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文档简介
1、第11章 建立一个序列本章解释了一个序列的功能,并描述了如何利用这个Sequence Editor序列编辑器来建立和编辑序列文件。学习到如下内容:页面:序列如何工作 How a Sequence Works 2利用序列编辑器 Using the Sequence Editor 4定义全局参数 Defining Global Parameters 12通过模板建立一个序列Building a Sequence by Template 13通过瓶号定位建立一个序列Building a Sequence Vial by Vial 18编辑序列电子表格Editing the Sequence Spre
2、adsheet 28从序列编辑器内部更改操作环境Changing Environments From Within the Sequence Editor 51建立一个来自文本文件的序列Building a Sequence from a Text File 54利用索引文件Using Index Files 61打印序列信息Printing Sequence Information 61序列如何工作 How a Sequence Works序列控制了TotalChrom中一系列进样产生的色谱数据的采集和分析。TotalChrom在一个电子表格中显示了序列信息,由一个或多个columns栏和r
3、ows行组成。栏是电子表格中纵向的元素,行是水平的部分。这些栏包含那些有关控制数据采集、处理和报告的参数。行可以指定一次分析或指定TotalChrom将要运行的一次程序。一次分析指定的行被归类为一个cycle循环。每个循环包含TotalChrom在采集和分析一次(或两次)进样产生的数据时需要的所有信息。一些仪器中,循环可能包含控制两次同时进样的信息。这些被称为dual injections双重进样。一次循环可以指定一个未知样品的一次校准或一次分析。如果这个循环指定了一次校准,TotalChrom利用运行中获得的数据来更新方法中的校准数据。如果这个循环显示的是一个未知样品的分析,TotalChr
4、om处理运行(采用以前校准的方法)中获得的数据来生成定量结果。TotalChrom如何利用一个序列 How TotalChrom Uses A Sequence一个序列能够让TotalChrom通过一系列进样需要的程序提供的所有信息来获取的数据。您可以采用一个自动进样器自动收集和分析数据,自动进样器可以被连接到一个900系列界面或一个LINK界面(Interface)上。有关连接自动进样器来实现不同程度自动化的信息,参见900系列界面的介绍手册。当您设定一个仪器运行一个序列时,TotalChrom下载这个方法(这些方法)的仪器参数部分到您正在使用的界面上。没有这些参数,界面就不能开始获取数据,
5、也不能运行一个LINK控制的仪器。当TotalChrom上载这些从每次运行界面上获得的数据时,它利用这个序列中的剩余参数和它的参考方法来进行处理。序列中的信息 The Information in a Sequence一个序列文件包含两种类型的信息,也涉及到如下这些参数: 用来识别一个特定分析样品的数值,如sample parameters样品参数。 影响TotalChrom如何处理和存储样品数据的信息,如processing parameters处理参数。两种类型的参数之间的主要区别是:对于两种通道(A和B)一些参数有不同的值;而对于两通道其它的必须是同样的值。为了显示这些差别,采用不同的颜
6、色编码Sequence Editor序列编辑器电子表格中的这些条目栏:黄色栏中必须有相同的值;蓝色栏中可以有不同的值。一个双重进样序列的这个特殊情形下,当然除(仪器)方法之外,两个通道中的所有参数可以不同。有关对Sequence spreadsheet序列电子表格中的这些栏的描述,参见第11章第6页。利用序列编辑器 Using the Sequence Editor您可以利用Sequence Editor序列编辑器来创建新的序列和修饰现存的序列。您可以通过下面的方式来创建新序列: 利用模板来建立一个新序列。 利用小瓶来建立一个新序列瓶号。 通过对其编辑和重命名来从现存的序列文件中建立一个新序列
7、。 从一个文本文件来建立一个新序列。 从一个SQL*LIMS工作列表来建立一个新序列(如果您有Connect联接的话;有关信息参见Connect联接文档)。您可以通过更改、添加或删除数据来修饰现存序列。序列编辑器中的菜单和命令 Menus and Commands in the Sequence Editor您可以从Sequence Editor序列编辑器菜单条中选择这些命令,您可以在一个快捷键菜单或工具栏随时显示您想显示的命令。这个Sequence Editor序列编辑器包含下列菜单:文件菜单 File Menu允许您来创建、打开、保存和打印序列文件;在打印之前预览一个序列文件;输入和查看有
