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第六章方差分析,6.1方差分析的基本原理6.2单因素试验资料的方差分析6.3双因素试验资料的方差分析,t检验法适用于样本平均数与总体平均数及两样本平均数间的差异显著性检验,但在生产和科学研究中经常会遇到比较多个处理优劣的问题,即需进行多个平均数间的差异显著性检验。这时,若仍采用t检验法就不适宜了。这是因为:,第六章方差分析第一节基本原理,检验过程烦琐例如,一试验包含5个处理,采用t检验法要进行=10次两两平均数的差异显著性检验;若有k个处理,则要作k(k-1)/2次类似的检验。,第六章方差分析第一节基本原理,无统一的试验误差,误差估计的精确性和检验的灵敏性低对同一试验的多个处理进行比较时,应该有一个统一的试验误差的估计值。若用t检验法作两两比较,由于每次比较需计算一个,故使得各次比较误差的估计不统一,同时没有充分利用资料所提供的信息而使误差估计的精确性降低,从而降低检验的灵敏性。,第六章方差分析第一节基本原理,例如,试验有5个处理,每个处理重复6次,共有30个观测值。进行t检验时,每次只能利用两个处理共12个观测值估计试验误差,误差自由度为2(6-1)=10;若利用整个试验的30个观测值估计试验误差,显然估计的精确性高,且误差自由度为5(6-1)=25。可见,在用t检法进行检验时,由于估计误差的精确性低,误差自由度小,使检验的灵敏性降低,容易掩盖差异的显著性。,第六章方差分析第一节基本原理,第六章方差分析第一节基本原理,推断的可靠性低,检验的I型错误率大即使利用资料所提供的全部信息估计了试验误差,若用t检验法进行多个处理平均数间的差异显著性检验,由于没有考虑相互比较的两个平均数的秩次问题,因而会增大犯I型错误的概率,降低推断的可靠性。,由于上述原因,多个平均数的差异显著性检验不宜用t检验,须采用方差分析法。,这种方法是将k个处理的观测值作为一个整体看待,把观测值总变异的平方和及自由度分解为相应于不同变异来源的平方和及自由度,进而获得不同变异来源总体方差估计值;通过计算这些总体方差的估计值的适当比值,就能检验各样本所属总体平均数是否相等。“方差分析法是一种在若干能相互比较的资料组中,把产生变异的原因加以区分开来的方法与技术”,方差分析实质上是关于观测值变异原因的数量分析。,第六章方差分析第一节基本原理,方差分析的基本思想将测定数据的总变异(方差)分解为因素间的变异和因素内不同水平间的变异。通过比较因素在不同水平间的变异,分析不同水平的选取是否对测定结果产生影响。或者通过因素间的变异的比较分析各因素对分析结果产生的影响及因素间的交互作用。方差分析的目的是要确定是否存在影响测试结果的系统误差,即确定不同因素间或同一因素中不同水平间是否存在实质性的差异。,第六章方差分析第一节基本原理,一、方差分析概念,需要指出的是在方差分析中,假定所研究的对象都是服从正态分布的。这种假设显然未经证明,但考虑环境监测的测试结果受多种随机因素的影响,可以认为其总体的分布服从正态分布。此外,方差分析中假定各水平试验总体的方差都相等,尽管这些方差通常是未知的。,第六章方差分析第一节基本原理,一、方差分析概念,要将一个试验资料的总变异分解为各个变异来源的相应变异,首先必须将自由度和总平方和分解为各个变异来源的相应部分。自由度和平方和的分解是进行方差分析的第一步。,第六章方差分析第一节基本原理,二、自由度和平方和的分解,设A因素有k水平,分别记为A1、A2、A3、Ai、Ak,每个水平重复进行n次试验,总共进行了kn次试验,得到的试验结果为xij(i=1,2,k;j=1,2,n),如下表:,第六章方差分析第一节基本原理,表中表示第i个处理的第j个观测值(i=1,2,k;j=1,2,n);表示第i个处理n个观测值的和;表示全部观测值的总和;表示第i个处理的平均数;表示全部观测值的总平均数;,第六章方差分析第一节基本原理,表中全部观测值的总变异可以用总均方来度量。,第六章方差分析第一节基本原理,在表中,反映全部观测值总变异的总平方和是各观测值xij与总平均数的离均差平方和,记为SST称为总变异平方和,是描述所获得的全部数据离散程度的一个指标。即,第六章方差分析第一节基本原理,总平方和的剖分,SSe为每一水平下各试验结果与该水平下的均值之差的平方和的总和,称为误差平方和或组内平方和,反映随机误差的大小,每水平下的自由度df=n1。由于有k组资料,组内自由度dfe=k(n1)。,第六章方差分析第一节基本原理,总平方和的剖分,SSt为各水平均值与总均值之差的平方和,反映水平的改变对试验结果的影响,称为处理平方和或组间平方和。处理间的变异为k个的变异,其自由度dft=k1。,第六章方差分析第一节基本原理,总平方和的剖分,同样,上表的数据,自由度可分解为:(nk-1)=(k1)+k(n1)即:总自由度dfT=组间自由度dft+组内自由度dfe,第六章方差分析第一节基本原理,自由度的剖分,第六章方差分析第一节基本原理,三、计算方差,总方差,处理方差,误差方差,建立假设H0:1=2=k=,HA:1,2,k确定显著性水平:一般以=0.05或=0.01作为显著性水平。