第6讲-SciFinder(查文献、物质部分)ppt课件

1、SciFinder Web -文献、物质、反应检索,美国化学文摘（CA）网络版,导 航,Part I SciFinder背景介绍 Part II SciFinder Web的注册和登陆 Part III 检索技巧介绍 文献检索 物质检索 反应检索,Part I SciFinder 数据库背景,2009年 SciFinder Web全新登场,1907年,1987年,1995年,SciFinder 2007年,100多年来，全世界科学家和知识产权专家都依赖 CAS 来建立和维持来自化学及相关学科杂志和专利文献的最全面和权威的物质和参考文献数据,SciFinder背景介绍,SciFinder是美国化

2、学文摘的网络版数据库，由美国化学会下属的美国化学文摘服务社设计开发。 Scifinder平台整合了 Medline 医学数据库、欧洲和美国等63家专利机构的全文专利资料、以及化学文摘 1907 年至今的所有内容。 它涵盖的学科包括应用化学、分析化学、化学工程、普通化学、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学和农学等诸多领域。 是全世界资料量最大，最具权威的化学数据库，是化学化工、药学、生命科学等领域重要的信息检索工具,SciFinder的六大数据库,文摘数据库 CAplus （1万种期刊， 61个国家地区的专利，日更新） Medline （4800种生物医学期刊） 物质数据库 Registr

3、y Chemcats ChemList 反应数据库 CAS React,收录了 1907 年至今，以及部分 1907 年之前的上万种化学化工及相关学科期刊记录、全球 61家专利发行机构的专利（含专利族)、参考资料、 会议录、技术报告、图书、学位论文、评论、会议摘要 每日更新 内容和与印刷版和光盘版基本相同,CAplus（化学文摘数据库,Medline,美国国立医学图书馆出品 收录生命科学医学相关4800多种期刊文献、临床报告、 毒理、病理学报告 每周更新5次,CAS REGISTRY（化学物质数据库,世界上最大的物质数据库 （可用于物质的查新):包括5000万个 物质- 有机、无机、聚合物、混

4、合物;6100万个核酸蛋白质序列，即收录了所有有CAS Registry Number 物质的信息 每日更新,CASREACT（化学反应数据库,包含1840 年以来的有机化学期刊及专利中单步或多步反应记录:有机物反应、有机金属反应、无机反应、天然产品合成提取以及 生物转化反应信息 提供有关反应条件、产率和催化剂的信息 每周更新,CHEMCATS（化学物质供应商数据库,由 CAS 设立，是一个编目数据库,包括 约3400万条物质的商业信息 ，包括产品价格信息及其供应商联系信息 世界上最大的化学品商业数据库,CHEMLIST（管制化学品数据库,提供1979年至今的全球受管制化学品的信息，包括物质特

5、 征、详细目录、来源及许可信息 每种物质参考会提供该管制物质的国际机构、国家以及说明 每周添加 50 多种新物质或现有物质的附加记录到数据库 CHEMLIST通过物质查询间接获得,SciFinder Web中的内容,各信息相互连接的，只要通过一个检索信息，就可 以获得最为全面的的文献、物质、反应信息,SciFinder功能介绍及检索演示,获得好的想法与创意以及新知识点,检索理念,Scifinder 特色,全部记录经过人工编写（摘要、反应、） 更新速度快 提供文献、物质、反应两两之间的链接 提供多种途径的检索方式 提供强大的检索后处理方法 即时跟踪特定研究领域的全球最新科研状态 提供永久的信息分

6、享链接,Part II SciFinder Web的注册和登陆,注册 登录,图书馆主页,数据库资源列表,注册连接,注册指南,登录连接,数据库介绍页面,检索界面： 文献 检索（默认） 物质检索 反应检索,保存检索策略， 下为保存过的结 果列表；可以调出,文献检索 物质检索 反应检索,Part III 检索技巧介绍,检索界面：文献检索,文献检索途径,检索词输入框,限制条件设定区： 时间 文献类型 语种 作者 机构,主题检索输入要求,分析 检索要求，选择关键词， 需要注意的是最多输入5个关键词（3个左右最好），并且在词语之间使用介词表达检索主题。 用英文的介词of、with、by、beyond连接关

