分子生物学复习.ppt

分子生物复习，一、主要专业术语组蛋白：真核细胞染色体结构蛋白，2MNaCl包括可与DNA分离的H1、H2A、H2B、H3、H4。 c值(C-value):种生物单倍体基因组DNA的总量。 c值异常现象(C-valueparadox):真核生物包含大量未编码蛋白质的重复序列，高等生物的c值一般大于低等生物，并随着生物的演化而增加。 但两栖类c值大于哺乳动物，两栖类c值也大，相差100倍的现象是c值异常。 卫星DNA(satelliteDNA):真核生物染色体中的一些高度重复序列通常位于染色体着丝粒部位，也存在于染色体臂上，当该生物总DNA电泳时，这些DNA出现在主带以外的卫星带上，卫星DNA不转录，与染色体的稳定性有关。 微卫星DNA(mimisatelliteDNA):也称为可变串联重复序列(variablenumberoftandemrepeat，VNTR )，其是可通过杂交检测的多态性微卫星DNA(micro-satelliteDNA ) :重复单元序列最短，仅26bp，串联簇，长度50100bp，也称为短串联重复序列(ShortTandemRepeat，STR )。 广泛分布在基因组中。 富有A-T碱基对。 单核苷酸多态性(SNP):单核苷酸多态性。 串行重复序列多态性(tandemrepeatspolymorphism ) :是由于重复序列增加或减少而导致的DNA多态性。 端粒：真核生物线性基因组末端的特殊结构是DNA和蛋白质的复合体，其中DNA多为高度重复序列，稳定染色体DNA，决定细胞寿命。 DNA半保存复制：DNA在复制过程中，两条链之间的氢键断开，两条链分开，各自的链作为模板合成新的链，产生互补的双链，由此新合成的两个DNA与原DNA分子的碱基序列完全相同，各自的子DNA中的一个复制因子： DNA的复制单位是从复制起点到复制终点的DNA。 d环型(D-loop):是在动物线粒体DNA复制时发现的。 该复制双链的合成高度不对称，一链快速指导互补链的合成，另一链游离成单环(D-环)。 半不连续复制(DNA semidiscontinuousreplication ) :从DNA复制过程来看，由于一条新链的合成是连续的，另一条链的合成先合成较短的冈崎片段，再连接到连续的新链，因此该复制方式是半不连续复制。 错配修复-恢复错配的碱基切除修复(碱基切除修复、核苷酸切除修复)-切除突变的碱基或核苷酸，恢复破坏的DNA的重组修复-损伤的DNA先不复制，反而是部分复制等位基因后，取代损伤的DNA。 DNA直接修复酶催化嘧啶二聚体或甲基化DNASOS修复系统-DNA损伤后过多的单链修复，DNA转录(transposition):是通过可移位因子重新定位遗传物质的现象。 转位子(transposon，Tn):存在于染色体DNA上可自主复制和转移的基本单元中。 插入序列(insertionalsequence，IS ) :不含宿主基因的转位子插入特定基因时会引起突变。 复合式转录子：具有抗性基因或其他宿主基因的转录子，其两侧有两个相同或高同源性的IS序列。 两个IS插入某功能基因的两侧会产生复合的转位子，IS不能单独移动。 p转座子(Pelement):果蝇中的转座子之一，插入基因组中w部位可引起杂交后代不育。 p转子的两侧有31bp的倒置反复排列，插入靶部位时也会发生8bp的正方向反复排列。 p转座子包括4个外显子和3个内含子。启动子：位于基因5末端上游的DNA序列激活了RNA聚合酶，使其与DNA模板结合，从而导致转录开始。 识别后，启动子附近的DNA双链分离形成转录泡，核苷酸与模板DNA配对。 终结器：是位于基因3下游的DNA，当转录继续进行至此区域时，RNA聚合酶和模型分离，RNA链被释放，转录结束。 转印单元(transcritionunit):是从启动子到终结器的DNA序列。 RNAP从转录的起点开始转录，沿模板向终结器转录完RNA链。 转录起点：与新生RNA链的最初核苷酸对应的铸型链上的碱通常是嘌呤。 