者根据NCCN规范再次得到针对性的个体化/靶向治疗,提高生存质量,体现临终关怀和困难病例检测救助。更重要的方面是为不具备基因靶点病人节省费用和毒副作用,减少了患者经济、心理负担。根据NCCN肿瘤学临床实践指南建议,肿瘤个体化用药基因检测是服用靶向药物时所需必检项目。这不仅可以为肿瘤患者提供个体化用药的指导,帮助治疗,还可以节约大量的医药费用。2013年国家卫生部于发布了卫生部临床检验项目目录中,规定了相关临床基因检测项目,其中涉及肿瘤个体化治疗及诊断的检测项目占了主要位置。药物基因组学检测:l CYP2D6药物基因组学临床检测与用药个体化用药l DPYD药物基因组学临床检测与氟尿嘧啶类药物代谢分析l EGFR基因突变检测预测易瑞沙等TKI类药物敏感性l UGT1A1基因型及伊立替康用药指导l KRAS药物基因组学临床检测及用药指导l KIT和PDGFR基因检测突变与格列卫类药物敏感和耐受的用药指导本项目是肿瘤个体化治疗项目中的个体化用药,以服用特定肿瘤靶向、化疗药物的患者为终端销售对象,华大医学与医院合作的形式,提供EGFR、KRAS、PDGFRA、KIT、BRAF、PDGFR等5种肿瘤靶向药物相关基因突变检测以及ERCC1、XRCC1、GSTP1、MDR1、CYP19A1、CYP2D6、UGT1A1、DPYD、MTHFR、CDA等12种肿瘤化疗药物相关基因多态检测技术服务。目前肿瘤个体化用药基因检测技术有:PCR-RLFP、PCR-SSP、RT-PCR、Arms-PCR、PCR测序、MALDI-TOF MS等。本项目通过提供Sanger测序技术等技术平台选择,进行肿瘤相关基因的检测,通过预测肿瘤相关基因与药物的关系,在患者用药前进行药物疗效及毒副作用的与分析,协助医生对患者进行针对性治疗。其具有较高的准确性、特异性、灵敏性,符合临床检测要求,具有良好的临床应用价值。(二)技术的基本情况: 基于Sanger链终止法的Sanger测序方法通过四色荧光分别标记四种ddNTPs来识别A、T、C、G,可在一个反应管中完成循环测序反应,并通过一个电泳道即可完成测序。Sanger测序是临床检测的“金标准”,在基因检测中应用广泛,通常作为其他技术对照的指标。华大医学采用基于Sanger测序原理的一代测序仪对肿瘤用药相关基因进行检测,其优势如下:(1) 自动化、低成本Sanger测序仪包括自动化进行灌胶、上样、电泳分离、检测及数据分析,在无需人工干预的情况下连续运行24小时。其高度的自动化的碱基识别、基因型分析与质量评分判定,不仅减少劳动力且降低人为失误的成本。(2) 高分辨率Sanger检测仪特有的动态内镀毛细管壁,使读序长度达1000bp以上,精确读序达800bp。(3) 高灵敏度通过毛细血管内荧光检测系统、后置超薄CCD检测系统等光路系统使得测序的荧光信号强度高度均一,提高DNA检测的灵敏度。(4) 快速一次电泳测定96个样品,一天可跑12次测序电泳,每天的测序产率是1152个样品。(三)申请科室开展该技术的必要性和可行性:开展肿瘤药物相关基因检测(脱氧核糖核酸(DNA)测序)与我院的功能、任务相适应,对我院肿瘤相关疾病的诊治具有重要意义。实施肿瘤药物相关基因检测(脱氧核糖核酸(DNA)测序)项目,具体方案如下:在各相关科室,开展肿瘤药物相关基因检测(脱氧核糖核酸(DNA)测序)相关知识的培训、讲座,普及医生相关知识,由医生为患者开化验单;由临床护士负责实施患者样本的采集,由检
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