甲基化整体解决方案

1、甲基化整体解决方案 DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一，真核生物中甲基化仅发生于胞嘧啶，即在DNA甲基化转移酶（DNMTs）的作用下的CpG二核苷酸5端的胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。DNA甲基化通常抑制基因表达，去甲基化则诱导了基因重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列的前提下实现对基因表达的调控。脊椎动物DNA甲基化状态与生长发育调控及生理状态密切相关，比如在肿瘤发生时，抑癌基因CpG岛以外的CpG序列非甲基化程度增加，CpG岛中的CpG则程高度的甲基化状态

2、，导致抑癌基因表达的下降。 原核生物中甲基化多发生在CCA/TGG和GATC序列；真核生物中DNA甲基化一般发生在CpG位点上；哺乳动物DNA甲基化只发生在CpG岛的胞嘧啶，植物甲基化发生在CpG和CpNpG。甲基化会使胞嘧啶转为5-甲基胞嘧啶，CpG位点在基因组是不常见的，主要密集于接近基因启动子的位置，统称为CpG岛。CpG位点的甲基化可以对基因表现有重要的影响。 哺乳动物中，CpG序列在基因组中出现的频率仅有1%，远低于的其它双核苷酸序列。但在基因组的某些区域中CpG序列密度很高，可以达均值的5倍以上即所谓的CpG岛。通常，CpG岛大约含有500多个碱基，位于基因的启动子区或第一个外显子

3、区。 在哺乳动物基因组中约有4万个CpG岛，而且只有CpG岛的胞嘧啶能够被甲基化。编号服务名称内容说明周 期价 格UBL101甲基化检测引物设计各种检测方法的引物设计2工作日￥300/对引物UBL102甲基化检测引物合成对设计好的引物进行合成，2OD1周￥60/对 引物长度小于30bp￥2.5/bp 引物长度大于30bpUBL103甲基化检测BSP克隆测序法设计合成引物、DNA质检、亚硫酸氢盐修饰、扩增、克隆、产物测序、分析报告4-8周询价UBL104甲基化检测HRM法设计合成引物、DNA质检、亚硫酸氢盐修饰、HRM PCR扩增检测、分析报告4-8周询价UBL105甲基化检测MSP法设计合成引

4、物、DNA质检、亚硫酸氢盐修饰、扩增、琼脂糖电泳检测、分析报告4-6周询价UBL106甲基化检测焦磷酸测序法设计合成引物、DNA质检、亚硫酸氢盐修饰、扩增、产物测序、分析报告8-10周询价成功案例： 中国农业科学院蔬菜花卉研究所、北京朝阳医院、哈尔滨医科大学、中国疾病预防控制中心、中国农业大学、北京协和医院、太原中心医院、第三军医大学、天津总医院、广东医学院附属医学院、宁夏医科大学、淮安市第二人民医院、江苏省人民医院、大连医学院附属第二医院、广东医学院病理教研室、医科院病原所、温州医学院、湖南南华大学、山东大学、中国医科大学附属第一医院、湖南湘雅医院等。甲基化研究思路：1. 寻找甲基化位点 1

5、) 甲基化二代测序寻找甲基化位点； 2) 对照组和实验组进行甲基化芯片检测，找到相关的甲基化位点； 3) 一些相关研究显示某些基因存在表达量降低的现象，可预测该基因是否存在CpG岛； 4) 根据文献寻找相关基因的甲基化位点。2. 验证甲基化位点，并进行甲基化程度分析 采用对照组和实验组样本进行甲基化验证。 1) MSP方法：可进行特定位点甲基化验证，适用于甲基化芯片后的结果，无法进行甲基化程度分析； 2) BSP克隆测序法：验证某些相关基因的甲基化位点，并计算出精确的甲基化程度百分比； 3) HRM法：适用于大批量样本甲基化验证，并能计算出甲基化程度范围； 4）焦磷酸测序法： 验证某些相关基因的甲基化位点，并计算出精确的甲基化程度百分比。3. 分析甲基化位点与研究的相关性 根据对照组和实验组样本的检测结果，分析与研究的相关性。 1) 比较对照组和实验组相同甲基化位点甲基化是否有差异； 2) 比对对照组合实验组相同基因启动子区甲基化程度是否有差异；4. 验证启动子发生甲基化的基因的表达量变化 采用荧光定量PCR的方法检测相关基因的表达量，如果表达量降低，可能由于启动子