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.,1,AbriefintroductiontosimulationandvisualizationsoftwareLAMMPS、OVITO2017.10.20,.,2,1、Introductiontomoleculardynamics.2、WhatisLammps?3、CommandsofLammps.4、HowtousevisualizationsoftwareOVITO?,Reportcontent,.,3,AtomicdiffusionSurface,interface,defectCrystalgrowth,SolidphasetransitionMelting,solidification,amorphousformationMechanicalpropertiesPhonon,thermodynamicproperties,1.TheapplicationofMD,Reportcontent,.,4,2.MDPotentialfunction,Pairpotential:Lennard-Jones、Morse,Multiplebodypotential,EAM、Finnis-Sinclair,ExtendedFSSMA-TB、SmoothedSMA-TBJohnson、Mishin、Zhou,Considertheangleeffect,MEAM/2NN-MEAMStillinger-Weber、TersoffBond-Orderpotential,.,5,二、Lammps软件的基本介绍,Lammps?,Large-scaleAtomic/MolecularMassivelyParallelSimulator,Advantage:Freeopensourcecode;canbemodifiedaccordingtoneedtoexpandthecalculationprocess(C+)Simulatethesolid,liquid,gasstateSimulatemillionsofparticlesConvenientparallelcomputing,.,6,Atomiccreation:(Command:read_data,lattice,create-atoms,delete,replicate)ReadtheatomfromthefileCreatesanatominoneormorelatticesDelete,copy,replace,Output:(Command:dump,restart)Theposition,speed,acceleration,energy,pressureoftheatom,.,7,4.LAMMPSexample,SimulationofSolidificationofCubyEAMPotentialCu:Latticestructure:FCC,4atoms/cellLatticeconstant:3.615Construct666supercellcells,864atoms,lx=ly=lz=21.69,.,8,VisualizationofAtomicStructures:Ovito,Ovitointerface,.,9,输出数据文件,StepTemperaturePotentialenergyTotalenergyPressureVolume,Scriptfile,Calculationresultanalysis,.,10,Glasstransitiontemperature:Tg1000K,eV/atomJ/mol,p0,H=U+pVU,.,11,Meansquaredisplacement(MSD):,Forbinaryalloys,theself-diffusioncoefficientDAandDBareobtainedfromtheslopeoftheMSD.AccordingtoDarkenslaw,theinterdiffusioncoefficientis:Dalloy=xBDA+xADB,.,12,.,13,PDF:,Thesecondpeaksplitsintotwopeaks,usuallyasignofamorphousformation,.,14,Simulationprocess:,EnterthefileRunOutputresultsVisualizationResultanalysis,Lamm
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