7、键词，不建议使用布尔逻辑符and（会漏检,例：纳米材料在医药中的应用 nanomaterial with pharmaceutical,主题检索: 纳米材料在医药中应用,输入 nanomaterial with pharmaceutical,可根据需要设定限制条件 ： 时间 文献类型 语种 作者 机构,主题检索的候选项（即输入词的不同的检索策略,as entered”：指与输入的检索短语完全一致 “Concept”表示做了同义词、近义词的扩展 “Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中 “were present anywhere in

8、the reference”表示同时出现在一段话中 优先选择同时包含“concept”和“Closely associated with one another,结果面,设定Email提醒：一旦有新的记录， 会发邮件通知，即时跟踪特定研究领 域的全球最新科研状态,保存检索策略,Remove duplicates去重,结果,注意：只显示=1 万条,才可进行结果的后处理，首先要利用工具TOOLS-remove duplicates去重,文献去重后结果面：最终获得1398篇有关纳米材料在医药中的研究文献,点击标题，查看详细信息， 主要：期刊与专利文献,红色标出的是检索输入词及近义词,摘要信息：如果原

9、文作者的摘要不足以反应全文内容，则摘要会被出版社专家重写,通过阅读 给出的文献摘要，我们可以迅速判断是否需要阅读全文，大大节省了查询文献的时间，可以帮助提高科研效率。同时不看全文也可以了解物质、反应、参考文献等,期刊文献的全文连接,一般期刊文献提供全文链接，若有全文提供通过系统的chemport自动连接到全文,如为一篇专利文献全文 -详细摘要,专利摘要页：还提供专利信息,专利文献全文,专利文献 自动连接专利局网站页面看全文,结果可以选择排序方式：比如：通过引文 排序，获得最有参考价值的文献,被引用次数,引文排序后结果面,文献太多，如何进一步挖掘信息,利用高级工具Analyze/Refine以及

10、Categorize 对文献结果集进行后处理操作,Analysis (分析工具）默认状态-按作者分析-结果按柱形图分布，比较直观,Analyze,来源期刊： 发现相关的学术期刊，快速定位投稿期刊,学科领域： 了解在不同学科的分布情况,出版年： 了解该领域的研究历史和发展,文献语种 ： 了解有关文献的语种分布情况,文献类型 ： 了解文献的种类,作者：发现本领域、课题的主要研究人员，以及同行评审专家,机构 :了解潜在的竞争者、合作伙伴,CAS No： 了解文献出现的物质及应用,索引词： 帮助分析该领域中文献的内容（帮助选择检索词,辅助索引词： 帮助分析该领域中文献的内容,数据库 分析是来自CAPL

11、US还是MEDLINE,一共11种分析工具,CA主要概念： 根据已制定的概念限定文献,如：通常对结果进行索引词分析，可以快速了解文献研究的主要内容，精选文献（文献过少时可以帮助规范关键词,列出10个研究最多的索引词 柱形图，点击show more 显 所有的,如：关注药物载体方面的应用,获得 药物载体应 用109篇,对文献结果集的后处理操作Refine限定工具,主题： 对初次结果用其它的主题再作二次检索,机构： 直接获得自己关心的机构的参考,作者： 直接获得自己关心的作者的参考,出版年： 直接获得自己关心的年份的参考,文献类型： 直接获得关心的文献类型,文献语种： 直接获得关心的语种的参考,来