8、关一个序列的文档;退出Sequence Editor序列编辑器。编辑菜单 Edit Menu允许您对序列文件编辑行,例如通过cutting剪切、copying复制、pasting粘贴和删除deleting它们来实现。您也可以复制和粘贴单元格模块,从外部电子表格应用程序中来复制数据或粘贴过去数据。更改菜单 Change Menu允许您对序列文件中的数值进行更改,例如用重复或增量值填充行。您也可以对文件名进行浏览;更改全局参数;创建样品备注和导入程序信息。创建菜单 Build Menu允许在当前序列中追加(添加)新循环;基于一个模板上追加循环;在当前序列中追加入另一个序列文件。Build menu
9、创建菜单也包含了那些允许您通过导入、添加或合并入一个文本文件创建一个序列的命令。格式菜单 Format Menu允许您隐藏和不隐藏栏;调整栏宽度;对通道A和B同步栏宽度;和对这个电子表格选择一种字体。操作菜单 Actions Menu用于切换到Setup启动项;在序列中再处理数据(利用这个Batch Reprocessing批再处理程序);切换到Method Editor方法编辑器,更改当前序列中引用的方法参数。视图菜单 View Menu用来显示和隐藏这个Sequence Editor序列编辑器工具条和Edit Bar编辑条。窗口底部的这个Status Bar状态条会显示关于这个序列的重要信
10、息和有关您选择的每个命令和工具条按钮的Help帮助信息。您不能隐藏Sequence Editor Status Bar序列编辑器状态条。如果您更改了当前序列的某一部分,状态条Status Bar也显示这个单词“Modified修饰过的”。序列电子表格 The Sequence SpreadsheetTotalChrom在电子表格格式中显示序列信息。通道A和通道B在独立的窗口出现。当一个仪器仅能收集一个单一通道的数据时,就仅一个电子表格出现。这个电子表格窗口有下列特征:编辑条Edit Bar显示当前选择的这个单元格中所有内容。您可以移动光标到这个编辑条,并在此处输入文本。在编辑条里输入的文本应该
11、是单元格中内容的真实反映,反之亦然。您不能利用这个编辑条编辑包含一个下拉式列表的单元格。栏标签Column Label用来识别这个栏的所有单元格中信息的类型。栏标签显示在电子表格每一栏顶部的抬头位置。在“Columns in the Spreadsheet电子表格中的栏”中对分栏有详细解释。行编号Row Numbers总是在电子表格的第一栏。因为一个电子表格可能包含比当前窗口中显示的还要多的行,行编号帮助您在这个电子表格中寻找您的位置。单元格Cell一行和一栏交叉形成的一个方框。一个单元格包含数据的一个条目:一个文本串,一个整数或者一个实数。在所给栏中的所有单元格包含相同类型的数据。黑色显示的
12、单元格不适用于当前行的上下文。视窗制表View Tab显示与这个制表相关联的栏。电子表格中的栏 Columns in the Spreadsheet一个序列电子表格由这部分列出的这些栏组成。以黄色背景显示的这些栏对两个通道必须有相同的值。蓝色背景显示的栏对每个通道可以有不同的值。对于一个双重进样序列,这个(仪器)方法栏仅是黄色栏。如果这个TotalChrom应用程序管理员已经指定这些栏仅可读,那么它们将是灰色背景显示,暗示不能编辑这些栏。类型Type定义一行的属性,哪一行是一个分析、一次校准、一个外部程序或一次清除(运行结束)。每个类型的描述遵循这个列表。研究名称Study Name这个分析研
13、究的名称。名称Name这个样品的名称。备注Note对某一行已经输入文本、程序或连续稀释信息时,这一行的备注栏会显示一个“X”。编号(样品编号)Number (Sample Number)这个样品的确认编号。位置(进样位置)Site (Injection Site)定位自动进样器在前进样口还是后进样口进样(仅用于LINK控制的气相色谱)。进样塔盘Rack当使用的是Varian瓦里安或Micromeritics自动进样器时,要进行进样的小瓶在进样盘上的编号。小瓶Vial这个用于样品的小瓶编号。方法Method在Global Parameters全局参数对话框中,如果您选择的是One Per Row
14、一行一个,TotalChrom将对这个仪器、处理和校准参数采用相同的方法。如果选择的是Multiple Per Row一行多个,会有下面这些栏出现,来替代Method方法栏:仪器方法Inst Method (Instrument Method)这个方法包含有仪器参数。处理方法Proc Method (Processing Method)这个方法包含这些处理参数。校准方法Calib Method (Calibration Method)这个方法包含了组分和校准参数。报告格式文件Rpt Fmt File (Report Format File)这个报告格式文件用于一行的要被打印的第一个报告。(您可
