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蛋白质的生物合成(翻译)蛋白质非osynthesis,Translation,第14章,蛋白质的生物合成,即翻译,通过遗传密码对核酸中四种核苷酸序列编码的遗传信息进行解码,从而解释为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序。蛋白质生物合成系统ProteinBiosynthesisSystem,第1节,参与蛋白质生物合成的物质包括三种RNAmRNA(messengerRNA,信使RNA)核糖核酸(rRNA)(核糖核酸,核糖蛋白RNA),即可从workspace页面中移除物件。原核细胞的多个结构基因通常以一个转录单位串联在一起,转录生成的mRNA可以编码多种功能相关的蛋白质,即多顺式反磁性(polycistron)。真核细胞mRNA只编码一种蛋白质,单个singlecistron。原核生物多顺位子,真核生物简单子,mRNA有遗传密码,mRNA分子从AUG开始,在5-3方向,每3个核苷酸分组,在肽链中决定氨基酸或蛋白质合成的开始、结束信号,这称为tripletcode。开始密码(initiationcodon):AUG,结束密码(terminationcodon):UAA,UAG,UGA,遗传密码表,mrna第5页开始密码子AUG中的第3页结束密码子,基因代码的特征,1。方向,mRNA分子中基因编码的读取方向为5 3,2。连续,在编码蛋白质氨基酸序列的每个三重体密码中连续读取,密码没有中断,没有交叉。基因转录后,由于特定碱基的插入、缺失或替代而导致mRNA的迁移代码、错误的突变或提前终止,有使同一mRNA前体翻译序列、功能不同的蛋白质的过程。这种基因表达的调节方式称为mRNA编辑。如果基因损伤导致mRNA读取框架内的碱基插入或缺失,就会发生框架移动突变。3 .退化,在遗传密码中,除Met,Trp外,其他氨基酸由两个或更多的密码子编码。同义密码子,但是每个密码子只对应一个氨基酸。其他物种对密码有“偏好”。4 .从原核生物到人类的共性,蛋白质生物合成的完整密码。发现了动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体等几个例外。密码的共性进一步证明了各种生物是从同一祖先进化而来的。5 .移动摆动性、氨基酸的tRNA的逆密码必须通过基本互补性与mRNA的遗传密码进行逆对,但在逆密码和密码之间不严格遵循一般的基本对规则,称为摆动对。U,U,摆动配对,密码子,反密码子配对的摆动现象,第二,核糖体由多肽链合成装置,12/56,构成,结构和功能特性:多个复杂精密的rRNA(约60%)和多种蛋白质组成rRNA是蛋白质维持RRNA功能领域的主导作用。12/56,核糖体的组成,原核翻译过程中核糖体结构模型,a位:氨基酰基位,p位:肽酰基位,E位:排出地,密码子tRNA抗密码子氨基酸是有序的位置。,氨基酸tRNA,氨基酰基-tRNA,(Amin acyl-tRNA synthetase),(a)氨基酸活化和氨基酰-tRNA合成酶,一步反应:酶找到相应的氨基酸,氨基酸ATP-。tRNA和酶结合模型、tRNA、氨基酰-tRNA合成酶、ATP、氨基酰-tRNA合成酶具有修饰活性。amineil-tRNA的表达:ala-trnalaser-trnasermt-tRNA Met,真核生物:Met-tRNAiMet原核生物:fMet-tRNAifMet,(蛋白质生物合成过程theprocessofproteneinbiosynthesis,第2节,整个翻译过程从阅读帧的5-AUG开始,以mRNA模板三重密码的顺序延伸肽链。多肽链的合成从n端到c端,直到出现终止密码。翻译的“开始”翻译的“结束”,第一,将mRNA和早期氨基酰基-tRNA与核糖体结合,翻译开始复合物(translationalinitiationcomplex)参与这个过程的各种蛋白质因子称为初始因子(if)。核糖体大小亚基分离mRNA在小亚基结合的起始氨基酰基-tRNA的结合形成70S起始配合物,(a)原核翻译开始过程,IF-3,IF-1,1。核糖体大小亚基分离,2.mRNA小亚基定位结合,S-D序列(Shine-Dalgarno,RBS),Rps(ribbosomap roteininsmallsubunit)将早期氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)连接到较小的子基,IF-3,IF-1,IF-2,GTP,GDP,Pi,4。