SCI_论文写作剖析ppt课件

好文章 三要素 张辉中山大学人类病毒学研究所Email zhangh92 1 SCI Sciencecitationindex 由美国科学信息研究所 ISI 1961年创办出版的引文数据库SCI 科学引文索引 EI 工程索引 ISTP 科技会议录索引 是世界著名的三大科技文献检索系统SCI论文 在SCI所收录的科学期刊上发表的论文 2 影响因子 impactfactor IF 指的是某一期刊的文章在特定年份或时期被引用的频率 是衡量学术期刊影响力的一个重要指标 计算方式 某杂志2008年的IF 2006 2007两年论文在2008年被引总数 除以在2006 2007两年所发论文总数 3 杂志的IF愈高 品牌效应愈大 审稿更严格 投稿难度愈大但是 发表在IF高的杂志 不见得学术价值就大 单篇学术论文的引用频率更重要 引用频率愈高 其学术价值愈大 所发杂志的IF高 单篇的引用频率也高 就是最有价值的论文 也不见然 4 IF 5 6Citations 40 5 6 一篇SCI学术论文的产生流程 提出假说实验设计 预实验全面展开实验结果分析论文写作与修改送出发表补充实验和回答审稿人的问题 至少3月 一般半年 可达1 2年 Read Hardwork Pray 自己掌握时间 第一阶段 第二阶段 第三阶段 7 好文章三要素1 好主意 Goodidea 2 有逻辑的结构 Logicstructure 3 精美的数据 Beautifuldata 8 1 好主意 假说 眼光 Vision 知识面 Knowledge 灵感 Inspiration 机遇 Chance 计算 Calculation 勇气 Courage 新颖性和意义 Noveltyandsignificance 9 1 眼光 Vision 洞察力手握水晶球预见未来的能力预知本学科发展的方向既考导师也考你 诺查丹玛斯的预言李淳风与袁天罡的推背图刘伯温的烧饼歌 10 2 灵感 Inspiration 鬼点子 脑筋急转弯 多与导师 同学讨论 互相启发 真理面前 人人平等 11 3 知识面 Knowledge 本行 熟读唐诗三百首 不会作诗也会吟 他行 他山之石 可以攻玉 不相关 功夫在诗外 尤其是要紧跟本行中的最新进展 积极追踪时尚元素 12 读文献十问 1此文解决了什么问题 2你能用一句话概括此文的中心思想吗 3此文的logicflow清楚吗 试简述之4此文最重要 最创新的的图表 数据 是哪一个 5此文最切合主题图表 数据 是哪一个 此文最大的纰漏是什么 若你是此文的第一作者 你下一步干嘛 哪个图表最值得你学习和效仿 9有值得你学习的实验方法吗 10你最欣赏哪句英语 Journalclub上要回答的问题 13 4 机遇 Chance Chancefavorsthepreparedmind机遇偏爱有准备的头脑 巴斯德 14 什么是 有准备的头脑 1 有足够的知识面2 有所需的技术3 正在从事类似的工作 位置站得不错 4 完成了前期工作 打伏击战 15 16 Nature July2002 Nature May2003 17 November2003 18 19 20 5 计算 Calculation 自己 对手 时间 资源 风险 知己知彼 百战不殆 孙子夫未战而庙算胜者 得算多也 未战而庙算不胜者 得算少也 多算胜 少算不胜 而况于无算乎 孙子凡事预则立 不预则废 礼记 中庸 21 6 勇气 Courage 若你的发现是真的 而你所从事的工作又在热点上 那你就有竞争者 idea愈好 竞争愈烈 本人因此 要有强烈的竞争意识和危机感 两军相逢勇者胜 刘伯承 古代剑客们 在与对手狭路相逢时 无论对手有多么强大 就算对方是天下第一剑客 明知不敌 也要亮出自己的宝剑 即使倒在对手的剑下 也虽败犹荣 这就是亮剑精神 李云龙 若遇到可发CNS文章的课题 哪怕不吃不喝 睡在实验室 也要把工作尽早完成 AnunknownPhDstudent 22 2 结构 Logicstructure 23 编一个完整的故事 Makeaperfectstory 组织你的数据 从生化实验 动物实验 到临床实验 做实验的顺序和论文的顺序会大不相同 24 逻辑流 Logicflow 内涵与外延 因果 判断和推理等等 学一点形式逻辑 25 每张图表 每个数据的重要性是不一样的 骨骼与肌肉的关系 26 抢先回答别人可能的问题 27 3 精美的数据 Beautifuldata 28 对照 Control Control Control 29 叫人印象深刻的发现 Impressivefindings 30 多重验证 同一结果 两种以上的方法证实 公认的技术验证 31 统计学分析样本量统计方法说服你自己 32 问泉那得清如许为有源头活水来 实验生物学家 Experimentalbiologist 是手巧的工匠 更是思想家 33 34 BiochemicalPurificationandIdentificationofAPOBEC3G AssociatedProteinsbyTandemPurificationAssay TAP 35 脑筋急转弯 MicroRNA有可能抑制了HIV 1什么环节 而且有重大意义 在潜伏感染时 HIV 1的蛋白表达明显减少 是不是由于miRNA抑制所致 36 GenomicDNA PolII Drosha Exportin5 Dicer Pri miRNA Pre miRNA miRNA TargetmRNA protein miRISC P body GenerationandfunctionofmicroRNA 37 HIV 1的生活周期 结合受体 膜融合和进入 反向转录 入核和整合 转录 出核 装配 翻译 出芽 成熟 RNA DNA 前病毒 RNA 病毒蛋白质 病毒颗粒 38 HIV 1latencyPre integrationlatency APOBEC3Gcouldplayakeyrole Post integrationlatency ThemajorHIV 1reservoirinthepost HAARTera 39 RestingCD4T cells ActivatedorincompletedactivatedCD4T cells Activation Formationofpost integrationHIV 1latency Nostimulation 40 MechanismofHIV 1post integrationlatencyTranscriptionalinefficiencyNF kB NFAT CDK9 CyclinT1TatproteinPost transcriptionalsuppressionRev 41 AdaptedfromHanandSiliciano NatureMedicine2007 13 1138 40 42 Furtado M R etal NEJM 340 1614 22 1999 Chun T W etal PNAS 100 1908 13 2003 Lassen K G etal PLoSPathog2 e68 2006 Zhang L etal NEJM 340 1605 13 1999 Patterson B K etal AIDS 15 1635 41 2001 Latently infectedrestingCD4T cellsharborvariousviralRNAs Incompletedtranscript Multiple