15、以在这个方法的处理部分指定附加的报告选项)数据文件Data File在Global Parameters全局参数对话框,如果您选择Same Name相同的名称,TotalChrom同时对原始和结果文件应用相同的基名称。如果您选择Separate Names独立名称,替代Data File数据文件出现的是下面这些栏:原始数据文件Raw Data File这个文件包含了原始数据。结果文件Result File这个文件包含了分析结果。当运行这个序列时,TotalChrom追加一个唯一的后缀在这个数据文件的基本名之后。校准报告Calib Rpt (Calibration Report)决定在打印一个校
16、准报告时,是否包含大量的细节内容。校准水平Cal Level这个校准水平的名称。更新保留时间Update RT (Retention Times)决定是设定这个校准为更新色谱峰保留时间数据还是保持原始数据。样品量Sample Amt进样样品中排除内标物的量之外的实际量。基于(校准)方法的设定上,这个值可作为校准标准的一个修正,和/或转换未知样品到已知浓度单位。内标物量Int Std Amt (Internal Standard Amount)样品中内标物组分的总量。样品体积Sample Vol (Sample Volume)进样的实际体积。稀释因子Dil Factor (Dilution Fa
17、ctor)这个值是指制备样品时稀释剂或水的量。乘数MultiplierTotalChrom用这个值乘以原始组分量来获得调整后的量。除数DivisorTotalChrom用原始组分量除以这个值来获得调整后的量。加数AddendTotalChrom将这个值添加到原始组分量上来获得调整后的量。一个负值是合法的。标准化因子Norm Factor (Normalization Factor)这个标准化因子用于报告标准化量和标准化面积。基线Baseline (Baseline File)这个数据文件(通常源自一个空白样品运行中)被用在原始样品文件扣除其来生成一个修饰后的文件。修饰后的文件Modified
18、(Modified File)这个文件包含修饰后的原始数据。打印机Printer打印机用来打印报告。有关默认值和其它打印机的信息请问您的应用程序管理员。绘图仪Plotter这个绘图仪用于重绘曲线(如果在方法中指定的话)的打印。有关默认值和其它打印机的信息请问您的应用程序管理员。样品编号(LIMS)Sample ID (LIMS)一个只读栏在SQL*LIMS系统中唯一地识别样品。任务编号(LIMS)Task ID (LIMS)唯一地识别在一个样品上运行的一个SQL*LIM测试。用户1到用户10 User 1 through User 10可提供10栏,被用于任何用户自定义的目的。类型栏条目 Ty
19、pe Column Entries在Type类型栏的每一单元格必须包含一个条目,用于或者决定TotalChrom如何分析数据,或者指定TotalChrom运行一个特定程序。在Type类型栏之间的输入值是Bracketed Calibration相等的(加括号的)校准循环类型。它们涉及采用一组样品之前或之后的标准来派生出用于量化样品的校准信息。一个单一序列可以包含多个水平等级(包含插入样品的成套校准标准)。TotalChrom不允许您插入相互冲突的校准类型。例如,如果您选择Cal:Grand Avg 校准:主要以平均值,所有其它的校准类型将从选择的列表中移除。请您从下列选项中,给Type类型栏选
20、择一个输入条目:样品Sample指明一个要被分析的未知样品。您的应用程序管理员可能定义与Sample样品功能方式相同的附加名称。校准:平均Cal:Average代表一次校准运行。TotalChrom将在方法校准部分的指定校准水平的平行测定信息中添加这些结果。这个结果校准将是所有平行测定的平均值。校准:替换Cal:Replace代表一次校准运行。TotalChrom将对指定校准水平下的组分以前的所有校准数据的结果进行替换。TotalChrom同时抹去已经存储的校准平行测定。校准:类别等级重叠Cal:Bracket-Overlapped等级校准的一种类型,在这里是对一组样品的校准最终设定,同样作为
21、下一组的第一个设定。校准:类别等级不重叠Cal:Bracket-NonOverlapped等级校准的一种类型,在这里是对每一组样品采用它自己的校准设定。标准在样品组之间被复制。校准:主要平均Cal:Grand Avg平均化序列中每个校准水平的所有取值,利用那个平均值来处理和报告所有样品。程序Program允许您在序列中运行一个用户程序。参见第11章“Including a User Program in a Sequence在序列中包含一个用户程序”。连续稀释Serial Dilution伴随LC 200系列自动进样器连续稀释功能使用。要获取更多信息,参见附录D“Serial Dilution