计算统计量F进行F检验和统计推断(1)如果F0.05,应接受H0,即各组间(或处理)的差异不显著。(2)如果F1,查出临界值F(dft,dfe):当FF0.05(dft,dfe)或FF0.01(dft,dfe),则H0发生的概率P0.05或0.01,接受H0,差异不显著;当FF0.05(dft,dfe)或FF0.01(dft,dfe),则H0发生的概率LSD,即在水平上差异显著;反之在水平上差异不显著。,建立假设H0:1=2=k=,HA:1,2,k确定显著性水平:一般以=0.05或=0.01作为显著性水平。根据误差方差及样本容量n(重复次数),计算平均数差数标准误:计算显著水平的最小显著差数(LSD)进行多重比较将处理平均数按大小顺序排列,以d表示两处理平均数的差数,如果dLSD,即为在水平上差异显著,否则不显著。,第六章方差分析第一节基本原理,LSD=,例2:有4个处理,平均数(cm)分别为=46,=48,=38,=36,样本容量n=4,误差方差=39.33,误差自由度dfe=12,试进行平均数间差异显著性比较。,第六章方差分析第一节基本原理,第六章方差分析第一节基本原理,五、多重比较,新复极差法最短显著极差法(SSR法)。,建立假设H0:1=2=k=,HA:1,2,k确定显著性水平:一般以=0.05或=0.01作为显著性水平。当样本容量n(重复次数),计算平均数差数标准误:计算显著水平的最小显著极差标准(LSR)根据所具自由度,查SSR表,得不同秩次距p时的SSR值,根据下列公式计算各p值的最小显著极差标准LSR值:LSR=秩次距p是所有比较的平均数按大小顺序排列所计算的两极差间包含的处理平均数个数。进行多重比较将各个平均数按大小顺序排列,以各p的LSR值判断各平均数间的差异显著性。,第六章方差分析第一节基本原理,例如有10个要相互比较,先将10个依其数值大小顺次排列,两极端平均数的差数(极差)的显著性,由其差数是否大于秩次距k=10时的最小显著极差决定(为显著,为不显著);而后是秩次距k=9的平均数的极差的显著性,则由极差是否大于k=9时的最小显著极差决定;直到任何两个相邻平均数的差数的显著性由这些差数是否大于秩次距k=2时的最小显著极差决定为止。因此,有k个平均数相互比较,就有k-1种秩次距(k,k-1,k-2,2),因而需求得k-1个最小显著极差(LSR,k),分别作为判断具有相应秩次距的平均数的极差是否显著的标准。,例2:有4个处理,平均数(cm)分别为=46,=48,=38,=36,样本容量n=4,误差方差=39.33,误差自由度dfe=12,试进行平均数间差异显著性比较。,第六章方差分析第一节基本原理,第六章方差分析第一节基本原理,五、多重比较,q检验法,q检验法是Trukey于1953年提出的,其方法原理与新复极差法相似,它们之间的区别在于计算最小显著极差标准值LSR时,不是查SSR值,而是查q值表,查出q值表后根据下式计算:,LSR=,一般地讲,一个试验资料,究竟采用哪一种多重比较方法,主要应根据否定一个正确的H0和接受一个不正确的H0的相对重要性来决定。如果否定正确的H0是事关重大或后果严重的,或对试验要求严格时,用q检验法较为妥当;如果接受一个不正确的H0是事关重大或后果严重的,则宜用新复极差法。生物试验中,由于试验误差较大,常采用新复极差法;F检验显著后,为了简便,也可采用LSD法。,第六章方差分析第一节基本原理,【例】以A、B、C、D4种肥料处理水稻,其中A为对照,每处理各得4个苗高的观察值(cm),其结果如下表所示,试分解其自由度和平方和。,下一张,主页,退出,上一张,第六章方差分析第一节基本原理,各平均数经多重比较后,应以简明的形式将结果表示出来,常用的表示方法有以下两种。1、三角形法此法是将多重比较结果直接标记在平均数多重比较表上,如表所示。此法的优点是简便直观,缺点是占的篇幅较大。2、标记字母法此法是先将各处理平均数由大到小自上而下排列;然后在最大平均数后标记字母a,并将该平均数与以下各平均数依次相比,凡差异不显著标记同一字母,直到某一个与其差异显著的平均数标记字母b;,第六章方差分析第一节基本原理,多重比较结果的表示法,再以标有字母b的平均数为标准,与上方比它大的各个平均数比较,凡差异不显著一律再加标b,直至显著为止;再以标记有字母b的最大平均数为标准,与下面各未标记字母的平均数相比,凡差异不显著,继续标记字母b,直至某一个与其差异显著的平均数标记c;如此重复下去,直至最小一个平均数被标记、比较完毕为止。这样,各平均数间凡有一个相同字母的即为差异不显著,凡无相同字母的即为差异显著。用小写拉丁字母表示显著水平=0.05,用大写拉丁字母表示显著水平=0.01。在利用字母标记法表示多重比较结果时,常在三角形法的基础上进行。此法的优点是占篇幅小,在科技文献中常见。,第六章方差分析第一节基本原理,第六章方差分析第一节基本原理,a,b,c,c,A,A,B,B,C,C,方差分析的基本步骤归纳如下:1、计算各项平方和与自由度;2、列出方差分析表,进行F检验;3、若F检验显著,则进行多重比较。多重比较的方法有最小显著差数法(LSD法)和最小显著极差法(LSR法:包括q检验法和新复极差法)。表示多重比较结果的方法有三角形法和标记字母法。