3bpindel论文关于CLIP3启动子区3bpindel论文范文参考资料

3bpindel论文关于CLIP3启动子区3bpindel论文范文参考资料 【摘要】目的：研究在中国徐州地区汉族人群中，CLIP3 基因远端启动子区的一个3-bp 插入/ 缺失多态性和结直肠癌（CRC）易感性的相关性。方法：应用基因测序方法检测450 例CRC 患者和799 例健康对照者插入/ 缺失基因型频率，并统计分析探讨其与CRC 的关联性。结果：选择的患者和健康对照组人群在性别、年龄、吸烟和饮酒情况方面的频率分布无显著性差异。基因分型结果显示：患者中插入/ 插入型(Ins/Ins) ，插入/ 缺失型(Ins/Del) 和缺失/ 缺失型(Del/Del) 基因型频率分别为0.358，0.558 和0.084，健康对照组分别为0.420，0.532 和0.048。基因型为Ins/Del 和Del/Del 的个体CRC 易感性明显增高（OR=1.20，95%CI: 1.01-1.56，P=0.09）（OR=1.80，95%CI: 1.20-2.35，P=0.001）。结论：CLIP3 基因启动子区3-bp 插入/ 缺失多态性与结直肠癌发生存在关联，这一结果对结直肠癌早期诊断具有重要意义。 【关键词】CLIP3 基因；插入/ 缺失多态性；结直肠癌 结直肠癌（CRC）是世界第三大最常见的癌症，其死亡率在恶性肿瘤中列第三位1，目前CRC 发病机制仍未完全揭示，现有研究发现其与遗传相关2。凋亡是基因调控的程序化细胞死亡，细胞增殖与细胞凋亡的比例决定肿瘤的生长。TNF- 信号途径是细胞凋亡的主要途径之一。在CRC 发生过程中，CLIP3 通过调控RIP1的泛素化参与激活TNF- 信号途径诱导细胞凋亡的发生3，因此CLIP3 与CRC 的关系逐渐成为目前研究的热点。本项目首次发现并提出了CLIP3 基因启动子区一个3-bp 插入/ 缺失多态性（rs372459950）和CRC 患病风险相关联，本研究对于CRC的预测和防治具有重要意义。本课题组调查了徐州市第二医院就诊的CRC 患者与健康对照体检人群的rs372459950，试探讨其与CRC 患病风险的相关度。 1 对象与方法 1.1 研究对象 CRC 患者450 例，男289 例，女161 例，年龄51.610.4 岁，无高血压、糖尿病、严重肝肾疾病及心肺功能不全史，收集xx年5 月至7 月在徐州市二院入院治疗的CRC 患者，患者符合我国卫生部xx 年关于结直肠癌的命名和诊断标准。健康对照799 例，选自健康体检人群的随机个体，男512 例，女287 例，年龄52.110.3 岁，无相关病史。受试对象为徐州地区本地人群、汉族并且没有血缘联系。 1.2 标本收集 各受试对象均抽取静脉全血1.5 mL，采用DNA 抽取试剂 (Qiagen) 从全血标本提取DNA 留用。 1.3 基因分型 基因分型采用基因测序的方法，抽提DNA 的样本送上海生工公司测序。测序结果比照NCBI SNP database 确定样本基因型，最终计数由不同二个实验者进行。 1.4 统计分析 采用X2 检验分析除年龄外临床资料各因素差别；年龄两组差别采用双侧t 检验；使用X2 检验分析受试两组的基因型和等位基因频率差别；遗传多态性与CRC 患病风险的相关度用逻辑回归分析进行分析，选取校正临床资料各因素后的比值比（OR）和95% 置信区间（CI）表示， P0.05 具有统计学意义。 2 结果 2.1 受试对象各组临床资料 450 例CRC 样本和799 例健康对照样本人口学资料情况比较（见表1），数据提示各临床资料间无明显差别（P0.05。 2.3 CLIP3 基因插入/ 缺失多态性频率分布研究中插入缺失多态的基因型及等位基因频率分布特点见表2，从表中可以看出，Del/Del 基因型频率在病例组中的频率为8.2%，而在正常对照组中的频率为4.8%，显然病例组中Del/Del 基因型频率高于正常对照组。 2.4 多态性与CRC 易感性分析 逻辑回归分析（校正各临床资料因素）结果表明：带有杂合子和缺失型纯合子的个体CRC 患病风险升高（OR=1.21，95%CI: 1.01-1.56，P=0.09）（OR=1.80，95%CI: 1.20-2.35，P=0.001）， 即在95%置信区间中，以插入型纯合子为对照，携带杂合子个体CRC 患病风险增加21%（P=0.09），携带缺失型纯合子个体CRC患病风险增加80%（P=0.001）。上述分析数据表明rs372459950 与CRC 患病风险显著关联，并且杂合子和缺失型纯合子促CRC 发生。 3 讨论 CLIP3 启动子区3-bp 插入/ 缺失多态有可能影响该启动子区活性，进而干扰CLIP3 基因的转录，从而来调控CLIP3 基因表达，而CLIP3 在调节TNF- 介导的细胞凋亡中起着重要的作用，然而，在目前的研究中我们仅发现了CLIP3 基因多态与CRC 的关联性，CLIP3 在CRC 发生过程中促癌还是抑癌还需要进一步的功能实验鉴定。 近年来的研究发现在多形性成胶质细胞瘤细胞中CLIP3 表达下降，患者的生存率明显下降。CLIP3 与spy1 作用，可以调节肿瘤抑制基因CYLD 的表达。到目前为止，尚无在CRC 中该调节通路被激活的相关报道，课题组猜测CLIP3 可能通过不依赖TNF- 介导的细胞凋亡途径进行调控，这种潜在的通路有待探索。 本论文是首次发现在中国汉族人群中CLIP3 基因启动子区域插入/ 缺失多态与CRC 易感性之间存在显著关联，但本次实验人力，物力，财力都有限，