22、连续稀释”。空白Blank,添加Spike,标准检验Std Check,控制样本Ctrl Sample,精密度Precision,匹配度Suitability样品Sample的其它名称,用于指明某一个未知样品要被分析。(您的应用程序管理员可能对样品定义有其它额外的名称。)净化关闭Clnup-Shutdn促使仪器运行一部分方法。然而,不进样,不创建原始数据。如果有多重方法栏,您可以在仪器方法栏中仅指派一个方法的名称。GPC校准:平均GPCCal:Average和GPC校准:替换 GPCCAL:Replace随同可选择使用TurboSEC应用程序。在TotalChrom中,这些功能与样品类型类似。
23、更多信息参见TurboSEC文档。建立一个序列的通用步骤 General Procedure for Building a Sequence下面是有关创建一个新序列的通用步骤。关于这个步骤中涉及到的这些相关对话框的详细步骤在本章稍后的内容中提到。您也可以通过编辑现存的序列文件来创建一个新序列,然后用Save As另存为命令重命名保存。 创建一个新序列:1.请按照下列操作之一进行: 在Navigator浏览器上,从Build创建菜单中选择Sequence序列,或点击Sequence序列按钮,在Startup启动对话框中选择Create New Sequence创建新序列,然后选择OK。(您的应用
24、程序管理员有可能已经禁止了Startup启动对话框的显示) 如果Sequence Editor序列编辑器已经打开,从File文件菜单中选择New新建。2.填充完整这些被显示的对话框:Global Parameters全局参数和Sequence Template序列模板或Append New Cycles追加新循环或Sequence Worklist序列工作列表。关于完善这些对话框的相关介绍将在本章的稍后部分出现。(关于Sequence Worklist序列工作列表对话框的介绍在Connect连接文档中。)3. 当通道A和B中的电子表格窗口打开时,您可以编辑数据和更改电子表格的外观。参见第11章
25、的“Editing the Sequence Spreadsheet编辑序列电子表格”4. 当您完成序列开发时,从File文件菜单中选择Save保存。这个Documentation文档对话框打开。5.在Documentation文档对话框中完成Description tab描述制表,选择OK。有关输入一个文件的描述信息的详情,参见第2章“TotalChrom Basics TotalChrom基础知识”。“TotalChrom File Save As”TotalChrom文件另存为对话框打开。6.在File Name文件名称文本框里输入这个序列的一个名称,选择Save保存。这个对话框关闭,新
26、的序列名称在标题条上显示。7.当您完成Sequence Editor序列编辑器中的工作时,从File文件菜单中选择Exit退出。换句话说,您可以在Actions操作菜单中选择,直接切换到另一个应用程序。定义全局参数 Defining Global Parameters无论您何时创建一个新序列,您需要在Global Parameters全局参数对话框中输入信息。也可以利用这个对话框来对一个现存的序列更改全局参数。在Global Parameters全局参数对话框中有两个制表:Build Parameters制作参数和Configuration配置。每一个都会在后面一个单独的步骤中来描述。 对一个
27、新序列输入制作参数:1. 当您从Startup启动对话框中选择Create New Sequence创建新序列或从File文件菜单选择New新建时,Global Parameters全局参数对话框打开。2.如果您想现在对这个序列指定一个仪器,从Instrument仪器列表中选择或点击按钮,在Instrument Selection仪器选择对话框中进行选择。3.如果您的仪器含有一系列进样盘(tray),请选择您想用于这个序列的LC自动进样器进样盘。4.“Select From Template or Vial By Vial来自Template模板或通过小瓶定位选择”作为您想采用的Build制作
28、选项。如果您有Connect连接,您可以通过工作列表建立一个序列。有关信息参见您的Connect连接文档。 输入匹配参数:1. 在Configuration匹配制表上,选择与您的仪器和分析类型匹配的Injection Type to Single or Dual单个或双重进样类型。不要弄混淆了dual injection双重进样和dual channel双重通道。前者涉及到两个不同样品同时进样,而后者涉及到的是两个检测器的利用来模拟一个单一样品的分离。2.在Methods方法下,选择One Per Row一行一个或Multiple Per Row一行多个。当您选择One Per Row一行一个