核蛋白体大亚基结合,70S早期复合形成,原核多种早期因子(if)的生物学功能,IF-3结合30S小亚基,促进大小亚基分离;p位到结合开始提高trna敏感度,IF-2促进开始tRNA和30S较小的子标准结合,IF-1占用a位以防止其他tRNA的结合。防止大小亚基结合,(b)真核生物翻译开始过程,核糖体大小亚基分离开始氨基酰基-tRNA结合;mRNA和核糖体小个子键沿mRNA扫描寻找起点80S开始复合物形成,真核生物翻译开始复合物形成过程,原核核糖体小个子键中MRNA的定位为(1)S-D序列(Shine-Dalgarno,RBS) 将EIF-2的GDP与GTPeIF-3:前40S小亚基相结合,以促进大小亚基分离eIF-5:水解GTP,从核糖体中释放各种起始元素,以组合eIF-6:以大小子基促进核糖体分离,真核生物各种起始元素的生物学功能,EIF 起始Met-tRNAiMet不需要稠密化。2.eIF种类很多。3.小儿期先与Met-tRNAiMet结合,再与mRNA结合。5.ATP和GTP能源供应,4.mRNA和40s subunit的结合依赖于帽子结合蛋白(CBP)和mRNA帽子结构的认识结合。第二,肽链的延长是指在mRNA密码序列的指导下,将氨基酸从n端添加到c端,延伸肽链直到合成结束的过程。每个周期包括核糖体(ribosomalcycle)中肽链延长的连续循环,每个周期中氨基酸增加一个。,扩展过程所需的蛋白质因子(elongationfactor,EF)原核:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G真核:eEF-1,eEF,扩展因子EF-T催化进位(原核),tu,ts,GTP,GDP,tu,ts,GTP,目录,(b)肽(b),(c)转发,扩展因子EF-G具有转录酶活性,结合和水解单分子GTP,促进核糖体向mRNA的三面转移。fMet,fMet,真核生物肽链合成的延长过程与原核生物基本相似,但反应体系和延长因子不同。另外,真核细胞核糖体没有e字,转时卸载的tRNA直接脱离p字。(4)真核生物延长过程,肽链合成的延长因子,第三,翻译的结束在核糖体a位出现mRNA终止码时,多肽链合成停止,肽链从肽键-tRNA中释放,从mRNA,核糖体大型,小阿基等中分离,促进34/56,RF-3: RF-1或RF-2与核糖体的结合,诱导肽转移酶转变为酯酶活性,从核糖体中释放肽链,水解GTP。真核释放因子:eRF-1和eRF-3;ERF-1识别三种密码子类型,需要GTP。RF-1: uaa,uag,RF-2: uaa,UGA,终止相关的蛋白质因子,释放因子(releasefactor,RF),RF,原核肽链合成终止过程,39/氨基酸活化:2个ATP,2。翻译开始:1个原核生物1个GTP真核生物1个GTP,1个ATP,3个。翻译延长:1个肽键每组2个GTP,4个。翻译结束:1个GTP,ATP总消费量:2n 2(n-1) 2(真核3),n是多肽链氨基酸残基的数量,第3节,翻译后处理和蛋白质传递postranslational processing protein第一,多肽链折叠为天然功能结构蛋白质,新生肽链的折叠在肽链合成中,合成后完成,在核糖体中出现新生肽链n端后,肽链的折叠开始。随着序列的扩展,肽链可能逐渐折叠,形成正确的二次结构、母体和域,形成完整的空间结构。一般认为多肽链本身的氨基酸序列中蛋白质折叠的信息,即初级结构是空间结构的基础。细胞内大部分天然蛋白质折叠不是自动完成的,而是需要其他酶、蛋白质辅助物。促进蛋白质折叠功能的多种大分子,1。分子伴侣(molleular chaperon) 2。蛋白质二硫化物异构酶(proteeindisulfidasinomerase,PDI) 3。肽-蛋白酶-反式异构酶(PPI),(1)热冲击蛋白70 (heatshockproein,HSP70)家族HSP保护要折叠的多肽片段,释放和折叠这些片段等HSP70和多肽片段依次合并,形成分离回路的两个主要家族。,HSP40结合折叠多肽片段,HSP70-ATP复合物,HSP40-HSP70-ADP-多肽复合物,ATP水解,grpe,ATP,ADP,复合物离解,释放多肽,两种Cys的-SH脱h氧化,- shhs -,-,-,-,s-s-,鸦片皮质激素(POMC)的水解转化,(4)多蛋白质处理,(5),一些新蛋白质包含了切割等待时间的部分间隔,与hnRNA的内含子(称为inner)意思相似。第三,高级结构修饰,(a)蛋白质与糖、脂质、核酸、血红素等结合,形成
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