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文档简介
实验六大肠杆菌感受态细胞的制备和转化,基因工程的基本路线,PCR,质粒DNA提取和酶切,连接,转化,操作步骤,(一)受体菌的培养1、70或20低温冰箱取出菌种后,在LB培养液中培养过夜,进行活化;2、取几微升活化后的菌液(取量视菌的密度而定)在LB平板上涂布,于37培养箱中培养24h;从LB平板上挑取单菌落,接种于3-5mlLB液体培养基中,37下振荡培养12小时左右,直至对数生长后期。3、将该菌悬液以1:100-1:50的比例接种于LB液体培养基中,37振荡培养2-3小时至OD6000.5左右(生长对数期)。(注:这一步非常关键。培养过度的菌液含有较多的“老”细胞,制备成感受态细胞后其接受外援DNA能力较低,从而导致转化率降低。),(二)、感受态细胞的制备(CaCl2法)1、将1.5ml菌液移入离心管中,冰上放置10分钟,然后于4下5000rpm离心5分钟。2、弃去上清(轻轻倾倒掉上清液,并用吸水纸或移液器移除残余的过多水分)。3、加入1ml预冷的0.1mol/L的CaCl2溶液,轻轻拨动管底使细胞完全悬浮,冰上放置15分钟后,4下5000rpm离心5分钟。3、弃去上清,加入0.2ml预冷的0.1mol/L的CaCl2溶液,轻轻悬浮细胞,即制成感受态细胞。将感受态细胞悬液分装成2份,每份100l(注意悬液密度要均匀)。冰上放置备用。4、暂时不用的感受态细胞可置于-80保存。,注:CaCl2处理后的细胞比较脆弱,尽量温柔操作!,(三)质粒pUC19的转化质粒和感受态细胞混和:分别在100l感受态细胞悬液中加入下列DNA质粒或水,轻轻摇匀后冰上放置30分钟。100l感受态细胞+pUC19质粒2l(10ng/ul)(含量不超过50ng,体积不超过10l)100l感受态细胞+无菌水2l(阴性对照)热击:42水浴中热击90秒(注:精确计算时间,过长将对细胞造成伤害),热击后立即置于冰上冷2-5分钟(禁止摇动)。复苏:向每管中加入400lLB液体培养基(注:不含Amp),混匀后37轻摇培养11.5小时,使细菌恢复正常生长状态,并表达质粒编码的抗生素抗性基因(Ampr)。,实验目的,掌握氯化钙法制备与转化感受态细胞的原理、方法和技术。学会对质粒转化结果的评估。,实验原理,转化(Transformation)是将外源DNA分子引入受体细胞,使之获得新的遗传性状的一种手段,它是微生物遗传、分子遗传、基因工程等研究领域的基本实验技术。如需将质粒载体转移进受体细菌,需诱导受体细菌产生一种短暂的感受态以摄取外源DNA。细胞经过一些特殊方法(电击法、CaCl2法等处理后,细胞膜的通透性发生了暂时性的改变,成为能允许外源DNA分子进入的细胞,即感受态细胞(Compenentcells)。,0.1mol/LCaCl2是一种低渗溶液,在0冷冻处理大肠杆菌细胞时,细胞膨胀成球形,DNA可吸附在其表面。在短暂的热冲击下,细胞可吸收外源DNA。摄入了外援DNA的细胞在丰富培养基内复制并增殖,表达外源基因。带有选择标记基因的外源载体在受体细胞内表达时,受体细胞表现标记基因的表型,使转化子与非转化子在选择培养基上区分开来。,Ampr:抗氨苄青霉素内酰胺酶,多克隆位点:外源DNA片段的插入位点,Amps菌株,Ampr,涂布于含Amp的培养基上,可以生长。次日可见白色菌落-转化子。,培养基上含有X-Gal和IPTG时,可使用蓝白斑筛选方法鉴别真正的重组的转化子。,蓝白斑筛选的原理(-互补),蓝白斑筛选的原理(-互补),现在使用的许多载体都带有-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控序列和前146个氨基酸的编码信息。在这个编码区中插入了一个多克隆位点(MCS),它并不破坏读框;宿主细胞编码-半乳糖苷酶C端部分序列。这样,宿主和质粒编码的片段虽都没有酶(-半乳糖苷酶)活性,但它们同时存在时,可形成具有酶学活性的蛋白质。这种现象称为-互补。由-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落,因而易于识别。然而,当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地导致无-互补能力的氨基端片段,使得带有重组质粒的细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,称为蓝白斑筛选。如用蓝白斑筛选则经连接产物转化的平板37温箱倒置培养12-16hr后,有重组质粒的细菌形成白色菌落。,材料、设备及试剂,材料E.coliDH5菌株:R-、M-、Amp-(转化过程所用的受体细胞一般是限制修饰系统缺陷的变异株,即不含限制性内切酶和甲基化酶的突变体(R,M),它可以容忍外源DNA分子进入体内并稳定地遗传给后代。)pUC19质粒DNA(浓度:10ng/l):购买或实验室自制设备:恒温摇床;电热恒温培养箱;台式高速离心机;无菌工作台;低温冰箱;恒温水浴锅;分光光度计;微量移液枪。