29、时,将有一个方法栏,标记的是Method方法。您输入的这个方法名被用于采集、分析和组分信息中。当您选择Multiple Per Row一行多个时,将有三个方法栏,分别标记的是Instrument仪器,Process处理和Calibration校准。这允许您将一个不同的方法用于采集、分析和组分信息中。3.在Raw Data And Result Files原始数据和结果文件下,选择Same Name相同名称或Separate Names独立名称。当您选择Same Name相同名称时,这个相同的基本名称将同时用于原始和结果数据文件。当您选择Separate Name独立名称时,就要用不同的基本名称
30、用于原始和结果数据文件。4.选择OK。当您正在建立一个新序列时,TotalChrom会打开接下面提到的对话框: 如果您在Build Parameters制作参数表上选择From Template来自模板,TotalChrom就会打开Sequence Template序列模板对话框。对于双重进样序列,您必须对两个通道都完成Sequence Template序列模板。参见第11章“Building a Sequence by Template通过模板建立一个序列”。 如果您在Build Parameters制作参数表中选择的是通过Vial by Vial利用小瓶定位,TotalChrom就会打开A
31、ppend New Cycles追加新循环对话框。参见第11章“Building a Sequence Vial by Vial通过瓶位定位来建立一个序列”。 如果您在Build Parameters制作参数表中选择的是By Worklist通过工作列表,TotalChrom就会打开Sequence Worklist序列工作列表对话框。更多信息参见Connect连接文档。通过模板建立一个序列Building a Sequence by Template采用一个模板可以简化创建一个常规序列的步骤。这个模板允许您在一个单一操作中定义一个关于校准和样品放置的结构。这个模板保存无样品指定信息,例如样品
32、名称,您必须在电子表格中提供那个信息。当建立一个新序列,以及在Global Parameters全局参数对话框中选择From Template来自模板作为Build制作选项时,这个Sequence Template序列模板对话框打开。当您需要用Append New Template追加新模板命令,利用一个模板来添加样品到现存序列中时,您也可以采用这个对话框。 输入序列模板信息:1.如果您想在可选的Study研究文本框中识别这个正在执行的分析,输入任意一串文字数字组合式字符串。2.在Method方法文本框,输入或选择您想用于通道A的这个方法名称。3.对通道A输入一个基本文件名。您可以在此包含所有
33、数据路径,完成这个对话框后也可以在电子表格中添加它,或者输入或在设定过程中更改。这个基本文件名本身可包含80个字符。不要用一个数字来结束一个基准文件名,因为这将导致它被处理成一个循环数字。如果您必须输入一个数字,后面请跟一个合法的分隔符(例如,连字符或下划线_),但是不要采用句号 ( . )。TotalChrom对每个原始数据文件(.RAW)均创建一个结果文件(.RST)。您在此输入的这个基本文件名就会被用于命名这些文件,同时TotalChrom随后还会附加给它们一个三位数的循环编号(从001开始)。如果您一次运行超过一个序列时,TotalChrom会添加一个时间信息到文件名中,必要时来保持它
34、们的唯一性。您的应用程序管理员可能已经设定系统自动对所有文件附加一个时间信息。4.如果这是一个双通道序列,对通道B重复步骤2和3。您对通道A输入的这个方法决定了用于两个通道的仪器参数,因为对于这两个通道,仪器必须是相同的。如果您对通道B输入一个不同的方法,TotalChrom仅采用通道B中方法的处理和校准参数。5.如果您想运行一个校准标准来校准这个方法,选择Include Calibration Standards under Calibration在校准下包含校准标准。这个选项仅在下面这种情况下可用,那就是如果您指定的方法包含校准信息时。如果您选择Include Calibration St
35、andards包含校准标准,这个组框中的其它选项就可用。TotalChrom将对方法中定义的每一个校准水平创建一行,序列中的第一行将是校准水平。额外的行将基于您在# Samples Between Calibrations and Number of Samples校准和样品名称之间的样品编号文本框输入的内容上,输入到这个序列中。例如,如果您有4个校准水平和12个样品,同时您指出您想在校准水平之间穿插四个样品,那么这些校准标准将出现在第1至4,9至12,和17至20行上。6.从First Injection第一个进样列表中,选择您想采用的校准类型。这里定义了在序列里一系列标准中的每个标准第一次
