从结构化电子病历到大数据系统

从结构化电子病历到 大数据系统,王安莉 高级工程师 中南大学湘雅三医院 信息中心2014.5,第一部分 医院信息数据介绍,第二部分 结构化信息（电子病历）,第三部分 湘雅大数据技术架构,第四部分 大数据项目简单实例介绍,目 录,遵循业界标准规范如HL7、IHE、ICD10、SNOMED等,共享,安全,体系,易用,标准,架构,角色管理、权限管理、日志管理、数据安全、应急方案,总体架构科学合理是数字化医院可持续发展的基石,信息共享、互联互通医院内部系统之间、内部和外部系统之间,易操作、模块化、平台化快速部署、可扩展、易维护,全面数字化的建设不只是业务实现，更是管理、决策支持,数字化医院的建设思路,临床管理信息化（CIS）,医院管理信息化（HIS ）,建设内容：3521工程，区域一体化医院信息、人口健康档案、疫情上报与应急指挥、远程医疗等系统特征：云计算、移动医疗、大数据、物联网、智慧医疗,建设内容：电子病例、医生工作站、PACS、LIS、RIS等系统特征：信息系统的整合，集成平台、临床数据中心（CDA）,建设内容：部门级信息化管理、全院级信息化管理，例如财收费管理系统、人力资源管理系统等 特征：数据共享和基于财务核算为中心,区域医疗信息化（HGIS）,医院信息化的发展历程,医院信息数据介绍-横向：全流程,医院信息数据介绍-中心：电子病历,积累了大量的数据，为大数据建设提供了有力的数据支持,四所医院已有数据积累情况,比任何一家国内外医院的医疗数据都多，数据量都大，具有极大的科研价值,各家医院已建立了较完善的医院信息系统，四家医院信息化水平居全省领先，全国先进的水平。医疗数据比较全面，覆盖了整个医疗过程。有结果信息，也有过程信息。医疗数据类型复杂、多样。数值、字符、图片，媒体文件。有结构化、半结构化、非结构化。在国家缺乏标准的情况下，数据标准化程度不高数据利用率低。仅做病案、财务统计、上报政府的报表等。,医院信息数据介绍,第一部分 医院信息数据介绍,第二部分 结构化信息（电子病历）,第三部分 湘雅大数据技术架构,第四部分 大数据项目简单实例介绍,目 录,结构化信息（电子病历）,数据来源的核心-结构化电子病历,结构化电子病历是指从医学信息学的角度将以自然语言方式录入的医疗文书按照医学术语的要求进行结构化分析，并将这些语义结构最终以关系型(面向对象)结构的方式保存到数据库中。,按照元素制作模板，按照元素选择或录入数据，按照元素随意组合检索、挖掘数据,关键字,1、病案首页信息,患者基本信息,患者住院信息,患者手术信息,患者诊断信息,医院已有的结构化信息,2、患者医嘱信息（门急诊及住院）,医院已有的结构化信息,3、患者体征信息,4、医技信息（门急诊及住院）,医院已有的结构化信息,5、体检信息,医院已有的结构化信息,6、随访信息（门急诊及住院）,结构化信息（电子病历）的核心-模板,总的统一起来，模板可以分为三大类：全院通用的科室专用的病种专用的,结构化信息（电子病历）,模板制作的简介以湘雅三医院为例,选择结构化模版,原则：开动脑筋，满足临床需要+大数据需要+便捷操作的需要,元素过多，操作繁琐，元素过少，无法检索，合理科学的制作，有效的利用,持续完善模板的过程,潜移默化字里行间中收集数据才是大数据系统采集的“不老泉”,结构化信息（电子病历）,1、结构化的信息是最便于数据分析、挖掘、检索的，其次是半结构化和非结构化的信息。2、在本院信息化和结构化电子病历无法满足的情况下，可以开发少量的小型挂靠电子病历的科研评估单等形式的小软件。3、最终数据来源应遵从“28原则”，即80%的常规集四家医院院内信息系统采集的数据，20%来自自编小软件。4、建议项目启动之初与本院信息中心的技术人员多沟通，以及与其他医院本项目涉及专家先行沟通。秉承大湘雅精神。,第一部分 医院信息数据介绍,第二部分 结构化信息（电子病历）,第三部分 湘雅大数据技术架构,第四部分 大数据项目简单实例介绍,目 录,湘雅大数据技术架构-制定标准,按照国际HL7等医疗信息标准体系及卫计委互联互通标准数据集规范等要求，形成了中南大学湘雅大数据标准数据集，为后续的大数据分析应用的权威性、标准性、可靠性和互通性奠定了基础，能实现与国际、国内各数据平台、分析平台、挖掘工具的便捷接轨。,十七类数据900余张表上万个字段800余页标准,持续完善中,各医院,数据中心,湘雅大数据技术架构-数据流,传输速度快数据安全可靠访问、权限管理所有类型均可传送,标准数据集,标化工作 方言 普通话,各院不同的数据集,挖掘、分析、科研、教学等应用,建议由各院信息中心参与完成,湘雅大数据技术架构-接口规范,只有形成规范和标准，各项目的院际信息互通和集多“家”所长的信息才能有达到预期的效果，让应用最大化，得到的结论才能被国内、国际数据同行的认可。,形象图例：,标准数据集,按标准数据集开发形成的CDA格式才可供全数据的有效应用,医院现有数据结构,第一部分 医院信息数据介绍,第二部分 结构化信息（电子病历）,第三部分 湘雅大数据技术架构,第四部分 大数据项目简单实例介绍,目 录,大数据项目简单实例,第一步：有一定的目标：预测、分析、科研、教学、辅助决策、“提纯”,特色背景基础,大数据项目简单实例,1、根据项目所涉范围确定数据的采集，全临床流程，全管理流程，全科研流程,2、本院范围：见大数据项目培训资料之一-医院现有临床信息系统已经结构化的信息,第二步：有哪些数据可供采集？,完善EMR模板收集数据,潜移默化、字里行间系统收集患者病史、疾病诊断、治疗、随访等临床流程详细数据和资料,大数据项目简单实例,第三步：按标准“清洗”数据，形成标准文档,软件工程师,大数据项目简单实例,第四步：按web service接口传送数据,医院信息,接口,中南大学大数据中心,传输速度快,传输的可靠性,对并发传递的要求,传送优先级别,传递数据的内容可以管理,访问，数据权限管理,确定传送周期,传递的安全性,大数据项目简单实例,第五步：如何计算？得到自己想要的结果。,*结构化：数值型数据（检验结果、费用信息