,试剂1、LB固体和液体培养基LB培养基配方:(单位g/L)胰蛋白胨10酵母提取物5NaCl10琼脂(1.5%)15g(注:LB培养液不加琼脂)按配方称量药品,加入一定量的ddH2O后置电炉上加热熔解琼脂,待琼脂完全熔解后加入ddH2O定容至1000ml,用NaOH调节pH至7.0。121湿热高压灭菌20-30分钟,待冷却至60左右,在超静工作台中加入一定量的Amp储存液,使终浓度为100g/ml,摇匀后用培养皿铺板。,2、Amp母液:称取氨苄青霉素100mg溶于1mlddH2O中,0.22m滤器过滤除菌,用EP管分装后储存于-20冰箱.3、0.1mol/LCaCl2溶液:称0.56gCaCl2(无水分析纯),溶于50ml重蒸水中,定容至100ml,用0.22m滤器过滤除菌or高压灭菌。EP管分装于0冰箱储存.4、标准pUC19质粒:浓度10ng/l,操作步骤,(一)受体菌的培养1、70或20低温冰箱取出菌种后,在LB培养液中培养过夜,进行活化;2、取几微升活化后的菌液(取量视菌的密度而定)在LB平板上涂布,于37培养箱中培养24h;从LB平板上挑取单菌落,接种于3-5mlLB液体培养基中,37下振荡培养12小时左右,直至对数生长后期。3、将该菌悬液以1:100-1:50的比例接种于LB液体培养基中,37振荡培养2-3小时至OD6000.5左右(生长对数期)。(注:这一步非常关键。培养过度的菌液含有较多的“老”细胞,制备成感受态细胞后其接受外援DNA能力较低,从而导致转化率降低。),(二)、感受态细胞的制备(CaCl2法)1、将1.5ml菌液移入离心管中,冰上放置10分钟,然后于4下5000rpm离心5分钟。2、弃去上清(轻轻倾倒掉上清液,并用吸水纸或移液器移除残余的过多水分)。3、加入1ml预冷的0.1mol/L的CaCl2溶液,轻轻拨动管底使细胞完全悬浮,冰上放置15分钟后,4下5000rpm离心5分钟。3、弃去上清,加入0.2ml预冷的0.1mol/L的CaCl2溶液,轻轻悬浮细胞,即制成感受态细胞。将感受态细胞悬液分装成2份,每份100l(注意悬液密度要均匀)。冰上放置备用。4、暂时不用的感受态细胞可置于-80保存。,注:CaCl2处理后的细胞比较脆弱,尽量温柔操作!,(三)质粒pUC19的转化质粒和感受态细胞混和:分别在100l感受态细胞悬液中加入下列DNA质粒或水,轻轻摇匀后冰上放置30分钟。100l感受态细胞+pUC19质粒2l(含量不超过50ng,体积不超过10l)100l感受态细胞+无菌水2l(阴性对照)热击:42水浴中热击90秒(注:精确计算时间,过长将对细胞造成伤害),热击后立即置于冰上冷2-5分钟(禁止摇动)。复苏:向每管中加入400lLB液体培养基(注:不含Amp),混匀后37轻摇培养11.5小时,使细菌恢复正常生长状态,并表达质粒编码的抗生素抗性基因(Ampr)。,(四)涂布平板筛选转化质粒将上述2管培养液摇匀后取50l涂布于含Amp的筛选平板上。(注:1.将培养液摇匀后涂布;2.为了便于计算转化率,必须获得分散的、独立的菌落用于计数。所以涂布时尽量将50l的培养液均匀涂布于培养基的表面,使之尽量分散。)2.正面向上放置15分钟,待菌液完全被培养基吸收后倒置培养皿,37培养过夜。(室温下正面向上放置,19:00移入37培养箱,倒置培养过夜,第二天上午9-10点钟来计数菌落个数,并拍照;洗涤培养皿)(五)次日(12-14小时后)观察和计算转化率:观察记录转化情况并统计转化率。转化后在含抗生素的平板上长出的菌落即为转化子,根据此皿中的菌落数可计算出转化子总数和转化频率,公式如下:转化子总数该皿的菌落数稀释倍数(注:稀释倍数=涂布前总体积涂板用菌液体积)转化频率转化子总数质粒DNA加入量(g)(注:理想值可达51062107转化子/gDNA),统计转化率,转化后在含抗生素的平板上长出的菌落即为转化子,根据此皿中的菌落数可计算出转化子总数和转化频率,公式如下:转化子总数该皿的菌落数稀释倍数(注:稀释倍数=涂布前总体积涂板用菌液体积)转化频率转化子总数质粒DNA加入量(g)转化频率转化子总数0.02(g),预期实验结果,实验报告,计算转化率并根据转化率和阴性对照分析实验结果。思考题(1).根据本实验你认为影响转化率的因素有哪些?(2).如果实验中对照组本不该长出菌落的平板上长出了一些菌落,你将如何解释这种现象?,实验中要考虑的重要因素,为了提高转化效率,实验中要考虑以下几个重要因素:1.细胞生长状态和密度:不要用经过多次继代或储于的培养菌,最好从70或-20甘油保存的菌种中直接转接用于制备感受态细胞的菌液。细胞生长密度以刚进入对数生长期时为好,可通过监测培养液的OD600来控制。DH5菌株的OD600为0.5时,细胞密度在5107个/ml左右(不同的菌株情况有所不同),这时比较合适。密度过高或不足均会影响转化效率。,2.质粒的质量和浓度:用于转化的质粒DNA应主要是超螺旋态DNA(cccDNA)。转化效率与外源DNA的浓度在一定范围内成正比,但当加入的外源DNA的量过多或体积过大时,转化效率就会降低。1ng的cccDNA即可使50l的感受态细胞达到饱和。
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