36、进样上,TotalChrom将执行的校准类型。校准:替换Cal:Replace利用运行中获得的新数据来替代方法中现存的校准数据。校准:平均Cal:Average利用方法中现存的数据来平均化这个新校准数据。校准:等级重叠Cal:Bracket-Overlapped分类等级校准的一个类型,在这里,是对一组样品校准的最后设定,同样作为下一组的第一个校准设定。校准:等级不重叠Cal:Bracket Non-Overlapped分类等级校准的一个类型,在这个里,每一组样品都采用它们自己的系列校准来分析。样品组之间的标准被重复平行测定。这个等级校准类型涉及到采用这一组样品前后进样的标准样品生成的校准信息来
37、定量这些未知样品。一个单一序列可以包含多个等级(校准标准的系列插入在样品之间)。校准:主要平均Cal:Grand Avg平均化序列中的每个校准水平所有取值,利用那个平均值来处理和报告所有样品。7.在# Injections Per Calibration每个校准进样编号文本框中,输入您想对序列中每个校准包含的进样数量。8.如果您需要TotalChrom来对校准行输入样品编号,选择Assign Sample Numbers To Calibrations对校准指派样品编号。9.如果您选择Replace替换或Average平均化作为First Injection优先进样类型,同时对每个校准水平不只
38、进行一次进样,请从这些选项中选择Replicate Injections重复进样。这个定义了校准标准的每一个系列中,TotalChrom将如何对每个标准水平的重复进样进行处理。10.在# Samples Between Calibrations校准间的样品编号文本框中,输入一个值来定义校准标准在序列中出现的位置。当校准循环被插入时,TotalChrom会对方法中定义的每一个校准水平输入一行。11.在Samples样品下,输入一个Sample Number Pattern样品编号模式。这个样品编号模式是一个字母数字混合条目,用来定义样品编号的基本形式。采用字符来指明位置和样品编号中一个数字串的长
39、度。数字位数可以被定位在样品编号的任意地方。下面是一个合法模式例子:ABC#ABC2#ABC#XYZ仅采用磅字符的一套设定。例如ABC#DEF#的一种模式将给样品的编号形式是ABC01DEF#,因为仅第一个位置的字符可被数字更换。12.在Starting Number起始编号文本框,输入用于样品编号模式里第一个编号的数字。这个数字将随着序列中每个新样品的增加而增加。13.在样品的编号文本框,输入序列中被分析的样品总数目。TotalChrom采用这个值,按着# Samples Between Calibrations校准之间的样品编号条目,来确定在序列中的什么地方插入校准循环组。14.在# In
40、jections Per Sample每个样品进样编号文本框中,输入一个数字,来指明序列中每个样品包含多少次进样。15.在Autosampler自动进样器下,对序列中的第一个样品或校准标准输入Initial Vial Number初始小瓶编号。TotalChrom逐步增加后续样品编号。重复利用相同的小瓶编号。16.如果您正在采用一个可随意访问小瓶的自动进样器,选择选项All Calibrations From One Vial Set所有校准来自一个小瓶位置来对所有校准水平系列采用同一个瓶号。17.如果采用的是一个LINK控制的GC自动进样器,选择Injection Site进样口位置,选择是
41、采用前进样口还是后进样口。18.选择OK。19.如果这个序列是一个双重进样,请对通道B填写完整Sequence Template序列模板对话框。当您完成这个序列模板时,TotalChrom就建立了这个序列。要编辑这个序列,参见第11章“Editing the Sequence Spreadsheet编辑序列电子表格”。通过瓶号定位来建立一个序列Building a Sequence Vial by Vial您可以通过逐个定义每一个被分析样品来建立一个序列。这涉及到选择“vial by vial通过瓶号定位小瓶”建立这个序列。因为一次仅能添加一个样品,您可以包含样品指定信息。在Global Pa
42、rameters全局参数对话框中选择Vial By Vial通过小瓶定位作为Build建立选项,来建立一个新序列时,这个Append New Cycle追加新循环对话框打开。当采用Append New Cycles追加新循环命令添加循环到一个现存序列中时,您也可以利用这个对话框。在Append New Cycles追加新循环对话框中有四个制表。每一个我们都会进行分别描述。确认Identification用于样品数据和这个仪器方法。文件Files用于处理和数据参数。定量Quantitation用于样品评估。校准Calibration用于自动校准参数(仅可用于校准循环)这个Append New C
