【毕业学位论文】（Word原稿）大豆胞囊线虫病候选抗性基因Rhg4和GmHs1pro-1 SNP标记的开发应用及抗性新基因的发掘作物遗传育种博士论文

密 级： 内部 5 年 论文编号： 中国农业科学院 学位论文 大豆胞囊线虫 病 候选抗 性 基因 记 的 开发应用及抗性新基因的 发掘 5 I 摘 要 大豆胞囊线虫（ 给 世界 大豆 生产造成了 严重 损失 ， 抗 病 品种选育是 目前 最经济有效的防治方法 ，而发掘新抗 性 基因和鉴定新型抗病种质是培育持久性抗病品种的根本保障。 本研究 分析了 选 抗 性 基因 序列 多 态 性 ，并 将 发现的 8 个 化成 记， 建立了 型方法，分析了 栽培大豆和野生大豆的 布特点及其 与 性关系 ，并利用 130 个 记 和 开发的 8 个 记 分析 了 41 份大豆新种质的基因型 ， 为合理利用大豆种质拓宽 抗 性 遗传基础 以及 记辅助选择 提供理论依据 和技术手段 。 主要结 果 如下： 1、建立了 豆 型方法 。该 方法 采用 理，针对 单 个 点设计 2 个 相差 4 5特异引物和 1 个公用引物 ； 在 2 个特异引物 3端第 3 和 4 碱基位置分别人为引入错配碱基 来 提高 异性 。 物约 100 150用 6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳可 同时检测纯合和杂合基因型 。 利用该方法已完成参试种质的 析。 2、明确了大豆 列 多 态 性 及其与 性关系。大豆 列 多 态 性 较高。 点 1592、 1724、 1760、 2120 和 2387 在野生大豆、地方品种和选育品种 间以及选育品种和核心种质间 的分布差异显著， 为核心种质的补充和调整、 利用 野生大豆和地方品种 丰富 抗 性遗传基础 提供了理论依据 。 上述 5 个 点在 抗、感种质中的分布表明， 制着大豆对 抗病作用。 3、明确了大豆 列 多 态 性 及其与 性关系。本研究获得了全长 1477 比， 序列 多态性 略低。栽培大豆多样性明显低于野生大豆，这可能 是 人为 选择的结果。 3 个 点 177、 1036 和 1380 在野生大豆与栽培大豆间的分布差异显著，为合理利用野生大豆拓宽大豆品种遗传基础提供了依据。 上述 3 个 点在 、感种质中 的 分布表明， 能与大豆对 性无关。 4、 发现 了 病 基因 新种质 。 用 130 个 8 个基于 记分析了来自 品系的 41 份 大豆 新种质 ，明确了 其中 31 份 抗病种质的基因型。 病基因 ，关联分析 检测到 23 个与抗性显著关联的 记，其中 6 个 点 的抗病 基因型 来自 其余 17 个 来自晋品系 亲本 ，其中 晋品系亲本 在1b 有 至少 1 个 病 新 基因 。 用 时 评价感病品系的准确率达 100%，抗病品系的准确率达 关键词 ： 大豆 ，大豆 胞囊线虫 ， 抗 性 基因 ， is a in an to or to a or is an to CN In we of CN at in to of in CN is an in or CN it is as CN on in CN so we NP a NP CN 1 as 30 as 1. of a NP in 5bp a in NP as a CR of 00bp 50 5bp in be % An at rd th to of of CR in to CR by CR 4 It NP in we of 2. NA in in in at NP 592, 1724, 1760, 2120 387 or be of or of a in to 3. NA in 477it NA in by NP 77, 1036 380, we t of 4. of a SR CN AS CN 41 in 30 We 23 at 7 in 3 G no TL CN G by we in at a G We SR of 录 第一章 绪论 . 1 究意义 . 1 育抗病品种是挽救因 成经济损失的必然选择 . 1 掘抗 性 基因是拓宽抗 性 遗传基础、培育持久性抗病品种的根本保障 . 1 性的分子标记辅助选择是提高抗病育种效率的重要举措 . 1 课题研究意义 . 2 内外研究现状 . 2 理小种的划分及其分布 . 2 源筛选及抗病品种选育 . 3 性基因定位及抗性的分子标记辅助选择 . 6 豆胞囊线虫病候选抗性基因 . 12 豆 究进展 . 13 国 病核心种质 . 14 研究目的 . 15 第二章 选抗性基因 样性 . 16 料与方法 . 17 料 . 17 豆基因组 取 . 17 物设计及 应 . 18 物检测及测序 . 18 据分析 . 19 果与分析 . 20 列的比较 . 20 列多态性 . 20 性检测 . 23 锁不平衡与重组 . 24 变热点和冷点预测 . 25 试种质的 化分析 . 25 论 . 26 序列多态性 . 26 生大豆与栽培大豆序列多态性比较 . 27 倍型与抗性的关系 . 28 大豆基因组中可能存在多个拷贝 . 28 第三章 大豆 型方法 V （ . 29 料与方法 . 30 料 . 30 . 30 果与分析 . 31 取多重 理提高分型特异性 . 31 引物 3端不同位置人为引入错配碱基提高分型特异性 . 31 物浓度和退火温度对 增效果的影响 . 32 测准确性分析 . 33 论 . 34 第四章 不同类型大豆种质中的分布及其与抗性关系 . 36 料与方法 . 36 料 . 36 法 . 36 果与分析 . 37 位基因在野生大豆和栽培大豆中的分布 . 37 倍型在野生大豆和栽培大豆中的分布 . 38 抗性的关系分析 . 40 论 . 44 于 记辅助抗性选择 . 44 倍型与核心种质的更新 . 44 方品种和野生大豆是进行抗病品种改良的重要种质资源 . 44 第五章 选抗性基因 样性 . 45 料与方法 . 45 料 . 45 豆基因组 取 . 46 物设计及 应 . 46 物检测及测序 . 47 据分析 . 47 果与分析 . 47 列分析 . 47 序列多态性 . 48 锁不平衡分析 . 51 7 份大豆种质的进化关系 . 52 性的关系 . 52 论 . 53 序列多态性 . 53 为选择造成的 “遗传瓶颈 ” . 53 关系 . 54 第六章 不同类型大豆种质中的分布及其与抗性关系 . 55 料与方法 . 55 料 . 55 型引物 . 56 . 56 据分析 . 56 果与分析 . 57 位基因在大豆中的分布 . 57 其组合单倍型与抗性的关系 . 58 论 . 60 第七章 大豆抗 种质的分子标记 . 61 料与方法 . 62 料 . 62 豆基因组 取 . 62 子标记 . 63 抗性鉴定 . 63 计分析 . 63 果与分析 . 63 豆新品系对 的抗性分析 . 63 性与 记的关联分析 . 64 代品系在 23 个抗性关联 点的基因型 . 66 论 . 68 豆抗胞囊线虫新种质的遗传基础 . 68 豆抗胞囊线虫基因及其分子标记辅助选择 . 68 第八章 结论 . 70 确了大豆 列多态性 . 70 立了大豆 型方法 . 71 确了 性的关系 . 71 现了 病新种质中新的抗性基因位点 . 71 参考文献 . 72 附 录 . 84 致 谢 . 100 作者简历 . 101 文缩略表 英文缩写 英文全称 中文名称 豆胞囊线虫 核苷酸多态