下降变异(downmutation ) :启动子内某碱基的变异使转录开始效率降低的现象。 上升变异(upmutation):启动子内某碱基变异提高转录开始效率的现象。 增强子：位于启动子以外的DNA序列中，可以增强或促进转录的开始，其增强活性随位置的变化而不变，促进RNAP与DNA的相互作用促进转录。 抗termination:转录过程中遇到终止信号后转录仍然继续的现象。 RNA剪接(RNAsplicing):从RNA前体分子中去除称为内含子的非编码区域，连接称作外显子的编码区域并转化为成熟RNA分子。 核不均匀RNA(hnRNA，heterogeneousnuclearRNA):真核基因的原始转录产物，即mRNA前体。 内含子转位切断：在高等生物中，内含子通常规则或组成性地从hnRNA中切除。 但是，在个体发育和细胞分化的特定时期，可以有选择地超越某个外显子和连接部位进行连接，产生组织和发育的特定阶段的mRNA。 RNA编辑(RNAediting):RNA，特别是mRNA的加工形式，引起DNA编码的遗传信息变化，RNA的序列随编辑而变化。 SD序列(Shine-Dalgarnosequence )或核糖体结合位点(ribosomebindingsite，RBS ) :在原核生物mRNA的起始密码子前含有7-12个核苷酸的维护区域与核糖体小分子单元中16SrRNA的3末端互补在mRNA-核糖体结合过程中，使核糖体(ribozyme):等具有催化功能的RNA分子发挥作用，通过催化RNA链中靶部位磷酸二酯键的断裂，特异性地切断RNA分子。 剪切核酶和剪切核酶密码子(codon):存在于mRNA中的3个邻近核苷酸的顺序是蛋白质合成中某些特定Aa的密码单元，密码子决定哪些Aa混入多肽链上的哪个位置。 转码突变(frameshiftmutation):基因插入或缺失一些核苷酸，转录后以突变的mRNA为模板合成蛋白质时，突变密码子以后的Aa序列全部变化。 “密码子兼容性”(codondegeneracy):是一种或多种密码子编码相同Aa的现象。 同义密码子(synonymouscodon):对应于同一Aa中的不同密码子。 像GGG、GGA、GGC、GGU这样，某个Aa的同义密码子越多，该Aa在蛋白质中出现的频率也越高。 同伴tRNA(isoacceptortRNA ) :具有相同Aa的不同tRNA。 同伴的tRNA结构相似。 无意义突变：基因内核苷酸突变使编码Aa的密码子突变为终止密码子，早期终止蛋白质合成，合成无功能或无意义的多肽。 错误的突变：基因内部核苷酸的突变使编码Aa的密码子突变成另一个编码Aa的密码子。 分子伴侣(molecularchaperone):当新合成的多肽折叠成功能蛋白质时，需要其他蛋白质分子参与，但这些蛋白质不是折叠蛋白质的一部分，而是帮助折叠其他蛋白质的蛋白质分子是分子伴侣。 泛素(ubiquitin ) :真核细胞中76Aa组成的蛋白质高度保守，与其他蛋白质结合，改变这些蛋白质的功能，诱导蛋白质进入蛋白酶体分解。Klenowfragment:DNA聚合酶I由枯草芽孢杆菌蛋白酶(subtilisin )切割而成的大片段具有DNA聚合酶和35外切酶的活性，缺乏53外切酶的活性。 受体细胞(competentcell):是以物理、化学方式处理，容易得到外来DNA的细胞。 核酸分子杂交(hybridizationofnucleicacids ) :具有互补序列的单链DNA或RNA混合退火时，其同源分段形成双链。 杂交分子(Hybridmolecular):不同来源的单链DNA或RNA分子退火形成的双链分子。 southern blot :用琼脂糖凝胶电泳分离酶切的DNA片段，碱改性后转移到固相支持体(NC膜)，用标记探针检测目标片段的位置的方法。 发明人： EdwinSouthern (英) norhernblotting(RNAT印迹):分子量不同的RNA被改性琼脂糖凝胶电泳分离，转移到固相支持体上，用特异探针检测目标RNA的位置的方法。 