43、ycles追加新循环对话框包含下列命令按钮:添加Add应用数据到这个序列中,允许这个对话框打开。添加关闭Add + Close应用数据到这个序列,关闭对话框关闭Close不应用在最后一个Add添加中输入的数据,取消这个Append New Cycles追加新循环对话框。鉴别样品 Identifying the Sample在Append New Cycles追加新循环对话框中完成Identification确认制表来指定序列中用到的样品数据和仪器方法。这个Identification确认制表不同于单个和双重进样序列;参见有关对这个序列类型合适的步骤。不要混淆了dual injection双重进
44、样和dual channel双重通道。前者涉及的是两个不同样品同时进样,然而后者涉及的是利用两个检测器来模拟一个单一样品的分离。 对一个单一进样序列输入确认信息:1.在Append New Cycles追加新循环对话框的Identification确认制表上,从列表中对Type类型区域选择一个条目。2.如果一个样品不只进样一次,在# Of Cycles循环编号文本框输入一个循环的数字。当您正在创建一个新序列时,从对第一个进样循环(Cycle #1)添加数据开始。一旦您添加了每个循环,TotalChrom指派给它一个三位数的循环编号数字,从001开始,以1为增量来增加样品编号。这个循环编号数字被
45、添加到在数据采集过程中创建的原始数据和结果文件的基本文件名中。3.在Name名称文本框,输入要进样的样品的名称。4.在Number Pattern编号模式文本框,输入一个字母数字混合模式定义为这个样品编号的基本形式。用字符来指明一个数字串在样品编号中的位置和长度。数字位数被定位在样品编号中的任意位置。下面就是一个合法模式的例子:ABC#2#ABC#ABC#XYZ仅采用一套磅字符。一个形如ABC#DEF#的模式将这个形式ABC01DEF#的样品编号,因为仅第一套字符可被数字更换。5.在Actual Number实际编号文本框中,输入这个在样品编号中您想TotalChrom来采用的值。这个默认值是
46、下一个可得到的数字,序列中每一个新样品的这个值以1为增量而增加。6.在Study研究文本框中,输入这个样品属于的某项研究的名称。7.请您在Vial瓶位文本框中输入一个LINK控制的自动进样器来实施进样的小瓶位置编号。如果您没有一个LINK控制的自动进样器,这个编号数字仅是提示性的。默认值是下一个可获得的数字,您每次选择Add添加时,它将以1位增量而增加。8.如果必要的话,更改Rack样品架文本框中的这个值。9.如果您正在使用的是一个LINK控制的气相色谱,请选择合适的Injection Site进样位置。10.在这个(Instrument) Method(仪器)方法文本框里,输入或选择您要用到
47、的这个方法文件(包含仪器参数)的名称。这个信息是必需的,但是您可以输入一个当前不存在的方法名称,只要您在运行这个序列之前创建这个方法,path路径存在就可以了。 对一个双重进样序列输入确认信息:对于一个双重进样序列,您可以对每个通道输入不同的参数。1.在Append New Cycles追加新循环对话框的Identification确认制表中,对Type类型区域选择一个条目。您选择的这个类型将被用于这个两个通道。如果要对每个通道指定不同的类型,您可以随后编辑这个电子表格。如果采用的是一个不是样品或校准的类型,那么它必须显示用于两个通道。2.如果这个样品不只进样一次,在# Of Cycles循环
48、次数文本框输入循环的次数数字。当您正在创建一个新序列时,从对第一个进样循环(Cycle #1)添加数据开始。一旦您添加每一个循环,TotalChrom指派给它一个三位数字循环编号,从001开始,以1为增量来增加样品编号。这个循环编号被添加到数据采集过程中创建的原始数据和结果文件的基本名称中。3.在(Instrument) Method(仪器)方法文本框中,输入或选择您要用的这个方法文件(应该包含有仪器参数)的名称。您可以输入一个方法的名称,这个方法可以当前还不存在,只要在运行这个序列之前创建好它就可以。4.选择通道A或通道B。5.在Name名称文本框,输入要进样的样品的名称。6.在Number
49、 Pattern编号模式文本框,输入一个数字字母混合模式串来定义样品编号的基本形式。采用字符来指明样品编号中一个数字串的位置和长度。数字位数可被定位在样品编号的任何位置。下面是合法模式:ABC#2#ABC#ABC#XYZ仅采用一套磅标记符。一个形如ABC#DEF#的模式将这个形式ABC01DEF#的样品编号,因为仅第一套字符可增加。7.在Actual Number实际编号文本框,输入您想TotalChrom在样品编号中采用的值。这个默认值是下一个可得到的数字,它随着您每次选择Add添加以1为增量而增加。8.在Study研究文本框,输入这个样品所归属的研究名称。9.在Vial瓶位文本框中,从一个