12、源数据库： 可以限定文献的出处,7种Refine限定工具：选择一限定手段会相应出现限定输入或选择框,Categorize 系统分类功能：快速筛选不同学科的相关文献,选择一、二级目录,和二级目录有关的Index Term,药物传递系统316篇,获得相关物质和反应,工具条使用：点击相应图标实 现物质、反应、参考文献的连 接（任何界面下出现这些图标 都具有同样的功能,点击 物质信息：可以进行相关限定,结果面：列出选中文献中研究报道的物质-实现文献到物质的连接,点击 获取文献里报导的反应,反应结界面-实现文献到反应的链接,点击 获取被选文献引用情况 （扩大检索）：点击 Citing获得施引文献即被别人

13、引用-研究贡献；点击 Cited获得 被引用文献 即参考文献 - 研究基础,结果保存、打印、下载,注：存储名称均为英文 Save指保存在服务器上，10000，需要登陆SciFinder才能打开Export指保存在电脑中， 50，可以保存成rtf、pdf、txt文档多使用save功能，真正有用的信息再使用export功能,严禁超量下载,作者姓名检索,输入你知道的尽可能多的人名信息Last 姓：必须输入全称 First 名：只需输入首字母Middle中间名：可输入首字母或不输入 选择Look for alternative spellings of the last name来克服由于名字的变更或

14、者排版问题而导致的差异 对于复杂的人名，尝试不同的检索后，确定哪个会有最好的结果 当您不知道哪个是姓，哪个是名的时候，建议两种可能都尝试一下,作者名检索,举例：检索2011诺贝尔医学奖获得者拉尔夫斯坦曼 （ Ralph Marvin Steinman）课题组的文献,出现候选项,在列表中将所有符合条件的简称和全称都选上,结果面,存在同名同音现象,第一种：利用Analyze功能，通过机构名称来分析，选择作者工作或学习过的所有单位第二种：通过分析中的CA Section Title功能查看作者的研究领域通,公司名称和组织机构名检索,一次只能输入一个公司名称 一般来说，想获得宽泛的结果，输入的词语应该

15、少一些。想获得精确的结果，应该输入多的词语。词条输入越多，可以让检索变得更加精确 自动的考虑了不同的拼写，首字母缩写，缩写，以及有关的词条，但是并不考虑合并和收购 自动检索了一系列的有关词条，比方说，输入Company和Co，得到的结果一致,文献识别界面 Document Identifier,期刊 界面 Journal,专利 界面 Patent,文献检索总结,文献检索有多种检索途径：关键词、作者姓名、组织机构名、文章标识、期刊、专利、书签 多个关键词间用介词连接，一般输入35个为宜 从文献摘要中获取有用信息 文献检索信息量较大，要多用后处理功能进行缩小 可以通过Analyze/Refine功

16、能来不断的修正我们的检索思路Categorize 系统分类功能快速筛选不同学科的相关文献 可以通过Analyze/Refine功能来缩小检索的范围 可以通过Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵感 尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益 通过Get Related来扩大检索获得更多的信息 （参考文献、施引文献,导 航,Part III 检索技巧介绍 物质检索,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. Al

17、l rights reserved,物质检索界面,71,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,检索途径： 结构式检索 Markush检索 分子式检索 物质标示符检索,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,物质标示符检索,

18、72,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,如输入物质的CAS号50-78-2；或 名称：Aspirin或Acetylsalicylic acid ，检索结果相同,通过输入 物质的各种名称（化学名称、通用名、俗名、商品名）或CAS号 来进行检索该物质相关信息检索,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 Americ

19、an Chemical Society. All rights reserved,物质标示符检索结果,73,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,快速获得图谱、实验性质,点击获取物质详细信息,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights rese

20、rved,物质详细信息包括,物质的CAS号、分子式、结构式、 化学名、别名,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,按照CAS Role分类的专利、非专利文献列表。 对某类文献感兴趣，仅需点击交叉处的 即 可方便快捷地获取,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society.