splicedRNA UnsplicedRNA IntegratedviralDNA 43 vpr RRE LTR vif pol env vpu nef gag 1 9 Kb 7261 9172nt A 7261 7960nt B 7961 8351nt C 8291 8691nt D 8631 8981nt F 9047 9172nt LTR E 8921 9046nt tat rev 1 2 Kb 7961 9172nt HIV 1RNAgenomeandits3 UTR 3 UTRsharedbymostHIV 1RNAs 44 pCMV pA eGFP FragmentsofHIV 13 UTR NucleofectionwithAMAXA RestingCD4T cells 45 RelativeGFPMFI 骨干数据 46 IsolationofrestingprimaryCD4T lymphocytes RestingCD4 Tcells ActivatedCD4 Tcells CD25 CD69 47 CD25 CD69 CFSE RestingCD4Tcells RestingCD4Tcells combinedanti mirs RestingCD4Tcells pNL4 3 RestingCD4Tcells pNL4 3 anti mirnegctl RestingCD4Tcells pNL4 3 combinedanti mirs ActivatedCD4Tcells pNL4 3 TheanalysisofcellproliferationstatusofrestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3andanti microRNAinhibitors 48 49 MiRNAarrayanalysistocomparecellularmiRNAsinrestingandactivatedCD4T cells 50 PutativebindingsitesforrestingCD4T cell enrichedcellularmiRNAs B5 D3 D9 F3 51 ConfirmtheenrichmentofseveralcellularmiRNAsinrestingCD4T lymphocytesby stem loop RT PCR 52 NL4 3 nt9097 5 AUCUG AGCCUGGGAGCUCUC 3 llllllllllllllmir 283 GAGUUAUCUGACACUCGAGGAA 5 NL4 3 nt8096 5 ACGAGGAUUGUGGAACUUCUGGGACGCAGGGG 3 lllllllllllllllmir 125b3 AGUGUUCAAU CCCAGAGUCCCU 5 NL4 3 nt8957 5 UCGAGCUUGCUACAAGGGACUUU 3 lllllllllllllllllllmir 3823 GCUUAGGUGGUGCUUGUUGAAG 5 NL4 3 nt8113 5 UCUGGGACGCAGGGGGUGGGAA 3 llllllllllllllllmir 1503 GUGACCA UGUUCCCAACCCUCU 5 NL4 3 nt8720 5 AGGGGUCA GAUAUCCACUGACC 3 lllllllllllllllmir 2233 CCCCAUAAACUGUU UGACUGU 5 InteractionofcellularmiRNAsandtheirtargetsinthe3 endofHIVRNA 53 mir 125b GFP GGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTC GFP GGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGTCTATCTC mir 28 GFP ACGAGGATTGTGGAACTTCTGGGACGCAGGGG GFP ACGAGGATTGTGGAACTTCTGGGACGACTTTT GFP GTGGAACTTCTGGGACGCAGGGGGTGGGAA GFP GTGGAACTTCTGGGACGCAGGGGGTGTTCC mir 150 GFP CACCAGGGCCAGGGGTCAGATATCCACTGACC GFP CACCAGGGCCAGGGGTCAGATATCCAAGTCAA mir 223 GFP CTGCTGACATCGAGCTTGCTACAAGGGACTTT GFP CTGCTGACATCGAGCTTGCTACAAGGTCAGGG mir 382 F5mF5B13mB13B12mB12D10mD10D11mD11 Mutationsinthe seed sequences 54 Mutationsin seed sequenceeliminatethemiRNA mediatedinhibition 骨干数据 55 Ago Agocleavespassengerstrand TwostrandsaredissociatedbyanRNAhelicase Agoloading BindtotargetmRNA Removepassengerstrand miRNA Antisenseinhibitor 2 O methyl oligonuceotides Translationinhibition 56 EffectofantisenseinhibitorontheGFPexpressionofpGFP 1 2kb 57 HIV 1infectiousclone Nucleofection AsimpleHIV 1latencymodel TransduceHIV 1infectiouscloneintothenucleusofrestingCD4T cellswithAMAXA miRNA 58 CD25 CD69 CFSE RestingCD4Tcells RestingCD4Tcells combinedanti mirs RestingCD4Tcells pNL4 3 RestingCD4Tcells pNL4 3 anti mirnegctl RestingCD4Tcells pNL4 3 combinedanti mirs ActivatedCD4Tcells pNL4 3 TheanalysisofcellproliferationstatusofrestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3andanti microRNAinhibitors 59 HIV 1mRNAexpressionintheCD4T cellstransfectedwithpNL4 3 60 InductionofHIV 1productionfromtherestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3 61 EffectofmiRNAantisenseinhibitorsonHIV 1productionfromrestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3 骨干数据 62 63 HIV 1copynumbers 5 0005005050 No 1No 2