50、LINK控制的自动进样器输入这个小瓶编号来实行这次进样。如果您没有一个LINK控制的自动进样器,这个编号就仅是提示性的。这个默认值是下一个可得到的数字,它随着您每次选择Add添加以1为增量而增加。10.如果需要的话,更改Rack架文本框中的这个数字。11.对其它的通道重复步骤5到10。指定文件信息 Specifying File Information在Append New Cycles追加新循环对话框中完成这些Files文件制表来定义处理和数据参数。 输入文件信息:1.在Append New Cycles追加新循环对话框的Files文件制表中,选择Channel A通道A或Channel B
51、通道B。2.在Processing and Calibration Method处理和校准方法文本对话框,输入或选择这些包含有您想采用的各种参数的方法的名字。只要方法路径存在,同时在运行序列之前创建这个方法,那么您就可以输入一个现在还不存在的方法的名称。如果您在Global Parameters全局参数对话框选择One Per Row每行一个,这些文本框将不再提供。3.在Report Format File报告格式文件文本框里,输入或选择要用于这个循环的报告格式文件的名称。4.在Raw Data File and Result File原始数据和结果文件文本框中,输入或选择您要对原始和结果文件
52、采用的独立的基本数据文件名称。或如果您在Global Parameters全局参数对话框选择的是Same Name相同名称,那么请在Data Files数据文件文本框输入或选择您想用于这两个文件的基本数据文件名称。您可以在此包含全部数据路径,完成这个对话框之后在电子表格中添加它,或者在设定过程中输入或更改它。这个基本文件名本身可包含80个字符。TotalChrom对每个原始数据文件(.RAW)创建一个结果文件(.RST)。在此输入的这个基本名称被用来命名这些文件,随后TotalChrom会追加给它们一个三位数的循环编号(从001开始)。如果您一次运行多个序列,TotalChrom还会追加一个时
53、间信息到文件名中,必要时确保它们名称是唯一的。您的应用程序管理员有可能已经设定您的系统自动对所有文件追加一个时间信息。5.可选择地,输入或选择您想从这个循环中采集的原始数据文件上扣除的Baseline File基线文件。6.如果您指定了一个Baseline基线文件名,输入Modified Data File修饰过的数据文件的名称来生成新文件。TotalChrom通过从有关这个循环的原始数据文件中减去基线文件来创建一个修饰后的文件。如果要创建一个修饰后的数据文件,TotalChrom会在这个文件中分析数据,而不是在原始数据文件中分析。您可以在相同的序列中采集一个数据文件,将它作为基线扣除。对第一
54、个进样,在Data File数据文件栏输入一个文件名,Baseline File基线文件栏则空着。对于第二个和往后的进样,指定这个Data File数据文件的文件名来指定作为Baseline File基线文件。7.如果您要对这个样品更改当前输出端口设定,请从Report Device报告设备和Plot Device绘图设备列表中选择新端口。8.如果需要的话,请对第二个通道重复这个步骤。指定定量值Specifying Quantitation Values在Append New Cycles追加新循环对话框中完成这个Quantitation定量制表来设定与样品量相关的参数。在这个制表上,您也可以
55、设定这个转换因子,TotalChrom利用这个转换因子来从原始量中计算出校准后的组分量。 输入定量信息:1.选择Append New Cycles追加新循环对话框中的Quantitation定量制表,选择Channel A通道A或Channel B通道B。对于一个单一进样序列,紧贴着项目栏的一个星号(*)指明了这个值将被送入到两个通道中。2.在Sample Amount样品量文本框中,输入所进样样品的实际量(不包含任何内标物的量)。基于方法中的设定,这个值可以被用来修正校准标准和得到未知样品中的已知浓度单位。 当样品量被用来校正校准标准时,您必须用与方法校准部分中用到的组分量相同的单位。TotalChrom如下计算这个修正因子: 式中:实际样品量是序列中的量条目输入值,预期样品量是指方法校准部分中的组分量的总值。通过乘以这个因子来修正方法中的每一个组分量的实际和预期量之间的任何区别。 当样品量被用来计算转换未知样品成浓度单位时,它就作为一个除数。3.在ISTD Amount ISTD量文本
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