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文档简介
,第二部分,RT-PCR的原理,方法及琼脂糖凝胶电泳结果分析,RT-PCR技术背景,(1)基因的表达,(2)PCR技术,变性退火延伸,(3)逆转录酶和RT-PCR,RT-PCR技术目的,通过反转录(reversetranscription,RT)和聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)的方法,检测目的基因在特定组织或细胞中、mRNA水平的表达丰度,RT-PCR实验原理,m-RNA,c-DNA,PCR产物,RT(反转录),PCR,这里修改标题,RT-PCR实验原理,RT-PCR实验步骤提取总RNA,TRIzol法抽提总RNA1、细胞1107或组织100mg,加1mlTRIzol(细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块匀浆要彻底,后转至EP管)颠倒混匀10下,室温5分钟。2、氯仿1/5体积(0.2ml),颠倒混匀10下,室温5分钟。3、4,离心12000g,15分钟。4、转上层水相(约400l)于另一1.5mlEP管中,加等体积异丙醇(约400l),混匀室温10分钟。5、4,离心12000g,10分钟。6、弃上清,加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml。7、4离心7500g,5分钟。8、弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥),溶于DEPC水中至20l(可在55-60水中,10分钟助溶)。9、紫外分光光度计测总RNA浓度。,RT-PCR实验步骤反转录(RT),逆转录反应:1、RNA1-5g,加入适量的DEPC水至11lOligo(dT)151l混匀,离心,7010min。2、立即冰水浴。10XPCRbuffer2l25mMMgCl22l10mMdNTPmix1l0.1MDTT2L混匀,离心,4250min。3、9510min(破坏MLV,终止反应),4保存。,RT-PCR实验步骤聚合酶链反应(PCR),PCR反应:反应体系:总体积20l(50l)试剂浓度体积TaqBuffer10(5l_)dNTP10mM(0.5l)上游引物10pmol/l(1l)下游引物10pmol/l(1l)cDNA模板(1-10l)Taq酶2.5U/l(1l)DEPC水20l-4.3l混匀28-36循环,4保温,RT-PCR实验步骤琼脂糖凝胶电泳,加1-10lPCR产物与上样缓冲液(1-2.5l)混匀,加样,电泳。成像系统进行成像分析。,琼脂糖凝胶电泳结果分析,DNA分子中含有磷酸基和碱基,在生理条件下,磷酸基中的羟基发生解离,因此DN
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