医学数据统计处理及SAS软件的应用

医学数据统计处理及SAS软件的应用,主讲人：董光辉中国医科大学卫生统计教研室,.,SAS软件简介,SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件（SAS，SPSS和SYSTAT）之一，是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统，被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。以苛刻严格著称于世的美国FDA新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用SAS进行,其他软件的计算结果一律无效!哪怕只是简单的均数和标准差也不行!由此可见SAS的权威地位。2004年开始中国新药临床试验结果规定应用SAS软件分析。,.,SAS与SPSS比较,作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”，SPSS的功能是最弱的，但易用性排在所有统计软件之首。不过SPSS的易用性也极大的限制了它的功能和可扩展性。除了SPSS本身的菜单提供的功能，用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能，而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。,.,SAS全球专业认证,SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证，在欧美等国的职场上流行的一句话“IfyouhaveaSAScertification,Youwillneverloseyourjob”。销售模式：只租不售（每5年一个周期）财富500强中97%的企业都在使用SAS商业智能解决方案,.,.,2003年(301医院与军事医科院博士生）各统计软件使用情况,.,Pubmed检索SCI英文文献各统计软件使用情况,.,SAS软件功能,进行数据管理数据输入、建库、保存进行统计分析t检验方差分析卡方检验相关、回归秩和检验,.,SAS的安装,SAS8.12版本是windows操作系统下的32位软件，和其他windows系统下的软件安装方法类似。用鼠标左键双击光盘根目录下的setup图标，然后按照提示安装。,.,SAS的启动,单击开始菜单“程序”项。桌面上双击此快捷方式也可启动SAS。,.,执行开始菜单中程序单项【程序】【TheSASSystem】【TheSASSystemforWindows】,.,SAS退出,方式1：选择关闭按钮方式2：执行菜单命令【File】【Exit】方式3：在命令框执行BYE或ENDSAS命令,.,SAS窗口,PGM窗口（ProgramEditor)：提供编写SAS程序的文本编辑器LOG窗口：显示执行程序过程中的相关信息OUTPUT窗口：显示程序运行的结果命令窗口与探索者窗口,.,.,.,.,.,SAS程序的编写,一个完整的SAS程序一般由数据步（DATA步）和过程步（PROC步）两部分组成。DATA步以DATA语句开始，通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立SAS数据集。过程步以PROC语句开始，通过调用不同的分析模块来分析SAS数据集。,.,其它格式的数据库直接导入转换：excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk)等将数据读入系统，建立数据集（直接输入Editor窗口）。,SAS数据集建立,.,外部数据导入,例：有一批体检数据，包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量：均值、标准差、最大值、最小值。该数据以Excel.xls文件形式储存。文件名称：tijiandata.xls,.,.,.,.,.,.,.,.,探索者窗口,.,.,.,在Editor程序编辑窗口输入源程序,数据步：将数据读入系统，建立数据集:DATA语句开始,后面加上数据库的名字。INPUT语句描述数据变量,用$表示变量是字符型CARDS语句指示后面是数据,每行为一个观测数据，数据间无分号。数据最后以“；”开头的空行结束。每个语句都以“；”结束。,.,SAS程序数据步格式,Data；Input$.;Cards;.;,.,.,SAS过程步,对数据集中数据进行分析、处理。以PROC语句开始，调用SAS过程。每个语句都以“；”结束。整个程序最后要有RUN语句。,.,.,SAS程序的书写格式,不分大小写单个名称中不能空格，不同名称间必须空格一行可写多条语句，用分号分割一条语句可写多行数据行后不加分号，数据最后单独加分号行程序用“RUN；”语句结束,.,运行SAS程序,方式一：鼠标点击执行按钮方式二：按功能键“F8”方式三：执行菜单命令RunSubmit方式四：在命令框输入SUBMIT命令并执行,.,.,SAS程序实例,例子某学生上学期8门课程的分数分别为88，90，87，76，92，78，80，86。试用SAS编程求其平均分数。（1）在PGM窗口键入下列程序datafenshu;inputchengji;cards;8890877692788086;procmeans;varchengji;run;过程步,数据步,.,查看结果（output窗口）,AnalysisVariable:chengjiNMeanStdDevMinimumMaximum-884.62500005.878228676.000000092.0000000-从结果看出，该学生上学期8门课程的平均成绩为84.625。,.,查看运行过程及出错信息,激活LOG窗口(F6)黑色文字：源程序及运行情况蓝色文字：程序运行情况的说明信息红色文字：出错信息绿色文字：警告信息,.,.,保存SAS程序及其他窗口内容,激活相应窗口，然后选择：方式一：鼠标点击“存盘”工具按钮方式二：执行菜单命令【File】【Save】/【Saveas】可保存程序、数据文件、运行结果、日志等。SAS保存成纯文本格式文件（.txt)。,.,.,在SAS系统内打开已保存的文件,只能在ProgramEdit窗口打开文件，选择：方式一：鼠标点击“打开”工具按钮方式二：执行菜单命令【File】【Open】可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。,.,SAS程序主要关键词,means;(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm)univariatenormal;(正态性检验，均数是否为0的假设检验：参数与非参数检验）ttest;(两个样本均数比较的t检验）anova;(各样本含量相等的方差分析）glm;(各样本含量不等的方差分析）npar1way;(非参数检验）reg;(线性回归方程：单元或多元）corr;(线性相关：线性相关或秩相关）freq;(卡方、Fisher检验）logistic;(非线性回归）lifetest;(生存分析）,proc,.,定量资料的描述性分析,.,分析结果,.,定量资料的正态性检验,.,正态性检验结果,配对设计的t-test,为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同，随机抽取了10份乳酸饮料制品，分别采用哥特里-罗紫法和脂肪酸水解法测定其结果，问两种方法检测结果是否不同？,.,.,成组设计资料的t-test,采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症，试比较两种药物的疗效是否有差别,.,.,完全随机设计资料的方差分析（教科书73页）,.,.,方差齐性检验,.,.,.,.,.,.,四格表资料的2-test,某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷脂治疗脑血管疾病的疗效，将78例脑血管疾病患者随机分为两组，试比较两种药物的疗效,.,.,.,.