WesternBlotting (蛋白质印迹，免疫印迹)用SDS-PAGE分离：分子量不同的蛋白质，转移到固相支持体，用特异的抗体检测目标蛋白质的位置的方法。 South-westernblotting:蛋白质经PAGE分离转移到固相支持体上，用标记的双链DNA检测DNA结合蛋白质的方法。 North-westernblotting:蛋白在PAGE中分离并转移到固相支持体上，用标记的RNA检测RNA结合蛋白的方法。 聚合酶链反应(polymerasechainreaction，PCR ) :体外利用DNA快速扩增特定基因和DNA序列的方法。 一些循环分别包括改性、退火、拉伸三个阶段。 同义cSNP(synonymouscSNP):SNP的编码序列变化不影响翻译的蛋白质的氨基酸序列，突变碱和非突变碱的含义相同。 非定义csnp (non-synonymouscsnp ) : SNP对编码序列的改变会改变翻译的蛋白质的氨基酸序列，从而导致形质的改变。 具有单倍体(haplotype):的等位基因内多个snp的总和。 基因分型(genotyping):基因敲除(geneknock-out )，利用数据库中的SNP来研究特定群体的序列和发生频率，如基因芯片技术、Taqman技术、分子信标技术、焦磷酸测序技术等：又称基因靶，具有通过外源DNA和染色体DNA之间的同源重组，进行正确的定点修饰和基因改造，使基因失活，确定基因与性状的关系，特异性强，染色体DNA和外源DNA均稳定遗传等特点。 T-DNA(transferDNA):是Ti质粒上的DNA序列，该DNA进入植物细胞后被整合成植物基因组DNA，插入是随机的。 race (rapaddamplicationofcdnaends ) :是基于已知的部分cdna序列由PCR放大cdn 3或5侧的未知序列的技术。 分为5race和3race。 cDNA差异分析(representionaldifferenceanalysis，RDA):利用来自不同细胞的cDNA杂交，通过改变连接器和PCR技术扩增目标cDNA片段。 基因图位克隆(map-basedcloning):基于基因链接图确定一种表型基因的方法。 RFLP (restrictionfragmentlengthpolymorphism，受限片段多态性):生物个体间DNA的排列不同，被称为DNA多态性。 DNA序列的改变改变了DNA分子上限制性内切酶的酶切位点，从而改变了限制性内切酶切位点的长度和数量。 随机放大复用DNA (RAPD ) :是利用随机引物通过PCR从基因组中放大不同长度的DNA片段的技术。 染色体步行：长链DNA通过核酸内切酶部分切断，获得系列片段，克隆到载体，片段之间存在重复，因此可以将一个片段用作探针，检测其他片段，决定序列后将这些片段组合成一个连续的序列。基因表达系列分析技术(serialanalysisofgeneexpression，SAGE):是基于序列定量分析全基因组表达模式的技术，可直接读取任何种类(细胞或组织)的基因表达信息。 原位杂交(ISH):是一种利用标记的核酸探针将核酸定位在组织、细胞、间期核及染色体上并进行相对定量的手段。 分为RNA原位杂交和染色体原位杂交。 荧光原位杂交(FISH):是一种细胞遗传学技术，可用于核酸的检测和定位。 荧光素标记的核酸探针通过原位杂交，只能与高度相似的核酸杂交，可用于染色体上的基因定位。 定点突变(site-directedmutagenesis):通过改变基因内特定部位的核苷酸序列(1数个)来改变编码蛋白质的氨基酸序列，研究通常某氨基酸残基对蛋白质结构、催化活性及配体结合能力的影响RNA干扰(RNAi):利用双链小分子RNA高效特异性降解细胞内同源mRNA，阻断体内靶基因表达，使细胞出现靶基因缺失的表型技术。 DNA芯片(DNAchip):DNA微阵列技术(DNAmicroassay )，将大量已知或未知序列的DNA单链片段点滴在小玻璃片或尼龙薄膜上，通过物理吸附固定，芯片和待研究