21、All rights reserved,物质的生物活性信息（点击字段才显示,靶点标记信息（点击字段才显示,物质的生物活性信息和靶点标记信息，有助于进行物质的后期 研究开发,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,77,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All

22、 rights reserved,预测数据,物质图谱信息,实验数据,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,物质标示符检索结果,78,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,一键获得: 文献、 反应、 商品信息、 管制信息,

23、快速获得图谱、实验性质,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,点击-文献,研究文献：物质到文献的连接,或点击-文献,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,出现对文献分类的选择框，选择研究方向-实现物质到文献的连接如：该物

24、质制备方面的文献(选择，点击get获取文献,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,点击获取 反应,实现物质到反应的连接,或点击 获取反应,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,获取反应：可以设定该物质参与反应的角色,产物

25、 反应物 试剂 反应物或试剂 催化剂 溶剂 任何一角色,结果：获133条合成反应,每条反应 信息包括： 反应物、步骤、试剂 等反应条件以及报道 的参考文献,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,参与反应的物质信息（任何时候出现结构图都可以实现,在SciFinder中，鼠标滑过物质，可以打开物质的标准菜单，通过标准菜单，可以获得和物质有关的所有内容,CAS is a division of the Ameri

26、can Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,物质基本信息: 详细信息 进行结构检索 合成该物质 反应检索 商业信息检索 （或点击红锥形瓶获取商业信息） 管制信息,物质的标准菜单,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,商业信息:供货商的信息、规格,CAS is a division of

27、 the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,管制信息,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,管制信息,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemic

28、al Society. All rights reserved,结构式检索：通过 结构式找物质,90,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,点击出现绘制窗口,CAS is a div

29、ision of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,94,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,SciFinder结构绘制工具,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 201

30、1 American Chemical Society. All rights reserved,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,96,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,SciFinder结构绘制工具,在绘制窗

31、口绘制出已知结构，进行精确结构检索,绘制的图形会返回到Java界面：精确结构检索,98,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,提前设置检索条件,或在此进行结构检索选择： 精确结构检索； 亚结构检索； 相似结构检索,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All

32、rights reserved,精确结构检索界面,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,精确结构检索结果：精确结构获取物质的本身，盐，混合物，聚合物等,100,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,盐,混合物,CAS i

33、s a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,亚结构检索,101,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,单一组分物质,有机物质,CAS is a division of the American Chemical Society. Cop

34、yright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,亚结构检索界面,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,亚结构检索结果,103,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights re

35、served,亚结构检索： 获得包含该母核结构的所有物质,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,亚结构检索界面-可以对物质进行分析与限定,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,物质分析工具（与文献、反应不同），提炼物质,

36、生物活性标识分析 商业品来源信息分析 元素分析 反应分析 物质职能分析 靶向标识分析,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,物质限定工具（与文献、反应不同），筛选物质,结构再次限定 同位素限定 金属包含限定 是否有商业品来源信息限定 性质限定 物性参数限定 是否提供参考文献限定 原子修饰限定,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyri

37、ght 2011 American Chemical Society. All rights reserved,相似结构检索,107,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,单一组分物质,有机物质,相似结构检索-对精确结构检索和亚结构检索的补充,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemica

38、l Society. All rights reserved,相似结构检索候选项,相似度越高， 结构越相似,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,选择相似度选项,CAS is a d

39、ivision of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,相似结构检索结果界面,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,相似结构检索结果包含,111,CAS is a division of the American Chemical Society. Copy

40、right 2011 American Chemical Society. All rights reserved,母核结构发生变化,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,结构检索小结,精确结构检索： 获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等，母体结构不能修改，不能修饰 亚结构检索： 所画的结构必须存在，母体结构不能修改，但可以被修饰 相似结构检索： 相似度越高结构越相似，母体结构可以修改，也可以被修饰，用相似度来控制获得的结果,112,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2011 American Chemical Society. All rights reserved,CAS is a division of the American Chemical Society. Copyr