,方差分析的基本步骤,第六章方差分析第一节基本原理,多重比较的选择:,(1)试验事先确定比较的标准,凡与对照相比较,或与预定要比较的对象比较,一般选LSD法。(2)根据否定一个正确H0和接受一个不正确的H0的相对重要性来决定:当k=2时,LSD法LSR法q法当k3时,LSD法LSR法q法(检验精度一个比一个高)故LSD法犯错误概率最大,q法最小。因此,对于试验结论事关重大或有严格要求时,宜用q法测验,q法可不经过F检验;一般试验采用LSR法、LSD法(该法有F检验保护)。农业试验采用LSR法的较多。,第六章方差分析第一节基本原理,按照一种变异方向进行分组的资料叫做单向分组资料。根据各处理内重复数是否相等,单因素试验资料的方差分析又分为重复数相等和重复数不等两种情况。,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,一、各处理重复数相等的方差分析【例】施用5种肥料1,2,3,4,5时,地下水中NO3N浓度见下表,试检验5种肥料对地下水NO3N影响的差异是否显著。水稻施肥盆栽试验的产量结果,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,这是一个单因素试验,k=5,n=5。现对此试验结果进行方差分析如下:(1)计算各项平方和与自由度,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,(2)列出方差分析表,进行F检验,下一张,主页,退出,上一张,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,表资料的方差分析表,(3)多重比较采用新复极差法,各处理平均数多重比较表下表,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,多重比较时的LSR值计算,表5种肥料对地下水NO3-N浓度的多重比较(SSR测验),第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,表5种肥料对地下水NO3-N浓度的多重比较(SSR测验),第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,二、各处理重复数不等的方差分析设处理数为k;各处理重复数为n1,n2,nk;试验观测值总数为N=ni。则,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,【例】在镉浓度为2mg/kg的土壤上种植大白菜,品种为5个,40天后,蔬菜叶片镉含量如下表所示。试比较品种间镉含量的差异。,表5个白菜品种叶片的镉含量,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,此例处理数k=5,各处理重复数不等。现对此试验结果进行方差分析如下:(1)计算各项平方和与自由度,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,(2)列出方差分析表,进行F检验临界F值为:F0.05(4,20)=2.87,F0.01(4,20)=4.43,因为品种间的F值5.99F0.01(3,24),P0.01,表明品种间差异极显著。,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,资料的方差分析表,(3)多重比较采用新复极差法,各处理平均数多重比较表见表。因为各处理重复数不等,应先计算出平均重复次数n0来代替标准误中的n,此例于是,标准误为:,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,(3)多重比较采用新复极差法,各处理平均数多重比较表下表,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,多重比较时的LSR值计算,表5个白菜品种叶片的镉含量多重比较(SSR测验),第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,第六章方差分析第二节单因素试验资料的方差分析,表5个白菜品种叶片的镉含量多重比较(SSR测验),两因素试验资料的方差分析是指对试验指标同时受到两个试验因素作用的试验资料的方差分析。设试验考察A、B两个因素A因素分a个水平B因素分b个水平试验因素A、B在试验中处于平等地位。试验单位分成ab个组,每组随机接受一种处理,因而试验数据也按两因素两方向分组。这种试验以各处理是单独观测值还是有重复观测值又分为两种类型。,第六章方差分析第三节双因素试验资料的方差分析,一、两因素单独观测值试验资料的方差分析对于A、B两个试验因素的全部ab个水平组合,每个水平组合只有一个观测值,全试验共有ab个观测值,其数据模式如下表,第六章方差分析第三节双因素试验资料的方差分析,第六章方差分析第三节双因素试验资料的方差分析,两因素单独观测值的试验:A因素

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