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文档简介

此文档收集于网络，如有侵权，请联系网站删除Human immunodeficiency virus（HIV）pol基因核酸序列分析BLAST软件的定义 BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST软件的功能 BLAST对一条或多条序列(可以是任何形式的序列)在一个或多个核酸或蛋白序列库中进行比对。BLAST还能发现具有缺口的能比对上的序列。 BLAST的五种软件的选择如下表所示程序名称查询序列搜索的数据库BLASTN核酸核酸BLASTP蛋白质蛋白质BLASTX核酸的6个读框蛋白质TBLASTN蛋白质核酸的6个读框TBLASTX核酸的6个读框核酸的6个读框Human immunodeficiency virus（HIV）pol基因核酸序列的获取第一步：访问/第二步：1.在输入框前一栏选择“Nucleotide” 2.在输入框中输入“Human immunodeficiency virus pol gene” 3.点击“search”第三步：选择第一个进入点击进入后的页面第四步：在该页面复制核酸序列复制核酸序列用BLASTN软件对Human immunodeficiency virus（HIV）pol基因核酸序列进行分析第一步：访问/第二步：1.点击页面左侧“BLAST”按钮 2.进入BLAST后点击“go”第三步：1.选择“blastn”。 2.在Enter accession number(s), gi(s), or FASTA sequence(s)的输入框 内将复制的核酸序列粘贴上去。 3.点击页面左下方按钮便可得到分析结果。 图形结果分析：不同颜色代表不同匹配程度。其中红色匹配程度最高。具体序列列表具体匹配情况，若不匹配则没有配对的小杠。除开BLAST其他的同类软件还有FASTA，ClustalW等1、 FASTA FASTA是另外一个根据用户提交的单个序列进行数据库搜 索比对的程序，一般认为FASTA对于核酸序列的搜索比对比BLAST 要好。它们的区别在于所搜索的数据库种类不同。2、ClustalW 它是在
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